RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506596.5

ANKDD1B-202, Transcript of ankyrin repeat and death domain containing 1B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ANKDD1B, Length 1,815 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKDD1B-202ENST00000506596 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.15■■■■■ 5.62
ANKDD1B-202ENST00000506596 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.55■■■■■ 4.56
ANKDD1B-202ENST00000506596 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
ANKDD1B-202ENST00000506596 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.58■■■■■ 4.25
ANKDD1B-202ENST00000506596 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.23■■■■■ 4.19
ANKDD1B-202ENST00000506596 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.06■■■■■ 4.16
ANKDD1B-202ENST00000506596 ABCC9O60706 1549 aa40.97■■■■■ 4.15
ANKDD1B-202ENST00000506596 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.82■■■■■ 4.12
ANKDD1B-202ENST00000506596 NACADO15069 1562 aa40.62■■■■■ 4.09
ANKDD1B-202ENST00000506596 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.15■■■■■ 4.02
ANKDD1B-202ENST00000506596 SCRIBQ14160 1630 aa39.95■■■■□ 3.99
ANKDD1B-202ENST00000506596 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
ANKDD1B-202ENST00000506596 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.19■■■■□ 3.86
ANKDD1B-202ENST00000506596 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.01■■■■□ 3.83
ANKDD1B-202ENST00000506596 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.96■■■■□ 3.83
ANKDD1B-202ENST00000506596 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.91■■■■□ 3.82
ANKDD1B-202ENST00000506596 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.74■■■■□ 3.79
ANKDD1B-202ENST00000506596 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.7■■■■□ 3.79
ANKDD1B-202ENST00000506596 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.68■■■■□ 3.78
ANKDD1B-202ENST00000506596 SMARCA4P51532 1647 aa38.42■■■■□ 3.74
ANKDD1B-202ENST00000506596 WIZO95785 1651 aa38.29■■■■□ 3.72
ANKDD1B-202ENST00000506596 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.08■■■■□ 3.69
ANKDD1B-202ENST00000506596 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.02■■■■□ 3.68
ANKDD1B-202ENST00000506596 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
ANKDD1B-202ENST00000506596 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.85■■■■□ 3.65
ANKDD1B-202ENST00000506596 SMARCA2P51531 1590 aa37.8■■■■□ 3.64
ANKDD1B-202ENST00000506596 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
ANKDD1B-202ENST00000506596 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.65■■■■□ 3.62
ANKDD1B-202ENST00000506596 NCAPD3P42695 1498 aa37.58■■■■□ 3.61
ANKDD1B-202ENST00000506596 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
ANKDD1B-202ENST00000506596 HMGXB3Q12766 1538 aa37.44■■■■□ 3.58
ANKDD1B-202ENST00000506596 TRIM41Q8WV44 630 aa37.18■■■■□ 3.54
ANKDD1B-202ENST00000506596 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.1■■■■□ 3.53
ANKDD1B-202ENST00000506596 ABCC8Q09428 1581 aa36.77■■■■□ 3.48
ANKDD1B-202ENST00000506596 CFTRP13569 1480 aa36.75■■■■□ 3.47
ANKDD1B-202ENST00000506596 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.66■■■■□ 3.46
ANKDD1B-202ENST00000506596 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.6■■■■□ 3.45
ANKDD1B-202ENST00000506596 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.49■■■■□ 3.43
ANKDD1B-202ENST00000506596 SYNJ1O43426 1573 aa36.39■■■■□ 3.42
ANKDD1B-202ENST00000506596 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
ANKDD1B-202ENST00000506596 EEA1Q15075 1411 aa36.32■■■■□ 3.4
ANKDD1B-202ENST00000506596 PRDM2Q13029 1718 aa36.31■■■■□ 3.4
ANKDD1B-202ENST00000506596 TOP2BQ02880 1626 aa36.31■■■■□ 3.4
ANKDD1B-202ENST00000506596 SOGA1O94964 1423 aa36.24■■■■□ 3.39
ANKDD1B-202ENST00000506596 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.23■■■■□ 3.39
ANKDD1B-202ENST00000506596 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.2■■■■□ 3.39
ANKDD1B-202ENST00000506596 CUX1P39880 1505 aa36.16■■■■□ 3.38
ANKDD1B-202ENST00000506596 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.14■■■■□ 3.38
