RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508294.1

RASGEF1B-206, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 504 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-206ENST00000508294 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.26■■■■■ 6.44
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RASGEF1B-206ENST00000508294 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.59■■■■■ 5.53
RASGEF1B-206ENST00000508294 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.2■■■■■ 5.15
RASGEF1B-206ENST00000508294 NACADO15069 1562 aa46.85■■■■■ 5.09
RASGEF1B-206ENST00000508294 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.75■■■■■ 5.07
RASGEF1B-206ENST00000508294 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.67■■■■■ 5.06
RASGEF1B-206ENST00000508294 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.29■■■■■ 5
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RASGEF1B-206ENST00000508294 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.13■■■■■ 4.97
RASGEF1B-206ENST00000508294 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.91■■■■■ 4.94
RASGEF1B-206ENST00000508294 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
RASGEF1B-206ENST00000508294 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.56■■■■■ 4.88
RASGEF1B-206ENST00000508294 SCRIBQ14160 1630 aa45.3■■■■■ 4.84
RASGEF1B-206ENST00000508294 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.1■■■■■ 4.81
RASGEF1B-206ENST00000508294 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.88■■■■■ 4.78
RASGEF1B-206ENST00000508294 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.75■■■■■ 4.75
RASGEF1B-206ENST00000508294 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.72■■■■■ 4.75
RASGEF1B-206ENST00000508294 NCAPD3P42695 1498 aa43.25■■■■■ 4.51
RASGEF1B-206ENST00000508294 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.16■■■■■ 4.5
RASGEF1B-206ENST00000508294 SMARCA4P51532 1647 aa43.15■■■■■ 4.5
RASGEF1B-206ENST00000508294 SMARCA2P51531 1590 aa43■■■■■ 4.47
RASGEF1B-206ENST00000508294 HMGXB3Q12766 1538 aa42.94■■■■■ 4.46
RASGEF1B-206ENST00000508294 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.88■■■■■ 4.45
RASGEF1B-206ENST00000508294 ERCC6Q03468 1493 aa42.86■■■■■ 4.45
RASGEF1B-206ENST00000508294 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.76■■■■■ 4.44
RASGEF1B-206ENST00000508294 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
RASGEF1B-206ENST00000508294 NESP48681 1621 aa42.72■■■■■ 4.43
RASGEF1B-206ENST00000508294 CUX2O14529 1486 aa42.72■■■■■ 4.43
RASGEF1B-206ENST00000508294 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.65■■■■■ 4.42
RASGEF1B-206ENST00000508294 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.65■■■■■ 4.42
RASGEF1B-206ENST00000508294 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.3■■■■■ 4.36
RASGEF1B-206ENST00000508294 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
RASGEF1B-206ENST00000508294 WIZO95785 1651 aa42.18■■■■■ 4.34
RASGEF1B-206ENST00000508294 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.18■■■■■ 4.34
RASGEF1B-206ENST00000508294 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.03■■■■■ 4.32
RASGEF1B-206ENST00000508294 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.95■■■■■ 4.31
RASGEF1B-206ENST00000508294 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.72■■■■■ 4.27
RASGEF1B-206ENST00000508294 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.71■■■■■ 4.27
RASGEF1B-206ENST00000508294 WDR62O43379 1518 aa41.62■■■■■ 4.25
RASGEF1B-206ENST00000508294 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
RASGEF1B-206ENST00000508294 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.55■■■■■ 4.24
RASGEF1B-206ENST00000508294 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.52■■■■■ 4.24
RASGEF1B-206ENST00000508294 CFTRP13569 1480 aa41.47■■■■■ 4.23
RASGEF1B-206ENST00000508294 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
RASGEF1B-206ENST00000508294 PRDM2Q13029 1718 aa41.13■■■■■ 4.18
RASGEF1B-206ENST00000508294 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.1■■■■■ 4.17
RASGEF1B-206ENST00000508294 TRIM41Q8WV44 630 aa40.98■■■■■ 4.15
