RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502525.5

LRAT-205, Transcript of lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

TSL 4

Gene LRAT, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRAT-205ENST00000502525 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.81■■■■■ 6.2
LRAT-205ENST00000502525 ABCC9O60706 1549 aa48.47■■■■■ 5.35
LRAT-205ENST00000502525 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.4■■■■■ 5.34
LRAT-205ENST00000502525 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.03■■■■■ 4.96
LRAT-205ENST00000502525 NACADO15069 1562 aa45.67■■■■■ 4.9
LRAT-205ENST00000502525 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.55■■■■■ 4.88
LRAT-205ENST00000502525 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.3■■■■■ 4.84
LRAT-205ENST00000502525 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.26■■■■■ 4.84
LRAT-205ENST00000502525 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.04■■■■■ 4.8
LRAT-205ENST00000502525 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.97■■■■■ 4.79
LRAT-205ENST00000502525 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.84■■■■■ 4.77
LRAT-205ENST00000502525 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.61■■■■■ 4.73
LRAT-205ENST00000502525 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.39■■■■■ 4.7
LRAT-205ENST00000502525 SCRIBQ14160 1630 aa44.14■■■■■ 4.66
LRAT-205ENST00000502525 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.01■■■■■ 4.64
LRAT-205ENST00000502525 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.81■■■■■ 4.6
LRAT-205ENST00000502525 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
LRAT-205ENST00000502525 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.62■■■■■ 4.57
LRAT-205ENST00000502525 NCAPD3P42695 1498 aa42.14■■■■■ 4.34
LRAT-205ENST00000502525 SMARCA4P51532 1647 aa42.07■■■■■ 4.33
LRAT-205ENST00000502525 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.05■■■■■ 4.32
LRAT-205ENST00000502525 SMARCA2P51531 1590 aa41.9■■■■■ 4.3
LRAT-205ENST00000502525 HMGXB3Q12766 1538 aa41.9■■■■■ 4.3
LRAT-205ENST00000502525 ERCC6Q03468 1493 aa41.76■■■■■ 4.28
LRAT-205ENST00000502525 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.75■■■■■ 4.27
LRAT-205ENST00000502525 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
LRAT-205ENST00000502525 CUX2O14529 1486 aa41.72■■■■■ 4.27
LRAT-205ENST00000502525 NESP48681 1621 aa41.66■■■■■ 4.26
LRAT-205ENST00000502525 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
LRAT-205ENST00000502525 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.61■■■■■ 4.25
LRAT-205ENST00000502525 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.53■■■■■ 4.24
LRAT-205ENST00000502525 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
LRAT-205ENST00000502525 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.26■■■■■ 4.2
LRAT-205ENST00000502525 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.2■■■■■ 4.19
LRAT-205ENST00000502525 WIZO95785 1651 aa41.08■■■■■ 4.17
LRAT-205ENST00000502525 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.91■■■■■ 4.14
LRAT-205ENST00000502525 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.83■■■■■ 4.13
LRAT-205ENST00000502525 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.68■■■■■ 4.1
LRAT-205ENST00000502525 WDR62O43379 1518 aa40.63■■■■■ 4.1
LRAT-205ENST00000502525 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
LRAT-205ENST00000502525 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.48■■■■■ 4.07
LRAT-205ENST00000502525 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.47■■■■■ 4.07
LRAT-205ENST00000502525 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.44■■■■■ 4.06
LRAT-205ENST00000502525 CFTRP13569 1480 aa40.39■■■■■ 4.06
LRAT-205ENST00000502525 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
LRAT-205ENST00000502525 PRDM2Q13029 1718 aa40.18■■■■■ 4.02
LRAT-205ENST00000502525 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.98■■■■□ 3.99
LRAT-205ENST00000502525 TRIM41Q8WV44 630 aa39.92■■■■□ 3.98
LRAT-205ENST00000502525 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
LRAT-205ENST00000502525 TOPBP1Q92547 1522 aa39.7■■■■□ 3.95
LRAT-205ENST00000502525 OSCARQ8IYS5 282 aa39.68■■■■□ 3.94
LRAT-205ENST00000502525 IFT140Q96RY7 1462 aa39.64■■■■□ 3.94
LRAT-205ENST00000502525 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.55■■■■□ 3.92
LRAT-205ENST00000502525 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.53■■■■□ 3.92
LRAT-205ENST00000502525 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.44■■■■□ 3.9
LRAT-205ENST00000502525 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.44■■■■□ 3.9
LRAT-205ENST00000502525 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.44■■■■□ 3.9
LRAT-205ENST00000502525 ABCC8Q09428 1581 aa39.44■■■■□ 3.9
LRAT-205ENST00000502525 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
LRAT-205ENST00000502525 CHD1O14646 1710 aa39.31■■■■□ 3.88
LRAT-205ENST00000502525 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
LRAT-205ENST00000502525 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.27■■■■□ 3.88
LRAT-205ENST00000502525 ARHGEF11O15085 1522 aa39.24■■■■□ 3.87
LRAT-205ENST00000502525 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.17■■■■□ 3.86
LRAT-205ENST00000502525 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.04■■■■□ 3.84
LRAT-205ENST00000502525 CUX1P39880 1505 aa39.03■■■■□ 3.84
LRAT-205ENST00000502525 SOGA1O94964 1423 aa39■■■■□ 3.83
LRAT-205ENST00000502525 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
LRAT-205ENST00000502525 FBLN2P98095 1184 aa38.91■■■■□ 3.82
LRAT-205ENST00000502525 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.91■■■■□ 3.82
LRAT-205ENST00000502525 WDR97A6NE52 1622 aa38.89■■■■□ 3.82
LRAT-205ENST00000502525 ARAP1Q96P48 1450 aa38.88■■■■□ 3.81
LRAT-205ENST00000502525 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.82■■■■□ 3.8
LRAT-205ENST00000502525 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.78■■■■□ 3.8
LRAT-205ENST00000502525 PBRM1Q86U86 1689 aa38.74■■■■□ 3.79
LRAT-205ENST00000502525 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
LRAT-205ENST00000502525 GRIN2BQ13224 1484 aa38.7■■■■□ 3.79
LRAT-205ENST00000502525 SYNJ1O43426 1573 aa38.65■■■■□ 3.78
LRAT-205ENST00000502525 SYNJ2O15056 1496 aa38.6■■■■□ 3.77
LRAT-205ENST00000502525 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.6■■■■□ 3.77
LRAT-205ENST00000502525 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.6■■■■□ 3.77
LRAT-205ENST00000502525 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.57■■■■□ 3.76
LRAT-205ENST00000502525 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.57■■■■□ 3.76
LRAT-205ENST00000502525 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.54■■■■□ 3.76
LRAT-205ENST00000502525 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.4■■■■□ 3.74
LRAT-205ENST00000502525 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.39■■■■□ 3.74
LRAT-205ENST00000502525 TOP2BQ02880 1626 aa38.34■■■■□ 3.73
LRAT-205ENST00000502525 ADAMTS12P58397 1594 aa38.31■■■■□ 3.72
LRAT-205ENST00000502525 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.28■■■■□ 3.72
LRAT-205ENST00000502525 GRIN2AQ12879 1464 aa38.26■■■■□ 3.72
LRAT-205ENST00000502525 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.24■■■■□ 3.71
LRAT-205ENST00000502525 CEP170Q5SW79 1584 aa38.23■■■■□ 3.71
LRAT-205ENST00000502525 NUP160Q12769 1436 aa38.12■■■■□ 3.69
LRAT-205ENST00000502525 SHROOM2Q13796 1616 aa38.06■■■■□ 3.68
LRAT-205ENST00000502525 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.04■■■■□ 3.68
LRAT-205ENST00000502525 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.04■■■■□ 3.68
LRAT-205ENST00000502525 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.79■■■■□ 3.64
LRAT-205ENST00000502525 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
LRAT-205ENST00000502525 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.68■■■■□ 3.62
LRAT-205ENST00000502525 JPH4Q96JJ6 628 aa37.61■■■■□ 3.61
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