RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		41.79	■■■■■ 4.28
MIB2-223	ENST00000508148	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		37.55	■■■■□ 3.6
MIB2-223	ENST00000508148	ABCC9	O60706	1549 aa		37.5	■■■■□ 3.59
MIB2-223	ENST00000508148	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		35.67	■■■■□ 3.3
MIB2-223	ENST00000508148	NACAD	O15069	1562 aa		35.42	■■■■□ 3.26
MIB2-223	ENST00000508148	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		35.19	■■■■□ 3.22
MIB2-223	ENST00000508148	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		35.08	■■■■□ 3.21
MIB2-223	ENST00000508148	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		35.08	■■■■□ 3.21
MIB2-223	ENST00000508148	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		34.93	■■■■□ 3.18
MIB2-223	ENST00000508148	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	34.85	■■■■□ 3.17
MIB2-223	ENST00000508148	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		34.76	■■■■□ 3.16
MIB2-223	ENST00000508148	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	34.67	■■■■□ 3.14
MIB2-223	ENST00000508148	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		34.5	■■■■□ 3.11
MIB2-223	ENST00000508148	SCRIB	Q14160	1630 aa		34.22	■■■■□ 3.07
MIB2-223	ENST00000508148	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		34.14	■■■■□ 3.06
MIB2-223	ENST00000508148	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		33.92	■■■■□ 3.02
MIB2-223	ENST00000508148	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	33.84	■■■■□ 3.01
MIB2-223	ENST00000508148	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		33.74	■■■□□ 2.99
MIB2-223	ENST00000508148	NCAPD3	P42695	1498 aa		32.68	■■■□□ 2.82
MIB2-223	ENST00000508148	SMARCA4	P51532	1647 aa		32.65	■■■□□ 2.82
MIB2-223	ENST00000508148	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		32.62	■■■□□ 2.81
MIB2-223	ENST00000508148	HMGXB3	Q12766	1538 aa		32.5	■■■□□ 2.79
MIB2-223	ENST00000508148	SMARCA2	P51531	1590 aa		32.49	■■■□□ 2.79
MIB2-223	ENST00000508148	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
MIB2-223	ENST00000508148	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		32.32	■■■□□ 2.76
MIB2-223	ENST00000508148	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.29	■■■□□ 2.76
MIB2-223	ENST00000508148	CUX2	O14529	1486 aa		32.27	■■■□□ 2.76
MIB2-223	ENST00000508148	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
MIB2-223	ENST00000508148	NES	P48681	1621 aa		32.26	■■■□□ 2.76
MIB2-223	ENST00000508148	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		32.25	■■■□□ 2.75
MIB2-223	ENST00000508148	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.2	■■■□□ 2.75
MIB2-223	ENST00000508148	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
MIB2-223	ENST00000508148	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		31.98	■■■□□ 2.71
MIB2-223	ENST00000508148	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		31.91	■■■□□ 2.7
MIB2-223	ENST00000508148	WIZ	O95785	1651 aa		31.89	■■■□□ 2.7
MIB2-223	ENST00000508148	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		31.69	■■■□□ 2.66
MIB2-223	ENST00000508148	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		31.67	■■■□□ 2.66
MIB2-223	ENST00000508148	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	31.52	■■■□□ 2.64
MIB2-223	ENST00000508148	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		31.51	■■■□□ 2.63
MIB2-223	ENST00000508148	WDR62	O43379	1518 aa		31.49	■■■□□ 2.63
MIB2-223	ENST00000508148	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
MIB2-223	ENST00000508148	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		31.37	■■■□□ 2.61
MIB2-223	ENST00000508148	CFTR	P13569	1480 aa		31.35	■■■□□ 2.61
MIB2-223	ENST00000508148	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		31.34	■■■□□ 2.61
MIB2-223	ENST00000508148	PRDM2	Q13029	1718 aa		31.18	■■■□□ 2.58
MIB2-223	ENST00000508148	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
MIB2-223	ENST00000508148	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		31.05	■■■□□ 2.56
MIB2-223	ENST00000508148	TOPBP1	Q92547	1522 aa		30.78	■■■□□ 2.52
MIB2-223	ENST00000508148	TRIM41	Q8WV44	630 aa		30.77	■■■□□ 2.52
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	30.77	■■■□□ 2.52