ANKDD1B-202ENST00000506596 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.11■■■■□ 3.37
ANKDD1B-202ENST00000506596 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.09■■■■□ 3.37
ANKDD1B-202ENST00000506596 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.06■■■■□ 3.36
ANKDD1B-202ENST00000506596 NESP48681 1621 aa36.05■■■■□ 3.36
ANKDD1B-202ENST00000506596 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.92■■■■□ 3.34
ANKDD1B-202ENST00000506596 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.81■■■■□ 3.32
ANKDD1B-202ENST00000506596 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.77■■■■□ 3.32
ANKDD1B-202ENST00000506596 KIF27Q86VH2 1401 aa35.74■■■■□ 3.31
ANKDD1B-202ENST00000506596 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.74■■■■□ 3.31
ANKDD1B-202ENST00000506596 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.72■■■■□ 3.31
ANKDD1B-202ENST00000506596 TOPBP1Q92547 1522 aa35.72■■■■□ 3.31
ANKDD1B-202ENST00000506596 GOLGA3Q08378 1498 aa35.71■■■■□ 3.31
ANKDD1B-202ENST00000506596 KIF21BO75037 1637 aa35.7■■■■□ 3.31
ANKDD1B-202ENST00000506596 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.7■■■■□ 3.31
ANKDD1B-202ENST00000506596 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
ANKDD1B-202ENST00000506596 PRXQ9BXM0 1461 aa35.59■■■■□ 3.29
ANKDD1B-202ENST00000506596 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
ANKDD1B-202ENST00000506596 CUX2O14529 1486 aa35.53■■■■□ 3.28
ANKDD1B-202ENST00000506596 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.53■■■■□ 3.28
ANKDD1B-202ENST00000506596 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.5■■■■□ 3.27
ANKDD1B-202ENST00000506596 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.5■■■■□ 3.27
ANKDD1B-202ENST00000506596 IGF1RP08069 1367 aa35.49■■■■□ 3.27
ANKDD1B-202ENST00000506596 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.48■■■■□ 3.27
ANKDD1B-202ENST00000506596 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.48■■■■□ 3.27
ANKDD1B-202ENST00000506596 CEP162Q5TB80 1403 aa35.44■■■■□ 3.26
ANKDD1B-202ENST00000506596 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.41■■■■□ 3.26
ANKDD1B-202ENST00000506596 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.38■■■■□ 3.25
ANKDD1B-202ENST00000506596 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.25■■■■□ 3.23
ANKDD1B-202ENST00000506596 WDR97A6NE52 1622 aa35.21■■■■□ 3.23
ANKDD1B-202ENST00000506596 WDR62O43379 1518 aa35.19■■■■□ 3.22
ANKDD1B-202ENST00000506596 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.15■■■■□ 3.22
ANKDD1B-202ENST00000506596 CLIP1P30622 1438 aa35.15■■■■□ 3.22
ANKDD1B-202ENST00000506596 ERCC6Q03468 1493 aa35.1■■■■□ 3.21
ANKDD1B-202ENST00000506596 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.09■■■■□ 3.21
ANKDD1B-202ENST00000506596 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
ANKDD1B-202ENST00000506596 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.07■■■■□ 3.21
ANKDD1B-202ENST00000506596 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
ANKDD1B-202ENST00000506596 IFT140Q96RY7 1462 aa35.02■■■■□ 3.2
ANKDD1B-202ENST00000506596 CUL7Q14999 1698 aa35.01■■■■□ 3.2
ANKDD1B-202ENST00000506596 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
ANKDD1B-202ENST00000506596 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.95■■■■□ 3.19
ANKDD1B-202ENST00000506596 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.89■■■■□ 3.18
ANKDD1B-202ENST00000506596 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.83■■■■□ 3.17
ANKDD1B-202ENST00000506596 GRIN2BQ13224 1484 aa34.79■■■■□ 3.16
ANKDD1B-202ENST00000506596 ARAP1Q96P48 1450 aa34.76■■■■□ 3.16
ANKDD1B-202ENST00000506596 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.76■■■■□ 3.16
ANKDD1B-202ENST00000506596 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.75■■■■□ 3.15
ANKDD1B-202ENST00000506596 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.74■■■■□ 3.15
ANKDD1B-202ENST00000506596 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
ANKDD1B-202ENST00000506596 PBRM1Q86U86 1689 aa34.68■■■■□ 3.14
ANKDD1B-202ENST00000506596 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
ANKDD1B-202ENST00000506596 ADAMTS12P58397 1594 aa34.6■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms