RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504162.1

CDK18-212, Transcript of cyclin dependent kinase 18, humanhuman

TSL 4

Gene CDK18, Length 556 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18-212ENST00000504162 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.25■■■■■ 6.11
CDK18-212ENST00000504162 ABCC9O60706 1549 aa47.87■■■■■ 5.25
CDK18-212ENST00000504162 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.78■■■■■ 5.24
CDK18-212ENST00000504162 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.48■■■■■ 4.87
CDK18-212ENST00000504162 NACADO15069 1562 aa45.16■■■■■ 4.82
CDK18-212ENST00000504162 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.06■■■■■ 4.8
CDK18-212ENST00000504162 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.9■■■■■ 4.78
CDK18-212ENST00000504162 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.64■■■■■ 4.74
CDK18-212ENST00000504162 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.57■■■■■ 4.734e-9■□□□□ 8.6
CDK18-212ENST00000504162 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.51■■■■■ 4.72
CDK18-212ENST00000504162 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.3■■■■■ 4.68
CDK18-212ENST00000504162 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
CDK18-212ENST00000504162 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.94■■■■■ 4.63
CDK18-212ENST00000504162 SCRIBQ14160 1630 aa43.58■■■■■ 4.57
CDK18-212ENST00000504162 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.51■■■■■ 4.56
CDK18-212ENST00000504162 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.26■■■■■ 4.52
CDK18-212ENST00000504162 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.13■■■■■ 4.5
CDK18-212ENST00000504162 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.09■■■■■ 4.49
CDK18-212ENST00000504162 NCAPD3P42695 1498 aa41.72■■■■■ 4.27
CDK18-212ENST00000504162 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.6■■■■■ 4.25
CDK18-212ENST00000504162 SMARCA4P51532 1647 aa41.56■■■■■ 4.24
CDK18-212ENST00000504162 SMARCA2P51531 1590 aa41.42■■■■■ 4.22
CDK18-212ENST00000504162 HMGXB3Q12766 1538 aa41.39■■■■■ 4.22
CDK18-212ENST00000504162 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.3■■■■■ 4.2
CDK18-212ENST00000504162 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.29■■■■■ 4.2
CDK18-212ENST00000504162 ERCC6Q03468 1493 aa41.24■■■■■ 4.19
CDK18-212ENST00000504162 CUX2O14529 1486 aa41.21■■■■■ 4.19
CDK18-212ENST00000504162 NESP48681 1621 aa41.16■■■■■ 4.18
CDK18-212ENST00000504162 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.15■■■■■ 4.18
CDK18-212ENST00000504162 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
CDK18-212ENST00000504162 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.08■■■■■ 4.17
CDK18-212ENST00000504162 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.77■■■■■ 4.12
CDK18-212ENST00000504162 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
CDK18-212ENST00000504162 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.64■■■■■ 4.1
CDK18-212ENST00000504162 WIZO95785 1651 aa40.59■■■■■ 4.09
CDK18-212ENST00000504162 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.48■■■■■ 4.07
CDK18-212ENST00000504162 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.43■■■■■ 4.06
CDK18-212ENST00000504162 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.19■■■■■ 4.02
CDK18-212ENST00000504162 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
CDK18-212ENST00000504162 WDR62O43379 1518 aa40.12■■■■■ 4.01
CDK18-212ENST00000504162 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.01■■■■□ 3.99
CDK18-212ENST00000504162 CEP164Q9UPV0 1460 aa40■■■■□ 3.99
CDK18-212ENST00000504162 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.99■■■■□ 3.99
CDK18-212ENST00000504162 CFTRP13569 1480 aa39.98■■■■□ 3.99
CDK18-212ENST00000504162 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
CDK18-212ENST00000504162 PRDM2Q13029 1718 aa39.62■■■■□ 3.93
CDK18-212ENST00000504162 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.58■■■■□ 3.93
CDK18-212ENST00000504162 TRIM41Q8WV44 630 aa39.44■■■■□ 3.9
