RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509340.1

PPM1K-205, Transcript of protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1K, humanhuman

TSL 3

Gene PPM1K, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1K-205ENST00000509340 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.15■■■■■ 8.02
PPM1K-205ENST00000509340 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.18■■■■■ 6.9
PPM1K-205ENST00000509340 ABCC9O60706 1549 aa57.15■■■■■ 6.74
PPM1K-205ENST00000509340 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.91■■■■■ 6.38
PPM1K-205ENST00000509340 NACADO15069 1562 aa54.76■■■■■ 6.36
PPM1K-205ENST00000509340 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.38■■■■■ 6.3
PPM1K-205ENST00000509340 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.38■■■■■ 6.3
PPM1K-205ENST00000509340 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.22■■■■■ 6.27
PPM1K-205ENST00000509340 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.98■■■■■ 6.23
PPM1K-205ENST00000509340 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.62■■■■■ 6.17
PPM1K-205ENST00000509340 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.26■■■■■ 6.12
PPM1K-205ENST00000509340 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.23■■■■■ 6.11
PPM1K-205ENST00000509340 SCRIBQ14160 1630 aa52.93■■■■■ 6.06
PPM1K-205ENST00000509340 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.79■■■■■ 6.04
PPM1K-205ENST00000509340 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.73■■■■■ 6.03
PPM1K-205ENST00000509340 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.87■■■■■ 5.89
PPM1K-205ENST00000509340 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.72■■■■■ 5.87
PPM1K-205ENST00000509340 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.43■■■■■ 5.82
PPM1K-205ENST00000509340 SMARCA4P51532 1647 aa50.65■■■■■ 5.7
PPM1K-205ENST00000509340 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.56■■■■■ 5.68
PPM1K-205ENST00000509340 NCAPD3P42695 1498 aa50.52■■■■■ 5.68
PPM1K-205ENST00000509340 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.46■■■■■ 5.67
PPM1K-205ENST00000509340 SMARCA2P51531 1590 aa50.43■■■■■ 5.66
PPM1K-205ENST00000509340 HMGXB3Q12766 1538 aa50.28■■■■■ 5.64
PPM1K-205ENST00000509340 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.22■■■■■ 5.63
PPM1K-205ENST00000509340 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.17■■■■■ 5.62
PPM1K-205ENST00000509340 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.02■■■■■ 5.6
PPM1K-205ENST00000509340 WIZO95785 1651 aa49.58■■■■■ 5.53
PPM1K-205ENST00000509340 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.46■■■■■ 5.51
PPM1K-205ENST00000509340 NESP48681 1621 aa49.34■■■■■ 5.49
PPM1K-205ENST00000509340 ERCC6Q03468 1493 aa49.33■■■■■ 5.49
PPM1K-205ENST00000509340 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.28■■■■■ 5.48
PPM1K-205ENST00000509340 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.11■■■■■ 5.45
PPM1K-205ENST00000509340 CUX2O14529 1486 aa49.03■■■■■ 5.44
PPM1K-205ENST00000509340 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.99■■■■■ 5.43
PPM1K-205ENST00000509340 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.92■■■■■ 5.42
PPM1K-205ENST00000509340 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.78■■■■■ 5.4
PPM1K-205ENST00000509340 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.77■■■■■ 5.4
PPM1K-205ENST00000509340 CFTRP13569 1480 aa48.65■■■■■ 5.38
PPM1K-205ENST00000509340 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.47■■■■■ 5.35
PPM1K-205ENST00000509340 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.44■■■■■ 5.35
PPM1K-205ENST00000509340 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.43■■■■■ 5.34
PPM1K-205ENST00000509340 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.43■■■■■ 5.34
PPM1K-205ENST00000509340 WDR62O43379 1518 aa48.32■■■■■ 5.33
PPM1K-205ENST00000509340 PRDM2Q13029 1718 aa48.28■■■■■ 5.32
PPM1K-205ENST00000509340 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.97■■■■■ 5.27
PPM1K-205ENST00000509340 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.88■■■■■ 5.26
