RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508322.1

PROM1-208, Transcript of prominin 1, humanhuman

TSL 3

Gene PROM1, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1-208ENST00000508322 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.49■■■■■ 7.11
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PROM1-208ENST00000508322 NESP48681 1621 aa45.11■■■■■ 4.81
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PROM1-208ENST00000508322 TOPBP1Q92547 1522 aa43.5■■■■■ 4.55
PROM1-208ENST00000508322 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.41■■■■■ 4.54
PROM1-208ENST00000508322 IFT140Q96RY7 1462 aa43.33■■■■■ 4.53
PROM1-208ENST00000508322 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.13■■■■■ 4.5
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PROM1-208ENST00000508322 SOGA1O94964 1423 aa42.99■■■■■ 4.47
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PROM1-208ENST00000508322 WDR97A6NE52 1622 aa42.66■■■■■ 4.42
PROM1-208ENST00000508322 FBLN2P98095 1184 aa42.58■■■■■ 4.41
PROM1-208ENST00000508322 TOP2BQ02880 1626 aa42.56■■■■■ 4.4
PROM1-208ENST00000508322 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.53■■■■■ 4.4
PROM1-208ENST00000508322 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.51■■■■■ 4.4
PROM1-208ENST00000508322 SYNJ1O43426 1573 aa42.51■■■■■ 4.4
PROM1-208ENST00000508322 GRIN2BQ13224 1484 aa42.49■■■■■ 4.39
PROM1-208ENST00000508322 CHD1O14646 1710 aa42.47■■■■■ 4.39
PROM1-208ENST00000508322 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.47■■■■■ 4.39
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PROM1-208ENST00000508322 PBRM1Q86U86 1689 aa42.33■■■■■ 4.37
PROM1-208ENST00000508322 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.33■■■■■ 4.37
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PROM1-208ENST00000508322 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.38■■■■■ 4.22
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