RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505295.1

CKMT2-AS1-205, CKMT2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CKMT2-AS1, Length 909 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.8■■■□□ 2.2
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.54■■□□□ 1.68
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ABCC9O60706 1549 aa25.02■■□□□ 1.6
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.1■■□□□ 1.45
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.05■■□□□ 1.44
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 NACADO15069 1562 aa24.04■■□□□ 1.44
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.91■■□□□ 1.42
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.82■■□□□ 1.4
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.5■■□□□ 1.35
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.34
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.35■■□□□ 1.33
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 SCRIBQ14160 1630 aa23.31■■□□□ 1.32
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.06■■□□□ 1.28
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.03■■□□□ 1.28
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.62■■□□□ 1.21
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.47■■□□□ 1.19
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 SMARCA4P51532 1647 aa22.31■■□□□ 1.16
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 NCAPD3P42695 1498 aa22.22■■□□□ 1.15
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.22■■□□□ 1.15
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.2■■□□□ 1.14
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 SMARCA2P51531 1590 aa22.16■■□□□ 1.14
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.12■■□□□ 1.13
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 HMGXB3Q12766 1538 aa22.06■■□□□ 1.12
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 WIZO95785 1651 aa21.95■■□□□ 1.1
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 NESP48681 1621 aa21.67■■□□□ 1.06
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.58■■□□□ 1.05
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.58■■□□□ 1.04
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ERCC6Q03468 1493 aa21.54■■□□□ 1.04
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.49■■□□□ 1.03
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.46■■□□□ 1.03
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CFTRP13569 1480 aa21.45■■□□□ 1.02
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.37■■□□□ 1.01
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CUX2O14529 1486 aa21.31■■□□□ 1
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.3■■□□□ 1
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.25■□□□□ 0.99
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.23■□□□□ 0.99
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 PRDM2Q13029 1718 aa21.2■□□□□ 0.98
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 WDR62O43379 1518 aa21.15■□□□□ 0.98
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 TOPBP1Q92547 1522 aa20.96■□□□□ 0.95
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ABCC8Q09428 1581 aa20.96■□□□□ 0.95
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.92■□□□□ 0.94
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CUX1P39880 1505 aa20.82■□□□□ 0.92
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 IFT140Q96RY7 1462 aa20.81■□□□□ 0.92
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.74■□□□□ 0.91
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.73■□□□□ 0.91
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 SOGA1O94964 1423 aa20.72■□□□□ 0.91
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.72■□□□□ 0.91
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.71■□□□□ 0.91
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.7■□□□□ 0.9
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.89
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 TOP2BQ02880 1626 aa20.63■□□□□ 0.89
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 SYNJ1O43426 1573 aa20.63■□□□□ 0.89
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.61■□□□□ 0.89
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.53■□□□□ 0.88
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 WDR97A6NE52 1622 aa20.53■□□□□ 0.88
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 OSCARQ8IYS5 282 aa20.49■□□□□ 0.87
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.47■□□□□ 0.87
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 GRIN2BQ13224 1484 aa20.45■□□□□ 0.86
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.42■□□□□ 0.86
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.41■□□□□ 0.86
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 FBLN2P98095 1184 aa20.39■□□□□ 0.85
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 PBRM1Q86U86 1689 aa20.37■□□□□ 0.85
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CHD1O14646 1710 aa20.35■□□□□ 0.85
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 SYNJ2O15056 1496 aa20.32■□□□□ 0.84
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.28■□□□□ 0.84
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 TRIM41Q8WV44 630 aa20.26■□□□□ 0.83
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 KIF27Q86VH2 1401 aa20.26■□□□□ 0.83
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.23■□□□□ 0.83
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 IGF1RP08069 1367 aa20.22■□□□□ 0.83
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ADAMTS12P58397 1594 aa20.22■□□□□ 0.83
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 GRIN2AQ12879 1464 aa20.19■□□□□ 0.82
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.15■□□□□ 0.82
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.12■□□□□ 0.81
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 NUP160Q12769 1436 aa20.11■□□□□ 0.81
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ARHGEF11O15085 1522 aa20.11■□□□□ 0.81
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.09■□□□□ 0.81
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.09■□□□□ 0.81
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.09■□□□□ 0.81
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CEP170Q5SW79 1584 aa20.08■□□□□ 0.81
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.08■□□□□ 0.8
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CUL7Q14999 1698 aa20.07■□□□□ 0.8
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CHIC1Q5VXU3 224 aa20.05■□□□□ 0.8
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 CYB5RLQ6IPT4 315 aa19.97■□□□□ 0.79
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 ARAP1Q96P48 1450 aa19.95■□□□□ 0.78
CKMT2-AS1-205ENST00000505295 JPH4Q96JJ6 628 aa19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms