RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508915.5

SPATA18-207, Transcript of spermatogenesis associated 18, humanhuman

TSL 4

Gene SPATA18, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA18-207ENST00000508915 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.58■■■■■ 6.65
SPATA18-207ENST00000508915 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.37■■■■■ 5.65
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SPATA18-207ENST00000508915 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.53■■■■■ 5.2
SPATA18-207ENST00000508915 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.49■■■■■ 5.19
SPATA18-207ENST00000508915 NACADO15069 1562 aa47.41■■■■■ 5.18
SPATA18-207ENST00000508915 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
SPATA18-207ENST00000508915 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.05■■■■■ 5.12
SPATA18-207ENST00000508915 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.8■■■■■ 5.08
SPATA18-207ENST00000508915 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.34■■■■■ 5.01
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SPATA18-207ENST00000508915 SCRIBQ14160 1630 aa45.99■■■■■ 4.95
SPATA18-207ENST00000508915 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.98■■■■■ 4.95
SPATA18-207ENST00000508915 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.58■■■■■ 4.89
SPATA18-207ENST00000508915 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.4■■■■■ 4.86
SPATA18-207ENST00000508915 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
SPATA18-207ENST00000508915 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.69■■■■■ 4.74
SPATA18-207ENST00000508915 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.46■■■■■ 4.71
SPATA18-207ENST00000508915 SMARCA4P51532 1647 aa43.95■■■■■ 4.63
SPATA18-207ENST00000508915 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
SPATA18-207ENST00000508915 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.73■■■■■ 4.59
SPATA18-207ENST00000508915 SMARCA2P51531 1590 aa43.72■■■■■ 4.59
SPATA18-207ENST00000508915 NCAPD3P42695 1498 aa43.72■■■■■ 4.59
SPATA18-207ENST00000508915 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.6■■■■■ 4.57
SPATA18-207ENST00000508915 HMGXB3Q12766 1538 aa43.52■■■■■ 4.56
SPATA18-207ENST00000508915 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.48■■■■■ 4.55
SPATA18-207ENST00000508915 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
SPATA18-207ENST00000508915 WIZO95785 1651 aa43.13■■■■■ 4.49
SPATA18-207ENST00000508915 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
SPATA18-207ENST00000508915 ERCC6Q03468 1493 aa42.72■■■■■ 4.43
SPATA18-207ENST00000508915 NESP48681 1621 aa42.71■■■■■ 4.43
SPATA18-207ENST00000508915 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
SPATA18-207ENST00000508915 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.63■■■■■ 4.41
SPATA18-207ENST00000508915 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.48■■■■■ 4.39
SPATA18-207ENST00000508915 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.39■■■■■ 4.38
SPATA18-207ENST00000508915 CUX2O14529 1486 aa42.24■■■■■ 4.35
SPATA18-207ENST00000508915 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.2■■■■■ 4.35
SPATA18-207ENST00000508915 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.17■■■■■ 4.34
SPATA18-207ENST00000508915 CFTRP13569 1480 aa42.17■■■■■ 4.34
SPATA18-207ENST00000508915 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.08■■■■■ 4.33
SPATA18-207ENST00000508915 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.01■■■■■ 4.32
SPATA18-207ENST00000508915 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.99■■■■■ 4.31
SPATA18-207ENST00000508915 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
SPATA18-207ENST00000508915 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.93■■■■■ 4.3
SPATA18-207ENST00000508915 PRDM2Q13029 1718 aa41.83■■■■■ 4.29
SPATA18-207ENST00000508915 WDR62O43379 1518 aa41.76■■■■■ 4.28
SPATA18-207ENST00000508915 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
