RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504863.1

RASGEF1B-204, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 5

Gene RASGEF1B, Length 860 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-204ENST00000504863 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.11■■■■□ 3.69
RASGEF1B-204ENST00000504863 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.2■■■■□ 3.07
RASGEF1B-204ENST00000504863 ABCC9O60706 1549 aa33.72■■■□□ 2.99
RASGEF1B-204ENST00000504863 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.34■■■□□ 2.77
RASGEF1B-204ENST00000504863 NACADO15069 1562 aa32.18■■■□□ 2.74
RASGEF1B-204ENST00000504863 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.86■■■□□ 2.69
RASGEF1B-204ENST00000504863 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.85■■■□□ 2.69
RASGEF1B-204ENST00000504863 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.7■■■□□ 2.66
RASGEF1B-204ENST00000504863 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.61■■■□□ 2.65
RASGEF1B-204ENST00000504863 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.55■■■□□ 2.64
RASGEF1B-204ENST00000504863 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.33■■■□□ 2.61
RASGEF1B-204ENST00000504863 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.31■■■□□ 2.6
RASGEF1B-204ENST00000504863 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.15■■■□□ 2.58
RASGEF1B-204ENST00000504863 SCRIBQ14160 1630 aa31.1■■■□□ 2.57
RASGEF1B-204ENST00000504863 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.07■■■□□ 2.56
RASGEF1B-204ENST00000504863 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
RASGEF1B-204ENST00000504863 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.53■■■□□ 2.48
RASGEF1B-204ENST00000504863 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.36■■■□□ 2.45
RASGEF1B-204ENST00000504863 SMARCA4P51532 1647 aa29.71■■■□□ 2.35
RASGEF1B-204ENST00000504863 NCAPD3P42695 1498 aa29.63■■■□□ 2.33
RASGEF1B-204ENST00000504863 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
RASGEF1B-204ENST00000504863 SMARCA2P51531 1590 aa29.61■■■□□ 2.33
RASGEF1B-204ENST00000504863 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.59■■■□□ 2.33
RASGEF1B-204ENST00000504863 HMGXB3Q12766 1538 aa29.55■■■□□ 2.32
RASGEF1B-204ENST00000504863 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.43■■■□□ 2.3
RASGEF1B-204ENST00000504863 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
RASGEF1B-204ENST00000504863 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.34■■■□□ 2.29
RASGEF1B-204ENST00000504863 ERCC6Q03468 1493 aa29.15■■■□□ 2.26
RASGEF1B-204ENST00000504863 NESP48681 1621 aa29.04■■■□□ 2.24
RASGEF1B-204ENST00000504863 WIZO95785 1651 aa29.03■■■□□ 2.24
RASGEF1B-204ENST00000504863 CUX2O14529 1486 aa29.01■■■□□ 2.23
RASGEF1B-204ENST00000504863 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.01■■■□□ 2.23
RASGEF1B-204ENST00000504863 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.82■■■□□ 2.2
RASGEF1B-204ENST00000504863 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
RASGEF1B-204ENST00000504863 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.78■■■□□ 2.2
RASGEF1B-204ENST00000504863 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.77■■■□□ 2.2
RASGEF1B-204ENST00000504863 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
RASGEF1B-204ENST00000504863 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.72■■■□□ 2.19
RASGEF1B-204ENST00000504863 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.53■■■□□ 2.16
RASGEF1B-204ENST00000504863 CFTRP13569 1480 aa28.5■■■□□ 2.15
RASGEF1B-204ENST00000504863 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.5■■■□□ 2.15
RASGEF1B-204ENST00000504863 WDR62O43379 1518 aa28.47■■■□□ 2.15
RASGEF1B-204ENST00000504863 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.45■■■□□ 2.14
RASGEF1B-204ENST00000504863 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.45■■■□□ 2.14
RASGEF1B-204ENST00000504863 PRDM2Q13029 1718 aa28.4■■■□□ 2.14
RASGEF1B-204ENST00000504863 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.31■■■□□ 2.12
RASGEF1B-204ENST00000504863 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
