RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503594.5

CTBP1-204, Transcript of C-terminal binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTBP1, Length 1,108 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1-204ENST00000503594 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.76■■■■■ 5.4
CTBP1-204ENST00000503594 ABCC9O60706 1549 aa44.66■■■■■ 4.74
CTBP1-204ENST00000503594 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.03■■■■■ 4.64
CTBP1-204ENST00000503594 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.45■■■■■ 4.39
CTBP1-204ENST00000503594 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.24■■■■■ 4.35
CTBP1-204ENST00000503594 NACADO15069 1562 aa41.8■■■■■ 4.28
CTBP1-204ENST00000503594 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.46■■■■■ 4.23
CTBP1-204ENST00000503594 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.4■■■■■ 4.22
CTBP1-204ENST00000503594 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.21■■■■■ 4.19
CTBP1-204ENST00000503594 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.04■■■■■ 4.16
CTBP1-204ENST00000503594 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.02■■■■■ 4.16
CTBP1-204ENST00000503594 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.47■■■■■ 4.07
CTBP1-204ENST00000503594 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.32■■■■■ 4.04
CTBP1-204ENST00000503594 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.31■■■■■ 4.04
CTBP1-204ENST00000503594 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
CTBP1-204ENST00000503594 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.26■■■■■ 4.04
CTBP1-204ENST00000503594 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
CTBP1-204ENST00000503594 SCRIBQ14160 1630 aa40.06■■■■■ 4
CTBP1-204ENST00000503594 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.49■■■■□ 3.91
CTBP1-204ENST00000503594 CUX2O14529 1486 aa38.79■■■■□ 3.8
CTBP1-204ENST00000503594 ERCC6Q03468 1493 aa38.63■■■■□ 3.77
CTBP1-204ENST00000503594 NCAPD3P42695 1498 aa38.6■■■■□ 3.77
CTBP1-204ENST00000503594 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.39■■■■□ 3.74
CTBP1-204ENST00000503594 HMGXB3Q12766 1538 aa38.26■■■■□ 3.72
CTBP1-204ENST00000503594 SMARCA2P51531 1590 aa38.25■■■■□ 3.71
CTBP1-204ENST00000503594 NESP48681 1621 aa38.17■■■■□ 3.7
CTBP1-204ENST00000503594 SMARCA4P51532 1647 aa38.16■■■■□ 3.7
CTBP1-204ENST00000503594 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
CTBP1-204ENST00000503594 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.93■■■■□ 3.66
CTBP1-204ENST00000503594 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
CTBP1-204ENST00000503594 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.83■■■■□ 3.65
CTBP1-204ENST00000503594 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.83■■■■□ 3.65
CTBP1-204ENST00000503594 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.65■■■■□ 3.62
CTBP1-204ENST00000503594 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.63■■■■□ 3.62
CTBP1-204ENST00000503594 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.55■■■■□ 3.6
CTBP1-204ENST00000503594 TRIM41Q8WV44 630 aa37.47■■■■□ 3.59
CTBP1-204ENST00000503594 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.4■■■■□ 3.58
CTBP1-204ENST00000503594 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.36■■■■□ 3.57
CTBP1-204ENST00000503594 WDR62O43379 1518 aa37.29■■■■□ 3.56
CTBP1-204ENST00000503594 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.08■■■■□ 3.53
CTBP1-204ENST00000503594 WIZO95785 1651 aa37.04■■■■□ 3.52
CTBP1-204ENST00000503594 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.97■■■■□ 3.51
CTBP1-204ENST00000503594 OSCARQ8IYS5 282 aa36.9■■■■□ 3.5
CTBP1-204ENST00000503594 CFTRP13569 1480 aa36.84■■■■□ 3.49
CTBP1-204ENST00000503594 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
CTBP1-204ENST00000503594 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
CTBP1-204ENST00000503594 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
CTBP1-204ENST00000503594 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.46■■■■□ 3.43