SPATA18-207ENST00000508915 ABCC8Q09428 1581 aa41.33■■■■■ 4.21
SPATA18-207ENST00000508915 TOPBP1Q92547 1522 aa41.29■■■■■ 4.2
SPATA18-207ENST00000508915 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.25■■■■■ 4.19
SPATA18-207ENST00000508915 IFT140Q96RY7 1462 aa41.1■■■■■ 4.17
SPATA18-207ENST00000508915 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.07■■■■■ 4.17
SPATA18-207ENST00000508915 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
SPATA18-207ENST00000508915 CUX1P39880 1505 aa40.91■■■■■ 4.14
SPATA18-207ENST00000508915 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
SPATA18-207ENST00000508915 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.83■■■■■ 4.13
SPATA18-207ENST00000508915 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
SPATA18-207ENST00000508915 SOGA1O94964 1423 aa40.8■■■■■ 4.12
SPATA18-207ENST00000508915 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.76■■■■■ 4.12
SPATA18-207ENST00000508915 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
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SPATA18-207ENST00000508915 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.65■■■■■ 4.1
SPATA18-207ENST00000508915 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
SPATA18-207ENST00000508915 TOP2BQ02880 1626 aa40.55■■■■■ 4.08
SPATA18-207ENST00000508915 WDR97A6NE52 1622 aa40.54■■■■■ 4.08
SPATA18-207ENST00000508915 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.53■■■■■ 4.08
SPATA18-207ENST00000508915 SYNJ1O43426 1573 aa40.52■■■■■ 4.08
SPATA18-207ENST00000508915 OSCARQ8IYS5 282 aa40.51■■■■■ 4.08
SPATA18-207ENST00000508915 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.42■■■■■ 4.06
SPATA18-207ENST00000508915 GRIN2BQ13224 1484 aa40.34■■■■■ 4.05
SPATA18-207ENST00000508915 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.32■■■■■ 4.05
SPATA18-207ENST00000508915 FBLN2P98095 1184 aa40.31■■■■■ 4.04
SPATA18-207ENST00000508915 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.3■■■■■ 4.04
SPATA18-207ENST00000508915 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.25■■■■■ 4.03
SPATA18-207ENST00000508915 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
SPATA18-207ENST00000508915 CHD1O14646 1710 aa40.23■■■■■ 4.03
SPATA18-207ENST00000508915 PBRM1Q86U86 1689 aa40.22■■■■■ 4.03
SPATA18-207ENST00000508915 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
SPATA18-207ENST00000508915 SYNJ2O15056 1496 aa40.09■■■■■ 4.01
SPATA18-207ENST00000508915 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.95■■■■□ 3.99
SPATA18-207ENST00000508915 ADAMTS12P58397 1594 aa39.9■■■■□ 3.98
SPATA18-207ENST00000508915 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.86■■■■□ 3.97
SPATA18-207ENST00000508915 KIF27Q86VH2 1401 aa39.85■■■■□ 3.97
SPATA18-207ENST00000508915 GRIN2AQ12879 1464 aa39.81■■■■□ 3.96
SPATA18-207ENST00000508915 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.8■■■■□ 3.96
SPATA18-207ENST00000508915 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.8■■■■□ 3.96
SPATA18-207ENST00000508915 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.8■■■■□ 3.96
SPATA18-207ENST00000508915 ARHGEF11O15085 1522 aa39.8■■■■□ 3.96
SPATA18-207ENST00000508915 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.78■■■■□ 3.96
SPATA18-207ENST00000508915 TRIM41Q8WV44 630 aa39.77■■■■□ 3.96
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SPATA18-207ENST00000508915 NUP160Q12769 1436 aa39.6■■■■□ 3.93
SPATA18-207ENST00000508915 CEP170Q5SW79 1584 aa39.59■■■■□ 3.93
SPATA18-207ENST00000508915 CUL7Q14999 1698 aa39.58■■■■□ 3.93
SPATA18-207ENST00000508915 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.49■■■■□ 3.91
SPATA18-207ENST00000508915 ARAP1Q96P48 1450 aa39.45■■■■□ 3.91
SPATA18-207ENST00000508915 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.44■■■■□ 3.9
SPATA18-207ENST00000508915 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.35■■■■□ 3.89
SPATA18-207ENST00000508915 SHROOM2Q13796 1616 aa39.3■■■■□ 3.88
SPATA18-207ENST00000508915 JPH4Q96JJ6 628 aa39.25■■■■□ 3.87
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