RASGEF1B-204ENST00000504863 TOPBP1Q92547 1522 aa27.95■■■□□ 2.06
RASGEF1B-204ENST00000504863 ABCC8Q09428 1581 aa27.94■■■□□ 2.06
RASGEF1B-204ENST00000504863 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.93■■■□□ 2.06
RASGEF1B-204ENST00000504863 IFT140Q96RY7 1462 aa27.89■■■□□ 2.05
RASGEF1B-204ENST00000504863 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
RASGEF1B-204ENST00000504863 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
RASGEF1B-204ENST00000504863 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
RASGEF1B-204ENST00000504863 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
RASGEF1B-204ENST00000504863 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
RASGEF1B-204ENST00000504863 OSCARQ8IYS5 282 aa27.59■■■□□ 2.01
RASGEF1B-204ENST00000504863 CUX1P39880 1505 aa27.57■■■□□ 2
RASGEF1B-204ENST00000504863 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.57■■■□□ 2
RASGEF1B-204ENST00000504863 WDR97A6NE52 1622 aa27.54■■■□□ 2
RASGEF1B-204ENST00000504863 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.51■■■□□ 2
RASGEF1B-204ENST00000504863 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.51■■□□□ 1.99
RASGEF1B-204ENST00000504863 SOGA1O94964 1423 aa27.5■■□□□ 1.99
RASGEF1B-204ENST00000504863 CHD1O14646 1710 aa27.46■■□□□ 1.99
RASGEF1B-204ENST00000504863 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
RASGEF1B-204ENST00000504863 TRIM41Q8WV44 630 aa27.35■■□□□ 1.97
RASGEF1B-204ENST00000504863 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.33■■□□□ 1.97
RASGEF1B-204ENST00000504863 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.33■■□□□ 1.97
RASGEF1B-204ENST00000504863 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.33■■□□□ 1.97
RASGEF1B-204ENST00000504863 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.32■■□□□ 1.96
RASGEF1B-204ENST00000504863 PBRM1Q86U86 1689 aa27.3■■□□□ 1.96
RASGEF1B-204ENST00000504863 GRIN2BQ13224 1484 aa27.3■■□□□ 1.96
RASGEF1B-204ENST00000504863 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
RASGEF1B-204ENST00000504863 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.3■■□□□ 1.96
RASGEF1B-204ENST00000504863 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.27■■□□□ 1.96
RASGEF1B-204ENST00000504863 TOP2BQ02880 1626 aa27.27■■□□□ 1.96
RASGEF1B-204ENST00000504863 ARHGEF11O15085 1522 aa27.26■■□□□ 1.96
RASGEF1B-204ENST00000504863 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.26■■□□□ 1.95
RASGEF1B-204ENST00000504863 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.24■■□□□ 1.95
RASGEF1B-204ENST00000504863 FBLN2P98095 1184 aa27.23■■□□□ 1.95
RASGEF1B-204ENST00000504863 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.23■■□□□ 1.95
RASGEF1B-204ENST00000504863 SYNJ1O43426 1573 aa27.22■■□□□ 1.95
RASGEF1B-204ENST00000504863 SYNJ2O15056 1496 aa27.18■■□□□ 1.94
RASGEF1B-204ENST00000504863 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.12■■□□□ 1.93
RASGEF1B-204ENST00000504863 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
RASGEF1B-204ENST00000504863 ADAMTS12P58397 1594 aa27.05■■□□□ 1.92
RASGEF1B-204ENST00000504863 ARAP1Q96P48 1450 aa27■■□□□ 1.91
RASGEF1B-204ENST00000504863 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.96■■□□□ 1.91
RASGEF1B-204ENST00000504863 GRIN2AQ12879 1464 aa26.96■■□□□ 1.91
RASGEF1B-204ENST00000504863 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.9■■□□□ 1.9
RASGEF1B-204ENST00000504863 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.9■■□□□ 1.9
RASGEF1B-204ENST00000504863 CEP170Q5SW79 1584 aa26.84■■□□□ 1.89
RASGEF1B-204ENST00000504863 NUP160Q12769 1436 aa26.83■■□□□ 1.89
RASGEF1B-204ENST00000504863 SHROOM2Q13796 1616 aa26.73■■□□□ 1.87
RASGEF1B-204ENST00000504863 KIF27Q86VH2 1401 aa26.71■■□□□ 1.87
RASGEF1B-204ENST00000504863 CUL7Q14999 1698 aa26.7■■□□□ 1.87
RASGEF1B-204ENST00000504863 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.66■■□□□ 1.86
RASGEF1B-204ENST00000504863 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.66■■□□□ 1.86
RASGEF1B-204ENST00000504863 IGF1RP08069 1367 aa26.55■■□□□ 1.84
RASGEF1B-204ENST00000504863 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
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