PPM1K-205ENST00000509340 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.76■■■■■ 5.24
PPM1K-205ENST00000509340 ABCC8Q09428 1581 aa47.64■■■■■ 5.22
PPM1K-205ENST00000509340 TOPBP1Q92547 1522 aa47.61■■■■■ 5.21
PPM1K-205ENST00000509340 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.56■■■■■ 5.2
PPM1K-205ENST00000509340 IFT140Q96RY7 1462 aa47.44■■■■■ 5.18
PPM1K-205ENST00000509340 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.19■■■■■ 5.14
PPM1K-205ENST00000509340 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.19■■■■■ 5.14
PPM1K-205ENST00000509340 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
PPM1K-205ENST00000509340 CUX1P39880 1505 aa47.1■■■■■ 5.13
PPM1K-205ENST00000509340 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.05■■■■■ 5.12
PPM1K-205ENST00000509340 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47■■■■■ 5.11
PPM1K-205ENST00000509340 SOGA1O94964 1423 aa46.95■■■■■ 5.11
PPM1K-205ENST00000509340 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.92■■■■■ 5.1
PPM1K-205ENST00000509340 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.85■■■■■ 5.09
PPM1K-205ENST00000509340 WDR97A6NE52 1622 aa46.85■■■■■ 5.09
PPM1K-205ENST00000509340 OSCARQ8IYS5 282 aa46.82■■■■■ 5.09
PPM1K-205ENST00000509340 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
PPM1K-205ENST00000509340 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.66■■■■■ 5.06
PPM1K-205ENST00000509340 TOP2BQ02880 1626 aa46.64■■■■■ 5.06
PPM1K-205ENST00000509340 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.64■■■■■ 5.06
PPM1K-205ENST00000509340 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.57■■■■■ 5.05
PPM1K-205ENST00000509340 SYNJ1O43426 1573 aa46.55■■■■■ 5.04
PPM1K-205ENST00000509340 CHD1O14646 1710 aa46.51■■■■■ 5.04
PPM1K-205ENST00000509340 GRIN2BQ13224 1484 aa46.51■■■■■ 5.04
PPM1K-205ENST00000509340 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.46■■■■■ 5.03
PPM1K-205ENST00000509340 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.45■■■■■ 5.03
PPM1K-205ENST00000509340 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.43■■■■■ 5.02
PPM1K-205ENST00000509340 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.43■■■■■ 5.02
PPM1K-205ENST00000509340 PBRM1Q86U86 1689 aa46.38■■■■■ 5.02
PPM1K-205ENST00000509340 FBLN2P98095 1184 aa46.31■■■■■ 5
PPM1K-205ENST00000509340 SYNJ2O15056 1496 aa46.25■■■■■ 5
PPM1K-205ENST00000509340 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.18■■■■■ 4.98
PPM1K-205ENST00000509340 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.15■■■■■ 4.98
PPM1K-205ENST00000509340 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.15■■■■■ 4.98
PPM1K-205ENST00000509340 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.15■■■■■ 4.98
PPM1K-205ENST00000509340 ARHGEF11O15085 1522 aa46.13■■■■■ 4.97
PPM1K-205ENST00000509340 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.04■■■■■ 4.96
PPM1K-205ENST00000509340 TRIM41Q8WV44 630 aa46.04■■■■■ 4.96
PPM1K-205ENST00000509340 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.03■■■■■ 4.96
PPM1K-205ENST00000509340 ADAMTS12P58397 1594 aa46.01■■■■■ 4.96
PPM1K-205ENST00000509340 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.9■■■■■ 4.94
PPM1K-205ENST00000509340 GRIN2AQ12879 1464 aa45.9■■■■■ 4.94
PPM1K-205ENST00000509340 NUP160Q12769 1436 aa45.73■■■■■ 4.91
PPM1K-205ENST00000509340 KIF27Q86VH2 1401 aa45.72■■■■■ 4.91
PPM1K-205ENST00000509340 ARAP1Q96P48 1450 aa45.72■■■■■ 4.91
PPM1K-205ENST00000509340 CEP170Q5SW79 1584 aa45.67■■■■■ 4.9
PPM1K-205ENST00000509340 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.6■■■■■ 4.89
PPM1K-205ENST00000509340 IGF1RP08069 1367 aa45.54■■■■■ 4.88
PPM1K-205ENST00000509340 CUL7Q14999 1698 aa45.53■■■■■ 4.88
PPM1K-205ENST00000509340 SHROOM2Q13796 1616 aa45.44■■■■■ 4.87
PPM1K-205ENST00000509340 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.35■■■■■ 4.85
PPM1K-205ENST00000509340 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.28■■■■■ 4.84
PPM1K-205ENST00000509340 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.27■■■■■ 4.84
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