RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510170.5

NR3C1-215, Transcript of nuclear receptor subfamily 3 group C member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NR3C1, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR3C1-215ENST00000510170 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.45■■■■■ 6.47
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NR3C1-215ENST00000510170 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.32■■■■■ 4.68
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NR3C1-215ENST00000510170 SMARCA2P51531 1590 aa42.99■■■■■ 4.47
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NR3C1-215ENST00000510170 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.73■■■■■ 4.43
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NR3C1-215ENST00000510170 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.35■■■■■ 4.21
NR3C1-215ENST00000510170 WDR62O43379 1518 aa41.29■■■■■ 4.2
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NR3C1-215ENST00000510170 PRDM2Q13029 1718 aa41.25■■■■■ 4.19
NR3C1-215ENST00000510170 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.19■■■■■ 4.18
NR3C1-215ENST00000510170 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
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NR3C1-215ENST00000510170 ABCC8Q09428 1581 aa40.57■■■■■ 4.08
NR3C1-215ENST00000510170 IFT140Q96RY7 1462 aa40.49■■■■■ 4.07
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NR3C1-215ENST00000510170 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.03
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NR3C1-215ENST00000510170 WDR97A6NE52 1622 aa39.91■■■■□ 3.98
NR3C1-215ENST00000510170 CHD1O14646 1710 aa39.88■■■■□ 3.97
NR3C1-215ENST00000510170 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
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NR3C1-215ENST00000510170 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.71■■■■□ 3.95
NR3C1-215ENST00000510170 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.71■■■■□ 3.95
NR3C1-215ENST00000510170 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.68■■■■□ 3.94
NR3C1-215ENST00000510170 FBLN2P98095 1184 aa39.68■■■■□ 3.94
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NR3C1-215ENST00000510170 PBRM1Q86U86 1689 aa39.67■■■■□ 3.94
NR3C1-215ENST00000510170 GRIN2BQ13224 1484 aa39.67■■■■□ 3.94
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NR3C1-215ENST00000510170 ARHGEF11O15085 1522 aa39.54■■■■□ 3.92
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NR3C1-215ENST00000510170 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.19■■■■□ 3.86
NR3C1-215ENST00000510170 GRIN2AQ12879 1464 aa39.17■■■■□ 3.86
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NR3C1-215ENST00000510170 CEP170Q5SW79 1584 aa39.03■■■■□ 3.84
NR3C1-215ENST00000510170 NUP160Q12769 1436 aa38.97■■■■□ 3.83
NR3C1-215ENST00000510170 KIF27Q86VH2 1401 aa38.89■■■■□ 3.82
NR3C1-215ENST00000510170 CUL7Q14999 1698 aa38.81■■■■□ 3.8
NR3C1-215ENST00000510170 SHROOM2Q13796 1616 aa38.8■■■■□ 3.8
NR3C1-215ENST00000510170 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.77■■■■□ 3.8
NR3C1-215ENST00000510170 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.72■■■■□ 3.79
NR3C1-215ENST00000510170 IGF1RP08069 1367 aa38.71■■■■□ 3.79
NR3C1-215ENST00000510170 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.56■■■■□ 3.76
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