RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505464.1

ICE1-202, Transcript of interactor of little elongation complex ELL subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene ICE1, Length 1,074 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1-202ENST00000505464 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.83■■■■■ 5.89
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ICE1-202ENST00000505464 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.58■■■■■ 4.57
ICE1-202ENST00000505464 NACADO15069 1562 aa43.46■■■■■ 4.55
ICE1-202ENST00000505464 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.42■■■■■ 4.54
ICE1-202ENST00000505464 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.13■■■■■ 4.49
ICE1-202ENST00000505464 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.07■■■■■ 4.48
ICE1-202ENST00000505464 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.8■■■■■ 4.44
ICE1-202ENST00000505464 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.68■■■■■ 4.42
ICE1-202ENST00000505464 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.53■■■■■ 4.4
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ICE1-202ENST00000505464 SCRIBQ14160 1630 aa42.2■■■■■ 4.35
ICE1-202ENST00000505464 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.13■■■■■ 4.33
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ICE1-202ENST00000505464 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.16■■■■■ 4.18
ICE1-202ENST00000505464 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.91■■■■■ 4.14
ICE1-202ENST00000505464 SMARCA4P51532 1647 aa40.29■■■■■ 4.04
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ICE1-202ENST00000505464 NCAPD3P42695 1498 aa40.13■■■■■ 4.01
ICE1-202ENST00000505464 SMARCA2P51531 1590 aa40.01■■■■■ 4
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ICE1-202ENST00000505464 CUX2O14529 1486 aa38.87■■■■□ 3.81
ICE1-202ENST00000505464 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.85■■■■□ 3.81
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ICE1-202ENST00000505464 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.63■■■■□ 3.77
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ICE1-202ENST00000505464 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.5■■■■□ 3.75
ICE1-202ENST00000505464 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.49■■■■□ 3.75
ICE1-202ENST00000505464 WDR62O43379 1518 aa38.39■■■■□ 3.74
ICE1-202ENST00000505464 PRDM2Q13029 1718 aa38.32■■■■□ 3.73
ICE1-202ENST00000505464 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.21■■■■□ 3.71
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ICE1-202ENST00000505464 TOPBP1Q92547 1522 aa37.89■■■■□ 3.66
ICE1-202ENST00000505464 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.8■■■■□ 3.64
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ICE1-202ENST00000505464 IFT140Q96RY7 1462 aa37.67■■■■□ 3.62
ICE1-202ENST00000505464 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
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ICE1-202ENST00000505464 SOGA1O94964 1423 aa37.36■■■■□ 3.57
ICE1-202ENST00000505464 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.36■■■■□ 3.57
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ICE1-202ENST00000505464 OSCARQ8IYS5 282 aa37.19■■■■□ 3.54
ICE1-202ENST00000505464 WDR97A6NE52 1622 aa37.14■■■■□ 3.54
ICE1-202ENST00000505464 SYNJ1O43426 1573 aa37.12■■■■□ 3.53
ICE1-202ENST00000505464 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.12■■■■□ 3.53
ICE1-202ENST00000505464 TOP2BQ02880 1626 aa37.08■■■■□ 3.53
ICE1-202ENST00000505464 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.08■■■■□ 3.53
ICE1-202ENST00000505464 CHD1O14646 1710 aa37.02■■■■□ 3.52
ICE1-202ENST00000505464 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37■■■■□ 3.51
ICE1-202ENST00000505464 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37■■■■□ 3.51
ICE1-202ENST00000505464 GRIN2BQ13224 1484 aa36.94■■■■□ 3.5
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ICE1-202ENST00000505464 PBRM1Q86U86 1689 aa36.89■■■■□ 3.5
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ICE1-202ENST00000505464 SYNJ2O15056 1496 aa36.75■■■■□ 3.47
ICE1-202ENST00000505464 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
ICE1-202ENST00000505464 TRIM41Q8WV44 630 aa36.73■■■■□ 3.47
ICE1-202ENST00000505464 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.73■■■■□ 3.47
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ICE1-202ENST00000505464 ARHGEF11O15085 1522 aa36.68■■■■□ 3.46
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ICE1-202ENST00000505464 CEP170Q5SW79 1584 aa36.38■■■■□ 3.41
ICE1-202ENST00000505464 NUP160Q12769 1436 aa36.34■■■■□ 3.41
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ICE1-202ENST00000505464 IGF1RP08069 1367 aa36.27■■■■□ 3.4
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ICE1-202ENST00000505464 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.02■■■■□ 3.36
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