RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511907.1

CTBP1-211, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTBP1, Length 900 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-211ENST00000511907 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.91■■■■■ 5.26
CTBP1-211ENST00000511907 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.86■■■■■ 4.45
CTBP1-211ENST00000511907 ABCC9O60706 1549 aa42.46■■■■■ 4.39
CTBP1-211ENST00000511907 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.58■■■■■ 4.09
CTBP1-211ENST00000511907 NACADO15069 1562 aa40.37■■■■■ 4.05
CTBP1-211ENST00000511907 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.3■■■■■ 4.04
CTBP1-211ENST00000511907 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.9■■■■□ 3.98
CTBP1-211ENST00000511907 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
CTBP1-211ENST00000511907 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.78■■■■□ 3.96
CTBP1-211ENST00000511907 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.57■■■■□ 3.93
CTBP1-211ENST00000511907 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.56■■■■□ 3.92
CTBP1-211ENST00000511907 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.41■■■■□ 3.9
CTBP1-211ENST00000511907 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.39■■■■□ 3.9
CTBP1-211ENST00000511907 SCRIBQ14160 1630 aa39.13■■■■□ 3.85
CTBP1-211ENST00000511907 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.83■■■■□ 3.81
CTBP1-211ENST00000511907 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
CTBP1-211ENST00000511907 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.39■■■■□ 3.74
CTBP1-211ENST00000511907 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.18■■■■□ 3.7
CTBP1-211ENST00000511907 SMARCA4P51532 1647 aa37.34■■■■□ 3.57
CTBP1-211ENST00000511907 NCAPD3P42695 1498 aa37.23■■■■□ 3.55
CTBP1-211ENST00000511907 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.21■■■■□ 3.55
CTBP1-211ENST00000511907 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
CTBP1-211ENST00000511907 SMARCA2P51531 1590 aa37.14■■■■□ 3.54
CTBP1-211ENST00000511907 HMGXB3Q12766 1538 aa37.04■■■■□ 3.52
CTBP1-211ENST00000511907 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.95■■■■□ 3.51
CTBP1-211ENST00000511907 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.91■■■■□ 3.5
CTBP1-211ENST00000511907 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
CTBP1-211ENST00000511907 ERCC6Q03468 1493 aa36.62■■■■□ 3.45
CTBP1-211ENST00000511907 NESP48681 1621 aa36.6■■■■□ 3.45
CTBP1-211ENST00000511907 WIZO95785 1651 aa36.58■■■■□ 3.45
CTBP1-211ENST00000511907 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.39■■■■□ 3.42
CTBP1-211ENST00000511907 CUX2O14529 1486 aa36.37■■■■□ 3.41
CTBP1-211ENST00000511907 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
CTBP1-211ENST00000511907 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.21■■■■□ 3.39
CTBP1-211ENST00000511907 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.17■■■■□ 3.38
CTBP1-211ENST00000511907 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.14■■■■□ 3.38
CTBP1-211ENST00000511907 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.12■■■■□ 3.37
CTBP1-211ENST00000511907 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.09■■■■□ 3.37
CTBP1-211ENST00000511907 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.85■■■■□ 3.33
CTBP1-211ENST00000511907 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.82■■■■□ 3.32
CTBP1-211ENST00000511907 CFTRP13569 1480 aa35.81■■■■□ 3.32
CTBP1-211ENST00000511907 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.77■■■■□ 3.32
CTBP1-211ENST00000511907 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.76■■■■□ 3.32
CTBP1-211ENST00000511907 WDR62O43379 1518 aa35.73■■■■□ 3.31
CTBP1-211ENST00000511907 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.67■■■■□ 3.3
CTBP1-211ENST00000511907 PRDM2Q13029 1718 aa35.63■■■■□ 3.29
CTBP1-211ENST00000511907 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
