RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511722.5

AFF1-208, Transcript of AF4/FMR2 family member 1, human

TSL 4

Gene AFF1, Length 638 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFF1-208	ENST00000511722	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45.01	■■■■■ 4.8
AFF1-208	ENST00000511722	ABCC9	O60706	1549 aa		40.27	■■■■■ 4.04
AFF1-208	ENST00000511722	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		40.23	■■■■■ 4.03
AFF1-208	ENST00000511722	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		38.27	■■■■□ 3.72
AFF1-208	ENST00000511722	NACAD	O15069	1562 aa		38.04	■■■■□ 3.68
AFF1-208	ENST00000511722	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.99	■■■■□ 3.67
AFF1-208	ENST00000511722	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		37.78	■■■■□ 3.64
AFF1-208	ENST00000511722	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.57	■■■■□ 3.6
AFF1-208	ENST00000511722	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		37.55	■■■■□ 3.6
AFF1-208	ENST00000511722	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		37.41	■■■■□ 3.58
AFF1-208	ENST00000511722	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	37.33	■■■■□ 3.57
AFF1-208	ENST00000511722	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		37.25	■■■■□ 3.55
AFF1-208	ENST00000511722	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.12	■■■■□ 3.53
AFF1-208	ENST00000511722	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.77	■■■■□ 3.48
AFF1-208	ENST00000511722	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.62	■■■■□ 3.45
AFF1-208	ENST00000511722	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		36.34	■■■■□ 3.41
AFF1-208	ENST00000511722	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	36.29	■■■■□ 3.4
AFF1-208	ENST00000511722	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		36.24	■■■■□ 3.39
AFF1-208	ENST00000511722	NCAPD3	P42695	1498 aa		35.17	■■■■□ 3.22
AFF1-208	ENST00000511722	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		35.1	■■■■□ 3.21
AFF1-208	ENST00000511722	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.06	■■■■□ 3.2
AFF1-208	ENST00000511722	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.93	■■■■□ 3.18
AFF1-208	ENST00000511722	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	34.88	■■■■□ 3.17
AFF1-208	ENST00000511722	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.88	■■■■□ 3.17
AFF1-208	ENST00000511722	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.74	■■■■□ 3.15
AFF1-208	ENST00000511722	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.73	■■■■□ 3.15
AFF1-208	ENST00000511722	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.71	■■■■□ 3.15
AFF1-208	ENST00000511722	ERCC6	Q03468	1493 aa		34.7	■■■■□ 3.15
AFF1-208	ENST00000511722	NES	P48681	1621 aa		34.66	■■■■□ 3.14
AFF1-208	ENST00000511722	CUX2	O14529	1486 aa		34.57	■■■■□ 3.12
AFF1-208	ENST00000511722	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		34.5	■■■■□ 3.11
AFF1-208	ENST00000511722	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		34.3	■■■■□ 3.08
AFF1-208	ENST00000511722	WIZ	O95785	1651 aa		34.28	■■■■□ 3.08
AFF1-208	ENST00000511722	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	34.21	■■■■□ 3.07
AFF1-208	ENST00000511722	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		34.13	■■■■□ 3.05
AFF1-208	ENST00000511722	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		34.12	■■■■□ 3.05
AFF1-208	ENST00000511722	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		34.11	■■■■□ 3.05
AFF1-208	ENST00000511722	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	34.05	■■■■□ 3.04
AFF1-208	ENST00000511722	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.84	■■■■□ 3.01
AFF1-208	ENST00000511722	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	33.83	■■■■□ 3.01
AFF1-208	ENST00000511722	WDR62	O43379	1518 aa		33.76	■■■■□ 3
AFF1-208	ENST00000511722	CFTR	P13569	1480 aa		33.76	■■■□□ 2.99
AFF1-208	ENST00000511722	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.73	■■■□□ 2.99
AFF1-208	ENST00000511722	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.72	■■■□□ 2.99
AFF1-208	ENST00000511722	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		33.5	■■■□□ 2.95
AFF1-208	ENST00000511722	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
AFF1-208	ENST00000511722	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.28	■■■□□ 2.92
AFF1-208	ENST00000511722	TOPBP1	Q92547	1522 aa		33.11	■■■□□ 2.89
