RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510424.2

PHOX2B-202, Transcript of paired like homeobox 2B, humanhuman

TSL 3

Gene PHOX2B, Length 540 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2B-202ENST00000510424 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.2■■■■■ 7.55
PHOX2B-202ENST00000510424 ABCC9O60706 1549 aa55.77■■■■■ 6.52
PHOX2B-202ENST00000510424 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.58■■■■■ 6.49
PHOX2B-202ENST00000510424 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.87■■■■■ 6.05
PHOX2B-202ENST00000510424 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.76■■■■■ 6.04
PHOX2B-202ENST00000510424 NACADO15069 1562 aa52.36■■■■■ 5.97
PHOX2B-202ENST00000510424 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.32■■■■■ 5.97
PHOX2B-202ENST00000510424 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.81■■■■■ 5.88
PHOX2B-202ENST00000510424 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.74■■■■■ 5.87
PHOX2B-202ENST00000510424 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.7■■■■■ 5.87
PHOX2B-202ENST00000510424 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.69■■■■■ 5.87
PHOX2B-202ENST00000510424 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.33■■■■■ 5.81
PHOX2B-202ENST00000510424 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.28■■■■■ 5.8
PHOX2B-202ENST00000510424 SCRIBQ14160 1630 aa50.81■■■■■ 5.72
PHOX2B-202ENST00000510424 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.56■■■■■ 5.68
PHOX2B-202ENST00000510424 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.36■■■■■ 5.65
PHOX2B-202ENST00000510424 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.31■■■■■ 5.64
PHOX2B-202ENST00000510424 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.1■■■■■ 5.61
PHOX2B-202ENST00000510424 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.95■■■■■ 5.43
PHOX2B-202ENST00000510424 SMARCA4P51532 1647 aa48.46■■■■■ 5.35
PHOX2B-202ENST00000510424 CUX2O14529 1486 aa48.32■■■■■ 5.33
PHOX2B-202ENST00000510424 NCAPD3P42695 1498 aa48.3■■■■■ 5.32
PHOX2B-202ENST00000510424 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.3■■■■■ 5.32
PHOX2B-202ENST00000510424 ERCC6Q03468 1493 aa48.25■■■■■ 5.31
PHOX2B-202ENST00000510424 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.23■■■■■ 5.31
PHOX2B-202ENST00000510424 SMARCA2P51531 1590 aa48.17■■■■■ 5.3
PHOX2B-202ENST00000510424 HMGXB3Q12766 1538 aa48.05■■■■■ 5.28
PHOX2B-202ENST00000510424 MROH2BQ7Z745 1585 aa48■■■■■ 5.27
PHOX2B-202ENST00000510424 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.89■■■■■ 5.26
PHOX2B-202ENST00000510424 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
PHOX2B-202ENST00000510424 NESP48681 1621 aa47.71■■■■■ 5.23
PHOX2B-202ENST00000510424 WIZO95785 1651 aa47.5■■■■■ 5.19
PHOX2B-202ENST00000510424 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.37■■■■■ 5.17
PHOX2B-202ENST00000510424 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.34■■■■■ 5.17
PHOX2B-202ENST00000510424 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.16■■■■■ 5.14
PHOX2B-202ENST00000510424 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.15■■■■■ 5.14
PHOX2B-202ENST00000510424 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.08■■■■■ 5.13
PHOX2B-202ENST00000510424 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.88■■■■■ 5.1
PHOX2B-202ENST00000510424 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.86■■■■■ 5.09
PHOX2B-202ENST00000510424 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.7■■■■■ 5.07
PHOX2B-202ENST00000510424 TRIM41Q8WV44 630 aa46.62■■■■■ 5.05
PHOX2B-202ENST00000510424 WDR62O43379 1518 aa46.59■■■■■ 5.05
PHOX2B-202ENST00000510424 CFTRP13569 1480 aa46.48■■■■■ 5.03
PHOX2B-202ENST00000510424 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.41■■■■■ 5.02
PHOX2B-202ENST00000510424 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.41■■■■■ 5.02
PHOX2B-202ENST00000510424 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.32■■■■■ 5.01
PHOX2B-202ENST00000510424 PRDM2Q13029 1718 aa46.18■■■■■ 4.98
PHOX2B-202ENST00000510424 OSCARQ8IYS5 282 aa46.03■■■■■ 4.96