RASGEF1B-206ENST00000508294 OSCARQ8IYS5 282 aa40.79■■■■■ 4.12
RASGEF1B-206ENST00000508294 TOPBP1Q92547 1522 aa40.74■■■■■ 4.11
RASGEF1B-206ENST00000508294 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
RASGEF1B-206ENST00000508294 IFT140Q96RY7 1462 aa40.69■■■■■ 4.1
RASGEF1B-206ENST00000508294 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.57■■■■■ 4.09
RASGEF1B-206ENST00000508294 ABCC8Q09428 1581 aa40.54■■■■■ 4.08
RASGEF1B-206ENST00000508294 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
RASGEF1B-206ENST00000508294 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
RASGEF1B-206ENST00000508294 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.36■■■■■ 4.05
RASGEF1B-206ENST00000508294 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.36■■■■■ 4.05
RASGEF1B-206ENST00000508294 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.36■■■■■ 4.05
RASGEF1B-206ENST00000508294 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.34■■■■■ 4.05
RASGEF1B-206ENST00000508294 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.04
RASGEF1B-206ENST00000508294 CHD1O14646 1710 aa40.25■■■■■ 4.03
RASGEF1B-206ENST00000508294 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.23■■■■■ 4.03
RASGEF1B-206ENST00000508294 ARHGEF11O15085 1522 aa40.19■■■■■ 4.02
RASGEF1B-206ENST00000508294 SOGA1O94964 1423 aa40.12■■■■■ 4.01
RASGEF1B-206ENST00000508294 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
RASGEF1B-206ENST00000508294 FBLN2P98095 1184 aa40.09■■■■■ 4.01
RASGEF1B-206ENST00000508294 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.08■■■■■ 4.01
RASGEF1B-206ENST00000508294 CUX1P39880 1505 aa40.06■■■■■ 4
RASGEF1B-206ENST00000508294 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
RASGEF1B-206ENST00000508294 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.92■■■■□ 3.98
RASGEF1B-206ENST00000508294 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.91■■■■□ 3.98
RASGEF1B-206ENST00000508294 WDR97A6NE52 1622 aa39.86■■■■□ 3.97
RASGEF1B-206ENST00000508294 ARAP1Q96P48 1450 aa39.81■■■■□ 3.96
RASGEF1B-206ENST00000508294 GRIN2BQ13224 1484 aa39.75■■■■□ 3.95
RASGEF1B-206ENST00000508294 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
RASGEF1B-206ENST00000508294 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.73■■■■□ 3.95
RASGEF1B-206ENST00000508294 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.7■■■■□ 3.95
RASGEF1B-206ENST00000508294 PBRM1Q86U86 1689 aa39.7■■■■□ 3.95
RASGEF1B-206ENST00000508294 SYNJ1O43426 1573 aa39.65■■■■□ 3.94
RASGEF1B-206ENST00000508294 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.63■■■■□ 3.94
RASGEF1B-206ENST00000508294 SYNJ2O15056 1496 aa39.62■■■■□ 3.93
RASGEF1B-206ENST00000508294 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.58■■■■□ 3.93
RASGEF1B-206ENST00000508294 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.57■■■■□ 3.92
RASGEF1B-206ENST00000508294 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
RASGEF1B-206ENST00000508294 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.4■■■■□ 3.9
RASGEF1B-206ENST00000508294 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.4■■■■□ 3.9
RASGEF1B-206ENST00000508294 TOP2BQ02880 1626 aa39.37■■■■□ 3.89
RASGEF1B-206ENST00000508294 ADAMTS12P58397 1594 aa39.27■■■■□ 3.88
RASGEF1B-206ENST00000508294 GRIN2AQ12879 1464 aa39.27■■■■□ 3.88
RASGEF1B-206ENST00000508294 CEP170Q5SW79 1584 aa39.18■■■■□ 3.86
RASGEF1B-206ENST00000508294 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.18■■■■□ 3.86
RASGEF1B-206ENST00000508294 NUP160Q12769 1436 aa39.11■■■■□ 3.85
RASGEF1B-206ENST00000508294 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.1■■■■□ 3.85
RASGEF1B-206ENST00000508294 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.06■■■■□ 3.84
RASGEF1B-206ENST00000508294 SHROOM2Q13796 1616 aa38.98■■■■□ 3.83
RASGEF1B-206ENST00000508294 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.77■■■■□ 3.8
RASGEF1B-206ENST00000508294 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.73■■■■□ 3.79
RASGEF1B-206ENST00000508294 JPH4Q96JJ6 628 aa38.72■■■■□ 3.79
RASGEF1B-206ENST00000508294 IGF1RP08069 1367 aa38.58■■■■□ 3.77
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