RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.51■■■■■ 7.44
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.17■■■■■ 6.42
ALYREF-203ENST00000511412 ABCC9O60706 1549 aa54.78■■■■■ 6.36
ALYREF-203ENST00000511412 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.34■■■■■ 5.97
ALYREF-203ENST00000511412 NACADO15069 1562 aa52.04■■■■■ 5.92
ALYREF-203ENST00000511412 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.67■■■■■ 5.86
ALYREF-203ENST00000511412 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.42■■■■■ 5.82
ALYREF-203ENST00000511412 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.18■■■■■ 5.78
ALYREF-203ENST00000511412 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.09■■■■■ 5.77
ALYREF-203ENST00000511412 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.98■■■■■ 5.75
ALYREF-203ENST00000511412 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.96■■■■■ 5.75
ALYREF-203ENST00000511412 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.87■■■■■ 5.73
ALYREF-203ENST00000511412 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.76■■■■■ 5.72
ALYREF-203ENST00000511412 SCRIBQ14160 1630 aa50.25■■■■■ 5.64
ALYREF-203ENST00000511412 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.19■■■■■ 5.62
ALYREF-203ENST00000511412 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.54■■■■■ 5.52
ALYREF-203ENST00000511412 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.52■■■■■ 5.52
ALYREF-203ENST00000511412 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.32■■■■■ 5.49
ALYREF-203ENST00000511412 NCAPD3P42695 1498 aa47.97■■■■■ 5.27
ALYREF-203ENST00000511412 SMARCA4P51532 1647 aa47.97■■■■■ 5.27
ALYREF-203ENST00000511412 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.88■■■■■ 5.26
ALYREF-203ENST00000511412 SMARCA2P51531 1590 aa47.82■■■■■ 5.25
ALYREF-203ENST00000511412 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.78■■■■■ 5.24
ALYREF-203ENST00000511412 HMGXB3Q12766 1538 aa47.73■■■■■ 5.23
ALYREF-203ENST00000511412 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.49■■■■■ 5.19
ALYREF-203ENST00000511412 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.47■■■■■ 5.19
ALYREF-203ENST00000511412 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.39■■■■■ 5.18
ALYREF-203ENST00000511412 ERCC6Q03468 1493 aa47.32■■■■■ 5.17
ALYREF-203ENST00000511412 CUX2O14529 1486 aa47.14■■■■■ 5.14
ALYREF-203ENST00000511412 NESP48681 1621 aa47.13■■■■■ 5.14
ALYREF-203ENST00000511412 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.93■■■■■ 5.1
ALYREF-203ENST00000511412 WIZO95785 1651 aa46.87■■■■■ 5.09
ALYREF-203ENST00000511412 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.69■■■■■ 5.06
ALYREF-203ENST00000511412 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.64■■■■■ 5.06
ALYREF-203ENST00000511412 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.62■■■■■ 5.05
ALYREF-203ENST00000511412 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.59■■■■■ 5.05
ALYREF-203ENST00000511412 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.52■■■■■ 5.04
ALYREF-203ENST00000511412 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.48■■■■■ 5.03
ALYREF-203ENST00000511412 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.33■■■■■ 5.01
ALYREF-203ENST00000511412 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.2■■■■■ 4.99
ALYREF-203ENST00000511412 WDR62O43379 1518 aa46.1■■■■■ 4.97
ALYREF-203ENST00000511412 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.09■■■■■ 4.97
ALYREF-203ENST00000511412 CFTRP13569 1480 aa46.08■■■■■ 4.97
ALYREF-203ENST00000511412 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.03■■■■■ 4.96
ALYREF-203ENST00000511412 PRDM2Q13029 1718 aa45.78■■■■■ 4.92
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.72■■■■■ 4.91
ALYREF-203ENST00000511412 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.62■■■■■ 4.89
ALYREF-203ENST00000511412 TOPBP1Q92547 1522 aa45.2■■■■■ 4.83
ALYREF-203ENST00000511412 IFT140Q96RY7 1462 aa45.14■■■■■ 4.82
ALYREF-203ENST00000511412 ABCC8Q09428 1581 aa45.13■■■■■ 4.82
