RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504406.5

F12-204, Transcript of coagulation factor XII, humanhuman

TSL 2

Gene F12, Length 943 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F12-204ENST00000504406 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.73■■■■■ 6.51
F12-204ENST00000504406 ABCC9O60706 1549 aa49.99■■■■■ 5.59
F12-204ENST00000504406 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.95■■■■■ 5.59
F12-204ENST00000504406 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.5■■■■■ 5.19
F12-204ENST00000504406 NACADO15069 1562 aa47.17■■■■■ 5.14
F12-204ENST00000504406 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47■■■■■ 5.11
F12-204ENST00000504406 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.84■■■■■ 5.09
F12-204ENST00000504406 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.56■■■■■ 5.04
F12-204ENST00000504406 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.55■■■■■ 5.04
F12-204ENST00000504406 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.5■■■■■ 5.03
F12-204ENST00000504406 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.24■■■■■ 4.99
F12-204ENST00000504406 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.23■■■■■ 4.99
F12-204ENST00000504406 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.97■■■■■ 4.95
F12-204ENST00000504406 SCRIBQ14160 1630 aa45.66■■■■■ 4.9
F12-204ENST00000504406 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.42■■■■■ 4.86
F12-204ENST00000504406 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.13■■■■■ 4.82
F12-204ENST00000504406 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.05■■■■■ 4.8
F12-204ENST00000504406 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.97■■■■■ 4.79
F12-204ENST00000504406 NCAPD3P42695 1498 aa43.56■■■■■ 4.56
F12-204ENST00000504406 SMARCA4P51532 1647 aa43.5■■■■■ 4.55
F12-204ENST00000504406 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.49■■■■■ 4.55
F12-204ENST00000504406 SMARCA2P51531 1590 aa43.32■■■■■ 4.52
F12-204ENST00000504406 HMGXB3Q12766 1538 aa43.27■■■■■ 4.52
F12-204ENST00000504406 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.23■■■■■ 4.51
F12-204ENST00000504406 ERCC6Q03468 1493 aa43.08■■■■■ 4.49
F12-204ENST00000504406 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.06■■■■■ 4.48
F12-204ENST00000504406 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.02■■■■■ 4.48
F12-204ENST00000504406 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.01■■■■■ 4.48
F12-204ENST00000504406 NESP48681 1621 aa43■■■■■ 4.47
F12-204ENST00000504406 CUX2O14529 1486 aa42.94■■■■■ 4.46
F12-204ENST00000504406 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.82■■■■■ 4.45
F12-204ENST00000504406 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.57■■■■■ 4.41
F12-204ENST00000504406 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
F12-204ENST00000504406 WIZO95785 1651 aa42.52■■■■■ 4.4
F12-204ENST00000504406 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.44■■■■■ 4.38
F12-204ENST00000504406 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.29■■■■■ 4.36
F12-204ENST00000504406 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.25■■■■■ 4.35
F12-204ENST00000504406 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
F12-204ENST00000504406 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.99■■■■■ 4.31
F12-204ENST00000504406 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
F12-204ENST00000504406 WDR62O43379 1518 aa41.9■■■■■ 4.3
F12-204ENST00000504406 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.84■■■■■ 4.29
F12-204ENST00000504406 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.81■■■■■ 4.28
F12-204ENST00000504406 CFTRP13569 1480 aa41.8■■■■■ 4.28
F12-204ENST00000504406 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
F12-204ENST00000504406 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.46■■■■■ 4.23
F12-204ENST00000504406 PRDM2Q13029 1718 aa41.41■■■■■ 4.22
F12-204ENST00000504406 TRIM41Q8WV44 630 aa41.06■■■■■ 4.16
F12-204ENST00000504406 TOPBP1Q92547 1522 aa41.04■■■■■ 4.16
F12-204ENST00000504406 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
F12-204ENST00000504406 IFT140Q96RY7 1462 aa40.97■■■■■ 4.15
F12-204ENST00000504406 OSCARQ8IYS5 282 aa40.94■■■■■ 4.14
F12-204ENST00000504406 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.89■■■■■ 4.14
F12-204ENST00000504406 ABCC8Q09428 1581 aa40.81■■■■■ 4.12
F12-204ENST00000504406 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.78■■■■■ 4.12
F12-204ENST00000504406 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.7■■■■■ 4.11
F12-204ENST00000504406 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
F12-204ENST00000504406 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.62■■■■■ 4.09
F12-204ENST00000504406 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.55■■■■■ 4.08
F12-204ENST00000504406 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.55■■■■■ 4.08
F12-204ENST00000504406 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.55■■■■■ 4.08
F12-204ENST00000504406 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.53■■■■■ 4.08
F12-204ENST00000504406 CHD1O14646 1710 aa40.47■■■■■ 4.07
F12-204ENST00000504406 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.41■■■■■ 4.06
F12-204ENST00000504406 ARHGEF11O15085 1522 aa40.41■■■■■ 4.06
F12-204ENST00000504406 CUX1P39880 1505 aa40.41■■■■■ 4.06
F12-204ENST00000504406 SOGA1O94964 1423 aa40.4■■■■■ 4.06
F12-204ENST00000504406 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
F12-204ENST00000504406 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
F12-204ENST00000504406 FBLN2P98095 1184 aa40.28■■■■■ 4.04
F12-204ENST00000504406 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.21■■■■■ 4.03
F12-204ENST00000504406 WDR97A6NE52 1622 aa40.16■■■■■ 4.02
F12-204ENST00000504406 ARAP1Q96P48 1450 aa40.06■■■■■ 4
F12-204ENST00000504406 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.05■■■■■ 4
F12-204ENST00000504406 GRIN2BQ13224 1484 aa40.04■■■■■ 4
F12-204ENST00000504406 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.02■■■■■ 4
F12-204ENST00000504406 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.98■■■■□ 3.99
F12-204ENST00000504406 PBRM1Q86U86 1689 aa39.97■■■■□ 3.99
F12-204ENST00000504406 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
F12-204ENST00000504406 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.93■■■■□ 3.98
F12-204ENST00000504406 SYNJ2O15056 1496 aa39.91■■■■□ 3.98
F12-204ENST00000504406 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.91■■■■□ 3.98
F12-204ENST00000504406 SYNJ1O43426 1573 aa39.89■■■■□ 3.98
F12-204ENST00000504406 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.89■■■■□ 3.98
F12-204ENST00000504406 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.74■■■■□ 3.95
F12-204ENST00000504406 TOP2BQ02880 1626 aa39.73■■■■□ 3.95
F12-204ENST00000504406 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.72■■■■□ 3.95
F12-204ENST00000504406 ADAMTS12P58397 1594 aa39.6■■■■□ 3.93
F12-204ENST00000504406 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.93
F12-204ENST00000504406 GRIN2AQ12879 1464 aa39.56■■■■□ 3.92
F12-204ENST00000504406 CEP170Q5SW79 1584 aa39.48■■■■□ 3.91
F12-204ENST00000504406 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.46■■■■□ 3.91
F12-204ENST00000504406 NUP160Q12769 1436 aa39.42■■■■□ 3.9
F12-204ENST00000504406 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.4■■■■□ 3.9
F12-204ENST00000504406 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.38■■■■□ 3.89
F12-204ENST00000504406 SHROOM2Q13796 1616 aa39.25■■■■□ 3.87
F12-204ENST00000504406 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.04■■■■□ 3.84
F12-204ENST00000504406 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
F12-204ENST00000504406 JPH4Q96JJ6 628 aa38.95■■■■□ 3.83
F12-204ENST00000504406 IGF1RP08069 1367 aa38.91■■■■□ 3.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms