RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511575.1

HOXC10-202, Transcript of homeobox C10, humanhuman

TSL 2

Gene HOXC10, Length 887 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10-202ENST00000511575 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.64■■■■■ 4.26
HOXC10-202ENST00000511575 ABCC9O60706 1549 aa38.12■■■■□ 3.69
HOXC10-202ENST00000511575 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.55■■■■□ 3.6
HOXC10-202ENST00000511575 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.14■■■■□ 3.38
HOXC10-202ENST00000511575 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.04■■■■□ 3.36
HOXC10-202ENST00000511575 NACADO15069 1562 aa35.66■■■■□ 3.3
HOXC10-202ENST00000511575 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.57■■■■□ 3.28
HOXC10-202ENST00000511575 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.45■■■■□ 3.27
HOXC10-202ENST00000511575 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.13■■■■□ 3.21
HOXC10-202ENST00000511575 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.96■■■■□ 3.19
HOXC10-202ENST00000511575 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.92■■■■□ 3.18
HOXC10-202ENST00000511575 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.45■■■■□ 3.1
HOXC10-202ENST00000511575 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
HOXC10-202ENST00000511575 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.39■■■■□ 3.1
HOXC10-202ENST00000511575 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.36■■■■□ 3.09
HOXC10-202ENST00000511575 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.33■■■■□ 3.09
HOXC10-202ENST00000511575 SCRIBQ14160 1630 aa34.25■■■■□ 3.07
HOXC10-202ENST00000511575 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
HOXC10-202ENST00000511575 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.59■■■□□ 2.97
HOXC10-202ENST00000511575 CUX2O14529 1486 aa33.03■■■□□ 2.88
HOXC10-202ENST00000511575 ERCC6Q03468 1493 aa32.99■■■□□ 2.87
HOXC10-202ENST00000511575 NCAPD3P42695 1498 aa32.92■■■□□ 2.86
HOXC10-202ENST00000511575 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.76■■■□□ 2.84
HOXC10-202ENST00000511575 SMARCA2P51531 1590 aa32.66■■■□□ 2.82
HOXC10-202ENST00000511575 HMGXB3Q12766 1538 aa32.61■■■□□ 2.81
HOXC10-202ENST00000511575 SMARCA4P51532 1647 aa32.59■■■□□ 2.81
HOXC10-202ENST00000511575 NESP48681 1621 aa32.57■■■□□ 2.8
HOXC10-202ENST00000511575 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.45■■■□□ 2.79
HOXC10-202ENST00000511575 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
HOXC10-202ENST00000511575 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
HOXC10-202ENST00000511575 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXC10-202ENST00000511575 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXC10-202ENST00000511575 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.16■■■□□ 2.74
HOXC10-202ENST00000511575 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.11■■■□□ 2.73
HOXC10-202ENST00000511575 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.08■■■□□ 2.73
HOXC10-202ENST00000511575 TRIM41Q8WV44 630 aa32.02■■■□□ 2.72
HOXC10-202ENST00000511575 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.94■■■□□ 2.7
HOXC10-202ENST00000511575 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.87■■■□□ 2.69
HOXC10-202ENST00000511575 WDR62O43379 1518 aa31.76■■■□□ 2.68
HOXC10-202ENST00000511575 WIZO95785 1651 aa31.67■■■□□ 2.66
HOXC10-202ENST00000511575 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.66■■■□□ 2.66
HOXC10-202ENST00000511575 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.57■■■□□ 2.64
HOXC10-202ENST00000511575 OSCARQ8IYS5 282 aa31.52■■■□□ 2.64
HOXC10-202ENST00000511575 CFTRP13569 1480 aa31.43■■■□□ 2.62
HOXC10-202ENST00000511575 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
HOXC10-202ENST00000511575 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
HOXC10-202ENST00000511575 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.24■■■□□ 2.59
HOXC10-202ENST00000511575 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.07■■■□□ 2.56
HOXC10-202ENST00000511575 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.07■■■□□ 2.56