CDK18-212ENST00000504162 OSCARQ8IYS5 282 aa39.31■■■■□ 3.88
CDK18-212ENST00000504162 TOPBP1Q92547 1522 aa39.24■■■■□ 3.87
CDK18-212ENST00000504162 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
CDK18-212ENST00000504162 IFT140Q96RY7 1462 aa39.2■■■■□ 3.87
CDK18-212ENST00000504162 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.08■■■■□ 3.85
CDK18-212ENST00000504162 ABCC8Q09428 1581 aa39.06■■■■□ 3.84
CDK18-212ENST00000504162 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.99■■■■□ 3.83
CDK18-212ENST00000504162 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
CDK18-212ENST00000504162 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.91■■■■□ 3.82
CDK18-212ENST00000504162 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.91■■■■□ 3.82
CDK18-212ENST00000504162 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.91■■■■□ 3.82
CDK18-212ENST00000504162 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.86■■■■□ 3.81
CDK18-212ENST00000504162 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.85■■■■□ 3.81
CDK18-212ENST00000504162 CHD1O14646 1710 aa38.76■■■■□ 3.8
CDK18-212ENST00000504162 ARHGEF11O15085 1522 aa38.74■■■■□ 3.79
CDK18-212ENST00000504162 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.73■■■■□ 3.79
CDK18-212ENST00000504162 SOGA1O94964 1423 aa38.63■■■■□ 3.77
CDK18-212ENST00000504162 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.59■■■■□ 3.77
CDK18-212ENST00000504162 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.59■■■■□ 3.77
CDK18-212ENST00000504162 CUX1P39880 1505 aa38.58■■■■□ 3.77
CDK18-212ENST00000504162 FBLN2P98095 1184 aa38.52■■■■□ 3.76
CDK18-212ENST00000504162 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.43■■■■□ 3.74
CDK18-212ENST00000504162 WDR97A6NE52 1622 aa38.43■■■■□ 3.74
CDK18-212ENST00000504162 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.43■■■■□ 3.74
CDK18-212ENST00000504162 ARAP1Q96P48 1450 aa38.39■■■■□ 3.74
CDK18-212ENST00000504162 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
CDK18-212ENST00000504162 GRIN2BQ13224 1484 aa38.28■■■■□ 3.72
CDK18-212ENST00000504162 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.28■■■■□ 3.72
CDK18-212ENST00000504162 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.28■■■■□ 3.72
CDK18-212ENST00000504162 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
CDK18-212ENST00000504162 PBRM1Q86U86 1689 aa38.21■■■■□ 3.71
CDK18-212ENST00000504162 SYNJ2O15056 1496 aa38.17■■■■□ 3.7
CDK18-212ENST00000504162 SYNJ1O43426 1573 aa38.17■■■■□ 3.7
CDK18-212ENST00000504162 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.15■■■■□ 3.7
CDK18-212ENST00000504162 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.13■■■■□ 3.69
CDK18-212ENST00000504162 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.12■■■■□ 3.69
CDK18-212ENST00000504162 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.96■■■■□ 3.67
CDK18-212ENST00000504162 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.94■■■■□ 3.66
CDK18-212ENST00000504162 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.92■■■■□ 3.66
CDK18-212ENST00000504162 TOP2BQ02880 1626 aa37.91■■■■□ 3.66
CDK18-212ENST00000504162 GRIN2AQ12879 1464 aa37.82■■■■□ 3.64
CDK18-212ENST00000504162 ADAMTS12P58397 1594 aa37.81■■■■□ 3.64
CDK18-212ENST00000504162 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.76■■■■□ 3.63
CDK18-212ENST00000504162 CEP170Q5SW79 1584 aa37.75■■■■□ 3.63
CDK18-212ENST00000504162 NUP160Q12769 1436 aa37.71■■■■□ 3.63
CDK18-212ENST00000504162 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.66■■■■□ 3.62
CDK18-212ENST00000504162 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.63■■■■□ 3.61
CDK18-212ENST00000504162 SHROOM2Q13796 1616 aa37.58■■■■□ 3.61
CDK18-212ENST00000504162 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
CDK18-212ENST00000504162 JPH4Q96JJ6 628 aa37.29■■■■□ 3.56
CDK18-212ENST00000504162 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.29■■■■□ 3.56
CDK18-212ENST00000504162 IGF1RP08069 1367 aa37.17■■■■□ 3.54
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