RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504270.2

CD27-AS1-204, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 700 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-204ENST00000504270 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.78■■□□□ 1.88
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CD27-AS1-204ENST00000504270 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.32■■□□□ 1.16
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CD27-AS1-204ENST00000504270 SCRIBQ14160 1630 aa22.15■■□□□ 1.14
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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CD27-AS1-204ENST00000504270 NESP48681 1621 aa21.12■□□□□ 0.97
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CD27-AS1-204ENST00000504270 SMARCA4P51532 1647 aa21.04■□□□□ 0.96
CD27-AS1-204ENST00000504270 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
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CD27-AS1-204ENST00000504270 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.92■□□□□ 0.94
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRIM41Q8WV44 630 aa20.9■□□□□ 0.94
CD27-AS1-204ENST00000504270 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.89■□□□□ 0.93
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CD27-AS1-204ENST00000504270 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.56■□□□□ 0.88
CD27-AS1-204ENST00000504270 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.45■□□□□ 0.86
CD27-AS1-204ENST00000504270 WIZO95785 1651 aa20.43■□□□□ 0.86
CD27-AS1-204ENST00000504270 OSCARQ8IYS5 282 aa20.39■□□□□ 0.85
CD27-AS1-204ENST00000504270 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.37■□□□□ 0.85
CD27-AS1-204ENST00000504270 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.3■□□□□ 0.84
CD27-AS1-204ENST00000504270 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.3■□□□□ 0.84
CD27-AS1-204ENST00000504270 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.3■□□□□ 0.84
CD27-AS1-204ENST00000504270 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
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CD27-AS1-204ENST00000504270 TOPBP1Q92547 1522 aa19.94■□□□□ 0.78
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CD27-AS1-204ENST00000504270 CCDC88BA6NC98 1476 aa19.85■□□□□ 0.77
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CD27-AS1-204ENST00000504270 ABCC8Q09428 1581 aa19.83■□□□□ 0.76
CD27-AS1-204ENST00000504270 FBLN2P98095 1184 aa19.8■□□□□ 0.76
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CD27-AS1-204ENST00000504270 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.66■□□□□ 0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.65■□□□□ 0.74
CD27-AS1-204ENST00000504270 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa19.63■□□□□ 0.73
CD27-AS1-204ENST00000504270 SYNJ1O43426 1573 aa19.61■□□□□ 0.73
CD27-AS1-204ENST00000504270 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
CD27-AS1-204ENST00000504270 SOGA1O94964 1423 aa19.59■□□□□ 0.73
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CD27-AS1-204ENST00000504270 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.53■□□□□ 0.72
CD27-AS1-204ENST00000504270 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
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CD27-AS1-204ENST00000504270 SYNJ2O15056 1496 aa19.47■□□□□ 0.71
CD27-AS1-204ENST00000504270 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.47■□□□□ 0.71
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CD27-AS1-204ENST00000504270 CEP170Q5SW79 1584 aa19.26■□□□□ 0.67
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CD27-AS1-204ENST00000504270 ADAMTS12P58397 1594 aa19.21■□□□□ 0.67
CD27-AS1-204ENST00000504270 SHROOM2Q13796 1616 aa19.19■□□□□ 0.66
CD27-AS1-204ENST00000504270 NUP160Q12769 1436 aa19.17■□□□□ 0.66
CD27-AS1-204ENST00000504270 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.07■□□□□ 0.64
CD27-AS1-204ENST00000504270 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.06■□□□□ 0.64
CD27-AS1-204ENST00000504270 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.04■□□□□ 0.64
CD27-AS1-204ENST00000504270 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.03■□□□□ 0.64
CD27-AS1-204ENST00000504270 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.01■□□□□ 0.63
CD27-AS1-204ENST00000504270 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19■□□□□ 0.63
CD27-AS1-204ENST00000504270 ABCC10Q5T3U5 1492 aa19■□□□□ 0.63
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