RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510460.1

SLC30A9-204, Transcript of solute carrier family 30 member 9, human

TSL 2

Gene SLC30A9, Length 819 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC30A9-204	ENST00000510460	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45.79	■■■■■ 4.92
SLC30A9-204	ENST00000510460	ABCC9	O60706	1549 aa		41.22	■■■■■ 4.19
SLC30A9-204	ENST00000510460	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		41.05	■■■■■ 4.16
SLC30A9-204	ENST00000510460	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		39.15	■■■■□ 3.86
SLC30A9-204	ENST00000510460	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		38.87	■■■■□ 3.81
SLC30A9-204	ENST00000510460	NACAD	O15069	1562 aa		38.86	■■■■□ 3.81
SLC30A9-204	ENST00000510460	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		38.73	■■■■□ 3.79
SLC30A9-204	ENST00000510460	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	38.43	■■■■□ 3.74
SLC30A9-204	ENST00000510460	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		38.26	■■■■□ 3.72
SLC30A9-204	ENST00000510460	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		38.24	■■■■□ 3.71
SLC30A9-204	ENST00000510460	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		37.99	■■■■□ 3.67
SLC30A9-204	ENST00000510460	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	37.91	■■■■□ 3.66
SLC30A9-204	ENST00000510460	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.77	■■■■□ 3.64
SLC30A9-204	ENST00000510460	SCRIB	Q14160	1630 aa		37.5	■■■■□ 3.59
SLC30A9-204	ENST00000510460	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		37.43	■■■■□ 3.58
SLC30A9-204	ENST00000510460	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		37.18	■■■■□ 3.54
SLC30A9-204	ENST00000510460	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		37.12	■■■■□ 3.53
SLC30A9-204	ENST00000510460	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	37.08	■■■■□ 3.53
SLC30A9-204	ENST00000510460	NCAPD3	P42695	1498 aa		35.89	■■■■□ 3.34
SLC30A9-204	ENST00000510460	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		35.79	■■■■□ 3.32
SLC30A9-204	ENST00000510460	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.72	■■■■□ 3.31
SLC30A9-204	ENST00000510460	SMARCA2	P51531	1590 aa		35.67	■■■■□ 3.3
SLC30A9-204	ENST00000510460	ERCC6	Q03468	1493 aa		35.6	■■■■□ 3.29
SLC30A9-204	ENST00000510460	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		35.59	■■■■□ 3.29
SLC30A9-204	ENST00000510460	HMGXB3	Q12766	1538 aa		35.58	■■■■□ 3.29
SLC30A9-204	ENST00000510460	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.55	■■■■□ 3.28
SLC30A9-204	ENST00000510460	CUX2	O14529	1486 aa		35.48	■■■■□ 3.27
SLC30A9-204	ENST00000510460	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	35.46	■■■■□ 3.27
SLC30A9-204	ENST00000510460	NES	P48681	1621 aa		35.39	■■■■□ 3.26
SLC30A9-204	ENST00000510460	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		35.33	■■■■□ 3.25
SLC30A9-204	ENST00000510460	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		35.3	■■■■□ 3.24
SLC30A9-204	ENST00000510460	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		35.08	■■■■□ 3.21
SLC30A9-204	ENST00000510460	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	34.96	■■■■□ 3.19
SLC30A9-204	ENST00000510460	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		34.93	■■■■□ 3.18
SLC30A9-204	ENST00000510460	WIZ	O95785	1651 aa		34.88	■■■■□ 3.17
SLC30A9-204	ENST00000510460	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		34.88	■■■■□ 3.17
SLC30A9-204	ENST00000510460	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		34.83	■■■■□ 3.17
SLC30A9-204	ENST00000510460	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		34.6	■■■■□ 3.13
SLC30A9-204	ENST00000510460	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	34.56	■■■■□ 3.12
SLC30A9-204	ENST00000510460	WDR62	O43379	1518 aa		34.48	■■■■□ 3.11
SLC30A9-204	ENST00000510460	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		34.47	■■■■□ 3.11
SLC30A9-204	ENST00000510460	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		34.44	■■■■□ 3.1
SLC30A9-204	ENST00000510460	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	34.4	■■■■□ 3.1
SLC30A9-204	ENST00000510460	CFTR	P13569	1480 aa		34.39	■■■■□ 3.1
SLC30A9-204	ENST00000510460	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	34.14	■■■■□ 3.06
SLC30A9-204	ENST00000510460	TRIM41	Q8WV44	630 aa		34.09	■■■■□ 3.05
SLC30A9-204	ENST00000510460	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		34.07	■■■■□ 3.04
SLC30A9-204	ENST00000510460	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.99	■■■■□ 3.03
SLC30A9-204	ENST00000510460	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		33.96	■■■■□ 3.03