CTBP1-204ENST00000503594 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.46■■■■□ 3.43
CTBP1-204ENST00000503594 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.46■■■■□ 3.43
CTBP1-204ENST00000503594 IFT140Q96RY7 1462 aa36.37■■■■□ 3.41
CTBP1-204ENST00000503594 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
CTBP1-204ENST00000503594 PRDM2Q13029 1718 aa36.35■■■■□ 3.41
CTBP1-204ENST00000503594 ARHGEF11O15085 1522 aa36.31■■■■□ 3.4
CTBP1-204ENST00000503594 TOPBP1Q92547 1522 aa36.19■■■■□ 3.38
CTBP1-204ENST00000503594 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.16■■■■□ 3.38
CTBP1-204ENST00000503594 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
CTBP1-204ENST00000503594 ABCC8Q09428 1581 aa36.09■■■■□ 3.37
CTBP1-204ENST00000503594 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.06■■■■□ 3.36
CTBP1-204ENST00000503594 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.01■■■■□ 3.35
CTBP1-204ENST00000503594 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.93■■■■□ 3.348e-8■■■■□ 20.9
CTBP1-204ENST00000503594 CHD1O14646 1710 aa35.93■■■■□ 3.34
CTBP1-204ENST00000503594 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
CTBP1-204ENST00000503594 ARAP1Q96P48 1450 aa35.91■■■■□ 3.34
CTBP1-204ENST00000503594 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
CTBP1-204ENST00000503594 FBLN2P98095 1184 aa35.82■■■■□ 3.32
CTBP1-204ENST00000503594 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
CTBP1-204ENST00000503594 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.64■■■■□ 3.3
CTBP1-204ENST00000503594 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
CTBP1-204ENST00000503594 SOGA1O94964 1423 aa35.6■■■■□ 3.29
CTBP1-204ENST00000503594 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.56■■■■□ 3.28
CTBP1-204ENST00000503594 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.56■■■■□ 3.28
CTBP1-204ENST00000503594 WDR97A6NE52 1622 aa35.53■■■■□ 3.28
CTBP1-204ENST00000503594 SYNJ1O43426 1573 aa35.47■■■■□ 3.27
CTBP1-204ENST00000503594 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
CTBP1-204ENST00000503594 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.46■■■■□ 3.27
CTBP1-204ENST00000503594 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
CTBP1-204ENST00000503594 GRIN2BQ13224 1484 aa35.39■■■■□ 3.26
CTBP1-204ENST00000503594 SYNJ2O15056 1496 aa35.35■■■■□ 3.25
CTBP1-204ENST00000503594 CUX1P39880 1505 aa35.33■■■■□ 3.25
CTBP1-204ENST00000503594 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
CTBP1-204ENST00000503594 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.22■■■■□ 3.23
CTBP1-204ENST00000503594 PBRM1Q86U86 1689 aa35.14■■■■□ 3.22
CTBP1-204ENST00000503594 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.04■■■■□ 3.2
CTBP1-204ENST00000503594 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.03■■■■□ 3.2
CTBP1-204ENST00000503594 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.92■■■■□ 3.18
CTBP1-204ENST00000503594 GRIN2AQ12879 1464 aa34.92■■■■□ 3.18
CTBP1-204ENST00000503594 NUP160Q12769 1436 aa34.85■■■■□ 3.17
CTBP1-204ENST00000503594 CEP170Q5SW79 1584 aa34.84■■■■□ 3.17
CTBP1-204ENST00000503594 ADAMTS12P58397 1594 aa34.82■■■■□ 3.16
CTBP1-204ENST00000503594 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.78■■■■□ 3.16
CTBP1-204ENST00000503594 SHROOM2Q13796 1616 aa34.74■■■■□ 3.15
CTBP1-204ENST00000503594 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.71■■■■□ 3.15
CTBP1-204ENST00000503594 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.59■■■■□ 3.13
CTBP1-204ENST00000503594 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.59■■■■□ 3.13
CTBP1-204ENST00000503594 TOP2BQ02880 1626 aa34.59■■■■□ 3.13
CTBP1-204ENST00000503594 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.58■■■■□ 3.13
CTBP1-204ENST00000503594 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
CTBP1-204ENST00000503594 JPH4Q96JJ6 628 aa34.46■■■■□ 3.11
CTBP1-204ENST00000503594 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
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