MIB2-223	ENST00000508148	IFT140	Q96RY7	1462 aa		30.73	■■■□□ 2.51
MIB2-223	ENST00000508148	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		30.68	■■■□□ 2.5
MIB2-223	ENST00000508148	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		30.68	■■■□□ 2.5
MIB2-223	ENST00000508148	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	30.62	■■■□□ 2.49
MIB2-223	ENST00000508148	ABCC8	Q09428	1581 aa		30.61	■■■□□ 2.49
MIB2-223	ENST00000508148	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	30.58	■■■□□ 2.49
MIB2-223	ENST00000508148	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		30.5	■■■□□ 2.47
MIB2-223	ENST00000508148	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		30.5	■■■□□ 2.47
MIB2-223	ENST00000508148	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		30.5	■■■□□ 2.47
MIB2-223	ENST00000508148	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	30.47	■■■□□ 2.47
MIB2-223	ENST00000508148	CHD1	O14646	1710 aa		30.44	■■■□□ 2.46
MIB2-223	ENST00000508148	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	30.43	■■■□□ 2.46	2e-10	■■□□□ 14.5
MIB2-223	ENST00000508148	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		30.37	■■■□□ 2.45
MIB2-223	ENST00000508148	ARHGEF11	O15085	1522 aa		30.36	■■■□□ 2.45
MIB2-223	ENST00000508148	CUX1	P39880	1505 aa		30.3	■■■□□ 2.44
MIB2-223	ENST00000508148	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		30.28	■■■□□ 2.44
MIB2-223	ENST00000508148	SOGA1	O94964	1423 aa		30.25	■■■□□ 2.43
MIB2-223	ENST00000508148	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	30.21	■■■□□ 2.43
MIB2-223	ENST00000508148	WDR97	A6NE52	1622 aa		30.19	■■■□□ 2.42
MIB2-223	ENST00000508148	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		30.15	■■■□□ 2.42
MIB2-223	ENST00000508148	FBLN2	P98095	1184 aa		30.1	■■■□□ 2.41
MIB2-223	ENST00000508148	ARAP1	Q96P48	1450 aa		30.08	■■■□□ 2.41
MIB2-223	ENST00000508148	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		30.05	■■■□□ 2.4
MIB2-223	ENST00000508148	PBRM1	Q86U86	1689 aa		30.04	■■■□□ 2.4
MIB2-223	ENST00000508148	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	30.02	■■■□□ 2.4
MIB2-223	ENST00000508148	GRIN2B	Q13224	1484 aa		30.01	■■■□□ 2.4
MIB2-223	ENST00000508148	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	30.01	■■■□□ 2.39
MIB2-223	ENST00000508148	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		30	■■■□□ 2.39
MIB2-223	ENST00000508148	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		29.96	■■■□□ 2.39
MIB2-223	ENST00000508148	SYNJ1	O43426	1573 aa		29.94	■■■□□ 2.38
MIB2-223	ENST00000508148	SYNJ2	O15056	1496 aa		29.93	■■■□□ 2.38
MIB2-223	ENST00000508148	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		29.92	■■■□□ 2.38
MIB2-223	ENST00000508148	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		29.92	■■■□□ 2.38
MIB2-223	ENST00000508148	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	29.87	■■■□□ 2.37
MIB2-223	ENST00000508148	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		29.84	■■■□□ 2.37
MIB2-223	ENST00000508148	TOP2B	Q02880	1626 aa		29.79	■■■□□ 2.36
MIB2-223	ENST00000508148	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.73	■■■□□ 2.35
MIB2-223	ENST00000508148	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	29.71	■■■□□ 2.35
MIB2-223	ENST00000508148	GRIN2A	Q12879	1464 aa		29.66	■■■□□ 2.34
MIB2-223	ENST00000508148	CEP170	Q5SW79	1584 aa		29.64	■■■□□ 2.33
MIB2-223	ENST00000508148	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		29.62	■■■□□ 2.33
MIB2-223	ENST00000508148	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	29.62	■■■□□ 2.33
MIB2-223	ENST00000508148	NUP160	Q12769	1436 aa		29.58	■■■□□ 2.33
MIB2-223	ENST00000508148	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.53	■■■□□ 2.32
MIB2-223	ENST00000508148	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		29.52	■■■□□ 2.32
MIB2-223	ENST00000508148	SHROOM2	Q13796	1616 aa		29.52	■■■□□ 2.32
MIB2-223	ENST00000508148	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.31	■■■□□ 2.28
MIB2-223	ENST00000508148	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
MIB2-223	ENST00000508148	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		29.16	■■■□□ 2.26
MIB2-223	ENST00000508148	JPH4	Q96JJ6	628 aa		29.16	■■■□□ 2.26

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