CTBP1-211ENST00000511907 TOPBP1Q92547 1522 aa35.14■■■■□ 3.22
CTBP1-211ENST00000511907 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.06■■■■□ 3.2
CTBP1-211ENST00000511907 ABCC8Q09428 1581 aa35.04■■■■□ 3.2
CTBP1-211ENST00000511907 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
CTBP1-211ENST00000511907 IFT140Q96RY7 1462 aa35.02■■■■□ 3.2
CTBP1-211ENST00000511907 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
CTBP1-211ENST00000511907 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.83■■■■□ 3.17
CTBP1-211ENST00000511907 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
CTBP1-211ENST00000511907 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
CTBP1-211ENST00000511907 OSCARQ8IYS5 282 aa34.76■■■■□ 3.16
CTBP1-211ENST00000511907 CUX1P39880 1505 aa34.7■■■■□ 3.14
CTBP1-211ENST00000511907 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.69■■■■□ 3.14
CTBP1-211ENST00000511907 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.68■■■■□ 3.143e-7■■■■■ 29.2
CTBP1-211ENST00000511907 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.66■■■■□ 3.14
CTBP1-211ENST00000511907 SOGA1O94964 1423 aa34.63■■■■□ 3.13
CTBP1-211ENST00000511907 TRIM41Q8WV44 630 aa34.54■■■■□ 3.12
CTBP1-211ENST00000511907 CHD1O14646 1710 aa34.53■■■■□ 3.12
CTBP1-211ENST00000511907 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
CTBP1-211ENST00000511907 WDR97A6NE52 1622 aa34.45■■■■□ 3.11
CTBP1-211ENST00000511907 FBLN2P98095 1184 aa34.38■■■■□ 3.09
CTBP1-211ENST00000511907 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.37■■■■□ 3.09
CTBP1-211ENST00000511907 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.37■■■■□ 3.09
CTBP1-211ENST00000511907 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.37■■■■□ 3.09
CTBP1-211ENST00000511907 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.36■■■■□ 3.09
CTBP1-211ENST00000511907 PBRM1Q86U86 1689 aa34.3■■■■□ 3.08
CTBP1-211ENST00000511907 GRIN2BQ13224 1484 aa34.28■■■■□ 3.08
CTBP1-211ENST00000511907 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.28■■■■□ 3.08
CTBP1-211ENST00000511907 ARHGEF11O15085 1522 aa34.26■■■■□ 3.08
CTBP1-211ENST00000511907 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.26■■■■□ 3.08
CTBP1-211ENST00000511907 SYNJ1O43426 1573 aa34.26■■■■□ 3.07
CTBP1-211ENST00000511907 TOP2BQ02880 1626 aa34.26■■■■□ 3.07
CTBP1-211ENST00000511907 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.25■■■■□ 3.07
CTBP1-211ENST00000511907 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
CTBP1-211ENST00000511907 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.24■■■■□ 3.07
CTBP1-211ENST00000511907 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.22■■■■□ 3.07
CTBP1-211ENST00000511907 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
CTBP1-211ENST00000511907 SYNJ2O15056 1496 aa34.13■■■■□ 3.05
CTBP1-211ENST00000511907 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.06■■■■□ 3.04
CTBP1-211ENST00000511907 ARAP1Q96P48 1450 aa33.95■■■■□ 3.03
CTBP1-211ENST00000511907 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.95■■■■□ 3.03
CTBP1-211ENST00000511907 ADAMTS12P58397 1594 aa33.94■■■■□ 3.02
CTBP1-211ENST00000511907 GRIN2AQ12879 1464 aa33.86■■■■□ 3.01
CTBP1-211ENST00000511907 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.84■■■■□ 3.01
CTBP1-211ENST00000511907 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.79■■■■□ 3
CTBP1-211ENST00000511907 CEP170Q5SW79 1584 aa33.76■■■□□ 2.99
CTBP1-211ENST00000511907 NUP160Q12769 1436 aa33.7■■■□□ 2.99
CTBP1-211ENST00000511907 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.6■■■□□ 2.97
CTBP1-211ENST00000511907 SHROOM2Q13796 1616 aa33.56■■■□□ 2.96
CTBP1-211ENST00000511907 KIF27Q86VH2 1401 aa33.55■■■□□ 2.96
CTBP1-211ENST00000511907 CUL7Q14999 1698 aa33.48■■■□□ 2.95
CTBP1-211ENST00000511907 IGF1RP08069 1367 aa33.47■■■□□ 2.95
CTBP1-211ENST00000511907 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
CTBP1-211ENST00000511907 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.45■■■□□ 2.95
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