HOXC10-202ENST00000511575 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.07■■■□□ 2.56
HOXC10-202ENST00000511575 IFT140Q96RY7 1462 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXC10-202ENST00000511575 PRDM2Q13029 1718 aa31.04■■■□□ 2.56
HOXC10-202ENST00000511575 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
HOXC10-202ENST00000511575 ARHGEF11O15085 1522 aa30.93■■■□□ 2.54
HOXC10-202ENST00000511575 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.91■■■□□ 2.54
HOXC10-202ENST00000511575 TOPBP1Q92547 1522 aa30.89■■■□□ 2.54
HOXC10-202ENST00000511575 ABCC8Q09428 1581 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXC10-202ENST00000511575 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXC10-202ENST00000511575 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
HOXC10-202ENST00000511575 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.74■■■□□ 2.51
HOXC10-202ENST00000511575 FBLN2P98095 1184 aa30.72■■■□□ 2.51
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HOXC10-202ENST00000511575 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.7■■■□□ 2.5
HOXC10-202ENST00000511575 CHD1O14646 1710 aa30.67■■■□□ 2.5
HOXC10-202ENST00000511575 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
HOXC10-202ENST00000511575 ARAP1Q96P48 1450 aa30.59■■■□□ 2.49
HOXC10-202ENST00000511575 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
HOXC10-202ENST00000511575 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.46■■■□□ 2.47
HOXC10-202ENST00000511575 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
HOXC10-202ENST00000511575 SOGA1O94964 1423 aa30.45■■■□□ 2.46
HOXC10-202ENST00000511575 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
HOXC10-202ENST00000511575 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXC10-202ENST00000511575 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.31■■■□□ 2.44
HOXC10-202ENST00000511575 WDR97A6NE52 1622 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXC10-202ENST00000511575 SYNJ1O43426 1573 aa30.29■■■□□ 2.44
HOXC10-202ENST00000511575 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.28■■■□□ 2.44
HOXC10-202ENST00000511575 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.44
HOXC10-202ENST00000511575 GRIN2BQ13224 1484 aa30.23■■■□□ 2.43
HOXC10-202ENST00000511575 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
HOXC10-202ENST00000511575 SYNJ2O15056 1496 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXC10-202ENST00000511575 CUX1P39880 1505 aa30.17■■■□□ 2.42
HOXC10-202ENST00000511575 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.06■■■□□ 2.4
HOXC10-202ENST00000511575 PBRM1Q86U86 1689 aa30.03■■■□□ 2.4
HOXC10-202ENST00000511575 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.91■■■□□ 2.38
HOXC10-202ENST00000511575 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.88■■■□□ 2.37
HOXC10-202ENST00000511575 GRIN2AQ12879 1464 aa29.82■■■□□ 2.36
HOXC10-202ENST00000511575 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.79■■■□□ 2.36
HOXC10-202ENST00000511575 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.35
HOXC10-202ENST00000511575 CEP170Q5SW79 1584 aa29.73■■■□□ 2.35
HOXC10-202ENST00000511575 NUP160Q12769 1436 aa29.71■■■□□ 2.35
HOXC10-202ENST00000511575 ADAMTS12P58397 1594 aa29.71■■■□□ 2.35
HOXC10-202ENST00000511575 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXC10-202ENST00000511575 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
HOXC10-202ENST00000511575 SHROOM2Q13796 1616 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXC10-202ENST00000511575 TOP2BQ02880 1626 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXC10-202ENST00000511575 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.54■■■□□ 2.32
HOXC10-202ENST00000511575 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.53■■■□□ 2.32
HOXC10-202ENST00000511575 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
HOXC10-202ENST00000511575 JPH4Q96JJ6 628 aa29.5■■■□□ 2.31
HOXC10-202ENST00000511575 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.48■■■□□ 2.31
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