SLC30A9-204	ENST00000510460	IFT140	Q96RY7	1462 aa		33.77	■■■■□ 3
SLC30A9-204	ENST00000510460	TOPBP1	Q92547	1522 aa		33.76	■■■■□ 3
SLC30A9-204	ENST00000510460	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	33.74	■■■□□ 2.99
SLC30A9-204	ENST00000510460	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.68	■■■□□ 2.98
SLC30A9-204	ENST00000510460	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		33.61	■■■□□ 2.97
SLC30A9-204	ENST00000510460	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	33.51	■■■□□ 2.96
SLC30A9-204	ENST00000510460	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	33.46	■■■□□ 2.95
SLC30A9-204	ENST00000510460	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SLC30A9-204	ENST00000510460	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SLC30A9-204	ENST00000510460	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		33.44	■■■□□ 2.94
SLC30A9-204	ENST00000510460	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	33.43	■■■□□ 2.94
SLC30A9-204	ENST00000510460	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	33.41	■■■□□ 2.94
SLC30A9-204	ENST00000510460	FBLN2	P98095	1184 aa		33.34	■■■□□ 2.93
SLC30A9-204	ENST00000510460	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SLC30A9-204	ENST00000510460	ARHGEF11	O15085	1522 aa		33.33	■■■□□ 2.93
SLC30A9-204	ENST00000510460	SOGA1	O94964	1423 aa		33.31	■■■□□ 2.92
SLC30A9-204	ENST00000510460	CHD1	O14646	1710 aa		33.29	■■■□□ 2.92
SLC30A9-204	ENST00000510460	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	33.27	■■■□□ 2.92
SLC30A9-204	ENST00000510460	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		33.21	■■■□□ 2.91
SLC30A9-204	ENST00000510460	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		33.2	■■■□□ 2.91
SLC30A9-204	ENST00000510460	CUX1	P39880	1505 aa		33.17	■■■□□ 2.9
SLC30A9-204	ENST00000510460	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
SLC30A9-204	ENST00000510460	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		33.09	■■■□□ 2.89
SLC30A9-204	ENST00000510460	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	33.05	■■■□□ 2.88
SLC30A9-204	ENST00000510460	WDR97	A6NE52	1622 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SLC30A9-204	ENST00000510460	ARAP1	Q96P48	1450 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SLC30A9-204	ENST00000510460	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SLC30A9-204	ENST00000510460	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.98	■■■□□ 2.87
SLC30A9-204	ENST00000510460	SYNJ1	O43426	1573 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SLC30A9-204	ENST00000510460	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SLC30A9-204	ENST00000510460	SYNJ2	O15056	1496 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SLC30A9-204	ENST00000510460	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SLC30A9-204	ENST00000510460	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
SLC30A9-204	ENST00000510460	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.82	■■■□□ 2.84
SLC30A9-204	ENST00000510460	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.81	■■■□□ 2.84
SLC30A9-204	ENST00000510460	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.73	■■■□□ 2.83
SLC30A9-204	ENST00000510460	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	32.72	■■■□□ 2.83
SLC30A9-204	ENST00000510460	TOP2B	Q02880	1626 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SLC30A9-204	ENST00000510460	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SLC30A9-204	ENST00000510460	GRIN2A	Q12879	1464 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SLC30A9-204	ENST00000510460	ADAMTS12	P58397	1594 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SLC30A9-204	ENST00000510460	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SLC30A9-204	ENST00000510460	CEP170	Q5SW79	1584 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SLC30A9-204	ENST00000510460	NUP160	Q12769	1436 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SLC30A9-204	ENST00000510460	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SLC30A9-204	ENST00000510460	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SLC30A9-204	ENST00000510460	SHROOM2	Q13796	1616 aa		32.26	■■■□□ 2.76
SLC30A9-204	ENST00000510460	JPH4	Q96JJ6	628 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SLC30A9-204	ENST00000510460	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
SLC30A9-204	ENST00000510460	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		32.04	■■■□□ 2.72
SLC30A9-204	ENST00000510460	IGF1R	P08069	1367 aa		32.02	■■■□□ 2.72

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