RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502502.5

FAM200B-202, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, humanhuman

TSL 4

Gene FAM200B, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200B-202ENST00000502502 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.09■■■■■ 5.93
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FAM200B-202ENST00000502502 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.27■■■■■ 4.52
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FAM200B-202ENST00000502502 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.22■■■■■ 4.51
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FAM200B-202ENST00000502502 SCRIBQ14160 1630 aa42.61■■■■■ 4.41
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FAM200B-202ENST00000502502 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.2■■■■■ 4.03
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FAM200B-202ENST00000502502 CFTRP13569 1480 aa38.92■■■■□ 3.82
FAM200B-202ENST00000502502 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.92■■■■□ 3.82
FAM200B-202ENST00000502502 WDR62O43379 1518 aa38.83■■■■□ 3.81
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FAM200B-202ENST00000502502 PRDM2Q13029 1718 aa38.7■■■■□ 3.79
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FAM200B-202ENST00000502502 IFT140Q96RY7 1462 aa38.09■■■■□ 3.69
FAM200B-202ENST00000502502 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
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FAM200B-202ENST00000502502 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.72■■■■□ 3.63
FAM200B-202ENST00000502502 SOGA1O94964 1423 aa37.7■■■■□ 3.63
FAM200B-202ENST00000502502 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
FAM200B-202ENST00000502502 CHD1O14646 1710 aa37.57■■■■□ 3.6
FAM200B-202ENST00000502502 FBLN2P98095 1184 aa37.54■■■■□ 3.6
FAM200B-202ENST00000502502 WDR97A6NE52 1622 aa37.42■■■■□ 3.58
FAM200B-202ENST00000502502 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.4■■■■□ 3.58
FAM200B-202ENST00000502502 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.39■■■■□ 3.58
FAM200B-202ENST00000502502 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.39■■■■□ 3.58
FAM200B-202ENST00000502502 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.39■■■■□ 3.58
FAM200B-202ENST00000502502 GRIN2BQ13224 1484 aa37.31■■■■□ 3.56
FAM200B-202ENST00000502502 PBRM1Q86U86 1689 aa37.3■■■■□ 3.56
FAM200B-202ENST00000502502 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.28■■■■□ 3.56
FAM200B-202ENST00000502502 ARHGEF11O15085 1522 aa37.28■■■■□ 3.56
FAM200B-202ENST00000502502 SYNJ1O43426 1573 aa37.27■■■■□ 3.56
FAM200B-202ENST00000502502 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.26■■■■□ 3.55
FAM200B-202ENST00000502502 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.25■■■■□ 3.55
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FAM200B-202ENST00000502502 CEP170Q5SW79 1584 aa36.73■■■■□ 3.47
FAM200B-202ENST00000502502 NUP160Q12769 1436 aa36.64■■■■□ 3.46
FAM200B-202ENST00000502502 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.57■■■■□ 3.44
FAM200B-202ENST00000502502 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
FAM200B-202ENST00000502502 KIF27Q86VH2 1401 aa36.52■■■■□ 3.44
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FAM200B-202ENST00000502502 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.37■■■■□ 3.41
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