RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510809.1

ITGA3-212, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 518 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-212ENST00000510809 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.16■■■■□ 3.7
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ITGA3-212ENST00000510809 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.56■■■□□ 2.64
ITGA3-212ENST00000510809 NACADO15069 1562 aa31.56■■■□□ 2.64
ITGA3-212ENST00000510809 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.5■■■□□ 2.63
ITGA3-212ENST00000510809 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.47■■■□□ 2.63
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ITGA3-212ENST00000510809 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.78■■■□□ 2.52
ITGA3-212ENST00000510809 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.45■■■□□ 2.47
ITGA3-212ENST00000510809 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.43■■■□□ 2.46
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ITGA3-212ENST00000510809 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.61■■■□□ 2.33
ITGA3-212ENST00000510809 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
ITGA3-212ENST00000510809 SMARCA4P51532 1647 aa29.54■■■□□ 2.32
ITGA3-212ENST00000510809 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.41■■■□□ 2.3
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ITGA3-212ENST00000510809 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.23■■■□□ 2.27
ITGA3-212ENST00000510809 SMARCA2P51531 1590 aa29.22■■■□□ 2.27
ITGA3-212ENST00000510809 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.17■■■□□ 2.26
ITGA3-212ENST00000510809 WIZO95785 1651 aa29.15■■■□□ 2.26
ITGA3-212ENST00000510809 NCAPD3P42695 1498 aa29.05■■■□□ 2.24
ITGA3-212ENST00000510809 HMGXB3Q12766 1538 aa29.04■■■□□ 2.24
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ITGA3-212ENST00000510809 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
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ITGA3-212ENST00000510809 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
ITGA3-212ENST00000510809 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.48■■■□□ 2.15
ITGA3-212ENST00000510809 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.27■■■□□ 2.12
ITGA3-212ENST00000510809 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.22■■■□□ 2.11
ITGA3-212ENST00000510809 CFTRP13569 1480 aa28.21■■■□□ 2.11
ITGA3-212ENST00000510809 PRDM2Q13029 1718 aa28.19■■■□□ 2.1
ITGA3-212ENST00000510809 NESP48681 1621 aa28.17■■■□□ 2.1
ITGA3-212ENST00000510809 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28■■■□□ 2.07
ITGA3-212ENST00000510809 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.94■■■□□ 2.06
ITGA3-212ENST00000510809 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.94■■■□□ 2.06
ITGA3-212ENST00000510809 ERCC6Q03468 1493 aa27.89■■■□□ 2.05
ITGA3-212ENST00000510809 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.88■■■□□ 2.05
ITGA3-212ENST00000510809 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.71■■■□□ 2.03
ITGA3-212ENST00000510809 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
ITGA3-212ENST00000510809 ABCC8Q09428 1581 aa27.66■■■□□ 2.02
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ITGA3-212ENST00000510809 WDR62O43379 1518 aa27.62■■■□□ 2.01
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ITGA3-212ENST00000510809 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.6■■■□□ 2.01
ITGA3-212ENST00000510809 CUX1P39880 1505 aa27.57■■■□□ 2
ITGA3-212ENST00000510809 TOPBP1Q92547 1522 aa27.57■■■□□ 2
ITGA3-212ENST00000510809 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.55■■■□□ 2
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ITGA3-212ENST00000510809 TOP2BQ02880 1626 aa27.53■■■□□ 2
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ITGA3-212ENST00000510809 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.39■■□□□ 1.98
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ITGA3-212ENST00000510809 IFT140Q96RY7 1462 aa27.25■■□□□ 1.95
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ITGA3-212ENST00000510809 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.19■■□□□ 1.94
ITGA3-212ENST00000510809 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.16■■□□□ 1.94
ITGA3-212ENST00000510809 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
ITGA3-212ENST00000510809 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.05■■□□□ 1.92
ITGA3-212ENST00000510809 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
ITGA3-212ENST00000510809 KIF27Q86VH2 1401 aa26.99■■□□□ 1.91
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ITGA3-212ENST00000510809 PBRM1Q86U86 1689 aa26.95■■□□□ 1.91
ITGA3-212ENST00000510809 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.95■■□□□ 1.91
ITGA3-212ENST00000510809 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
ITGA3-212ENST00000510809 EEA1Q15075 1411 aa26.89■■□□□ 1.89
ITGA3-212ENST00000510809 GRIN2BQ13224 1484 aa26.87■■□□□ 1.89
ITGA3-212ENST00000510809 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.86■■□□□ 1.89
ITGA3-212ENST00000510809 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.85■■□□□ 1.89
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ITGA3-212ENST00000510809 CHD1O14646 1710 aa26.61■■□□□ 1.85
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ITGA3-212ENST00000510809 GRIN2AQ12879 1464 aa26.55■■□□□ 1.84
ITGA3-212ENST00000510809 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
ITGA3-212ENST00000510809 FBLN2P98095 1184 aa26.46■■□□□ 1.83
ITGA3-212ENST00000510809 GOLGA3Q08378 1498 aa26.46■■□□□ 1.83
ITGA3-212ENST00000510809 CEP170Q5SW79 1584 aa26.4■■□□□ 1.82
ITGA3-212ENST00000510809 NUP160Q12769 1436 aa26.39■■□□□ 1.82
ITGA3-212ENST00000510809 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.39■■□□□ 1.82
ITGA3-212ENST00000510809 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.3■■□□□ 1.8
ITGA3-212ENST00000510809 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.27■■□□□ 1.8
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