AFF1-208	ENST00000511722	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.89
AFF1-208	ENST00000511722	TRIM41	Q8WV44	630 aa		33.06	■■■□□ 2.88
AFF1-208	ENST00000511722	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		33.05	■■■□□ 2.88
AFF1-208	ENST00000511722	IFT140	Q96RY7	1462 aa		33.05	■■■□□ 2.88
AFF1-208	ENST00000511722	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.96	■■■□□ 2.87
AFF1-208	ENST00000511722	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.95	■■■□□ 2.86
AFF1-208	ENST00000511722	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
AFF1-208	ENST00000511722	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
AFF1-208	ENST00000511722	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.79	■■■□□ 2.84	1e-6	■■■■■ 26.9
AFF1-208	ENST00000511722	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
AFF1-208	ENST00000511722	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.72	■■■□□ 2.83
AFF1-208	ENST00000511722	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
AFF1-208	ENST00000511722	SOGA1	O94964	1423 aa		32.63	■■■□□ 2.81
AFF1-208	ENST00000511722	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.61	■■■□□ 2.81
AFF1-208	ENST00000511722	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.61	■■■□□ 2.81
AFF1-208	ENST00000511722	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.61	■■■□□ 2.81
AFF1-208	ENST00000511722	CUX1	P39880	1505 aa		32.61	■■■□□ 2.81
AFF1-208	ENST00000511722	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
AFF1-208	ENST00000511722	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.6	■■■□□ 2.81
AFF1-208	ENST00000511722	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.53	■■■□□ 2.8
AFF1-208	ENST00000511722	CHD1	O14646	1710 aa		32.52	■■■□□ 2.8
AFF1-208	ENST00000511722	FBLN2	P98095	1184 aa		32.52	■■■□□ 2.8
AFF1-208	ENST00000511722	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
AFF1-208	ENST00000511722	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.42	■■■□□ 2.78
AFF1-208	ENST00000511722	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.36	■■■□□ 2.77
AFF1-208	ENST00000511722	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		32.32	■■■□□ 2.76
AFF1-208	ENST00000511722	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.31	■■■□□ 2.76
AFF1-208	ENST00000511722	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
AFF1-208	ENST00000511722	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
AFF1-208	ENST00000511722	ARAP1	Q96P48	1450 aa		32.24	■■■□□ 2.75
AFF1-208	ENST00000511722	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.23	■■■□□ 2.75
AFF1-208	ENST00000511722	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.21	■■■□□ 2.75
AFF1-208	ENST00000511722	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.2	■■■□□ 2.74
AFF1-208	ENST00000511722	SYNJ2	O15056	1496 aa		32.19	■■■□□ 2.74
AFF1-208	ENST00000511722	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.15	■■■□□ 2.74
AFF1-208	ENST00000511722	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.15	■■■□□ 2.74
AFF1-208	ENST00000511722	SYNJ1	O43426	1573 aa		32.12	■■■□□ 2.73
AFF1-208	ENST00000511722	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	32.09	■■■□□ 2.73
AFF1-208	ENST00000511722	TOP2B	Q02880	1626 aa		32.06	■■■□□ 2.72
AFF1-208	ENST00000511722	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		32.04	■■■□□ 2.72
AFF1-208	ENST00000511722	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.91	■■■□□ 2.7
AFF1-208	ENST00000511722	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.9	■■■□□ 2.7
AFF1-208	ENST00000511722	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
AFF1-208	ENST00000511722	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.81	■■■□□ 2.68
AFF1-208	ENST00000511722	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.81	■■■□□ 2.68
AFF1-208	ENST00000511722	NUP160	Q12769	1436 aa		31.81	■■■□□ 2.68
AFF1-208	ENST00000511722	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.78	■■■□□ 2.68
AFF1-208	ENST00000511722	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.78	■■■□□ 2.68
AFF1-208	ENST00000511722	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.62	■■■□□ 2.65
AFF1-208	ENST00000511722	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
AFF1-208	ENST00000511722	IGF1R	P08069	1367 aa		31.49	■■■□□ 2.63
AFF1-208	ENST00000511722	JPH4	Q96JJ6	628 aa		31.49	■■■□□ 2.63

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