PHOX2B-202ENST00000510424 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
PHOX2B-202ENST00000510424 TOPBP1Q92547 1522 aa45.62■■■■■ 4.89
PHOX2B-202ENST00000510424 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.57■■■■■ 4.89
PHOX2B-202ENST00000510424 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.52■■■■■ 4.88
PHOX2B-202ENST00000510424 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.52■■■■■ 4.88
PHOX2B-202ENST00000510424 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.52■■■■■ 4.88
PHOX2B-202ENST00000510424 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.5■■■■■ 4.87
PHOX2B-202ENST00000510424 IFT140Q96RY7 1462 aa45.49■■■■■ 4.87
PHOX2B-202ENST00000510424 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.44■■■■■ 4.86
PHOX2B-202ENST00000510424 ABCC8Q09428 1581 aa45.42■■■■■ 4.86
PHOX2B-202ENST00000510424 ARHGEF11O15085 1522 aa45.28■■■■■ 4.84
PHOX2B-202ENST00000510424 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.22■■■■■ 4.83
PHOX2B-202ENST00000510424 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.18■■■■■ 4.82
PHOX2B-202ENST00000510424 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.18■■■■■ 4.82
PHOX2B-202ENST00000510424 CUX1P39880 1505 aa45.06■■■■■ 4.8
PHOX2B-202ENST00000510424 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.05■■■■■ 4.8
PHOX2B-202ENST00000510424 CHD1O14646 1710 aa45.04■■■■■ 4.8
PHOX2B-202ENST00000510424 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.03■■■■■ 4.8
PHOX2B-202ENST00000510424 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45■■■■■ 4.79
PHOX2B-202ENST00000510424 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45■■■■■ 4.79
PHOX2B-202ENST00000510424 SOGA1O94964 1423 aa44.95■■■■■ 4.79
PHOX2B-202ENST00000510424 FBLN2P98095 1184 aa44.87■■■■■ 4.77
PHOX2B-202ENST00000510424 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
PHOX2B-202ENST00000510424 ARAP1Q96P48 1450 aa44.76■■■■■ 4.76
PHOX2B-202ENST00000510424 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.75■■■■■ 4.75
PHOX2B-202ENST00000510424 WDR97A6NE52 1622 aa44.69■■■■■ 4.74
PHOX2B-202ENST00000510424 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.6■■■■■ 4.73
PHOX2B-202ENST00000510424 SYNJ1O43426 1573 aa44.5■■■■■ 4.71
PHOX2B-202ENST00000510424 GRIN2BQ13224 1484 aa44.49■■■■■ 4.71
PHOX2B-202ENST00000510424 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.49■■■■■ 4.71
PHOX2B-202ENST00000510424 PBRM1Q86U86 1689 aa44.48■■■■■ 4.71
PHOX2B-202ENST00000510424 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.48■■■■■ 4.71
PHOX2B-202ENST00000510424 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.47■■■■■ 4.71
PHOX2B-202ENST00000510424 TOP2BQ02880 1626 aa44.46■■■■■ 4.71
PHOX2B-202ENST00000510424 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.43■■■■■ 4.7
PHOX2B-202ENST00000510424 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.42■■■■■ 4.7
PHOX2B-202ENST00000510424 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.42■■■■■ 4.7
PHOX2B-202ENST00000510424 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.42■■■■■ 4.7
PHOX2B-202ENST00000510424 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.42■■■■■ 4.7
PHOX2B-202ENST00000510424 SYNJ2O15056 1496 aa44.28■■■■■ 4.68
PHOX2B-202ENST00000510424 ADAMTS12P58397 1594 aa44.05■■■■■ 4.64
PHOX2B-202ENST00000510424 GRIN2AQ12879 1464 aa43.95■■■■■ 4.63
PHOX2B-202ENST00000510424 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
PHOX2B-202ENST00000510424 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.9■■■■■ 4.62
PHOX2B-202ENST00000510424 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.86■■■■■ 4.61
PHOX2B-202ENST00000510424 CEP170Q5SW79 1584 aa43.83■■■■■ 4.61
PHOX2B-202ENST00000510424 NUP160Q12769 1436 aa43.74■■■■■ 4.59
PHOX2B-202ENST00000510424 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.67■■■■■ 4.58
PHOX2B-202ENST00000510424 KIF27Q86VH2 1401 aa43.56■■■■■ 4.56
PHOX2B-202ENST00000510424 SHROOM2Q13796 1616 aa43.53■■■■■ 4.56
PHOX2B-202ENST00000510424 IGF1RP08069 1367 aa43.47■■■■■ 4.55
PHOX2B-202ENST00000510424 CUL7Q14999 1698 aa43.43■■■■■ 4.54
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