ALYREF-203ENST00000511412 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.1■■■■■ 4.81
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.01■■■■■ 4.8
ALYREF-203ENST00000511412 OSCARQ8IYS5 282 aa44.92■■■■■ 4.78
ALYREF-203ENST00000511412 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.86■■■■■ 4.77
ALYREF-203ENST00000511412 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.79■■■■■ 4.76
ALYREF-203ENST00000511412 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.76■■■■■ 4.76
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM41Q8WV44 630 aa44.74■■■■■ 4.75
ALYREF-203ENST00000511412 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.6■■■■■ 4.732e-7■■■■■ 31.1
ALYREF-203ENST00000511412 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
ALYREF-203ENST00000511412 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.55■■■■■ 4.72
ALYREF-203ENST00000511412 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.53■■■■■ 4.72
ALYREF-203ENST00000511412 CUX1P39880 1505 aa44.52■■■■■ 4.72
ALYREF-203ENST00000511412 SOGA1O94964 1423 aa44.51■■■■■ 4.72
ALYREF-203ENST00000511412 CHD1O14646 1710 aa44.47■■■■■ 4.71
ALYREF-203ENST00000511412 WDR97A6NE52 1622 aa44.42■■■■■ 4.7
ALYREF-203ENST00000511412 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.42■■■■■ 4.7
ALYREF-203ENST00000511412 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.42■■■■■ 4.7
ALYREF-203ENST00000511412 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.42■■■■■ 4.7
ALYREF-203ENST00000511412 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGEF11O15085 1522 aa44.3■■■■■ 4.68
ALYREF-203ENST00000511412 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.23■■■■■ 4.67
ALYREF-203ENST00000511412 FBLN2P98095 1184 aa44.23■■■■■ 4.67
ALYREF-203ENST00000511412 GRIN2BQ13224 1484 aa44.14■■■■■ 4.66
ALYREF-203ENST00000511412 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.14■■■■■ 4.66
ALYREF-203ENST00000511412 PBRM1Q86U86 1689 aa44.07■■■■■ 4.65
ALYREF-203ENST00000511412 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.04■■■■■ 4.64
ALYREF-203ENST00000511412 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.01■■■■■ 4.64
ALYREF-203ENST00000511412 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.99■■■■■ 4.63
ALYREF-203ENST00000511412 SYNJ2O15056 1496 aa43.97■■■■■ 4.63
ALYREF-203ENST00000511412 SYNJ1O43426 1573 aa43.97■■■■■ 4.63
ALYREF-203ENST00000511412 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.96■■■■■ 4.63
ALYREF-203ENST00000511412 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.95■■■■■ 4.63
ALYREF-203ENST00000511412 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.94■■■■■ 4.63
ALYREF-203ENST00000511412 TOP2BQ02880 1626 aa43.92■■■■■ 4.62
ALYREF-203ENST00000511412 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.89■■■■■ 4.62
ALYREF-203ENST00000511412 ARAP1Q96P48 1450 aa43.88■■■■■ 4.61
ALYREF-203ENST00000511412 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.84■■■■■ 4.61
ALYREF-203ENST00000511412 ADAMTS12P58397 1594 aa43.65■■■■■ 4.58
ALYREF-203ENST00000511412 GRIN2AQ12879 1464 aa43.58■■■■■ 4.57
ALYREF-203ENST00000511412 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.51■■■■■ 4.56
ALYREF-203ENST00000511412 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.48■■■■■ 4.55
ALYREF-203ENST00000511412 CEP170Q5SW79 1584 aa43.43■■■■■ 4.54
ALYREF-203ENST00000511412 NUP160Q12769 1436 aa43.41■■■■■ 4.54
ALYREF-203ENST00000511412 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.28■■■■■ 4.52
ALYREF-203ENST00000511412 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.24■■■■■ 4.51
ALYREF-203ENST00000511412 SHROOM2Q13796 1616 aa43.23■■■■■ 4.51
ALYREF-203ENST00000511412 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.04■■■■■ 4.48
ALYREF-203ENST00000511412 KIF27Q86VH2 1401 aa43.04■■■■■ 4.48
ALYREF-203ENST00000511412 CUL7Q14999 1698 aa42.98■■■■■ 4.47
ALYREF-203ENST00000511412 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.94■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms