RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502351.1

PURA-202, Transcript of purine rich element binding protein A, humanhuman

TSL 2

Gene PURA, Length 502 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PURA-202ENST00000502351 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.34■■■■■ 8.05
PURA-202ENST00000502351 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.16■■■■■ 6.9
PURA-202ENST00000502351 ABCC9O60706 1549 aa57.37■■■■■ 6.77
PURA-202ENST00000502351 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.9■■■■■ 6.38
PURA-202ENST00000502351 NACADO15069 1562 aa54.76■■■■■ 6.36
PURA-202ENST00000502351 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.68■■■■■ 6.34
PURA-202ENST00000502351 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.37■■■■■ 6.29
PURA-202ENST00000502351 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.32■■■■■ 6.29
PURA-202ENST00000502351 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.98■■■■■ 6.23
PURA-202ENST00000502351 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.79■■■■■ 6.2
PURA-202ENST00000502351 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.58■■■■■ 6.17
PURA-202ENST00000502351 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.44■■■■■ 6.14
PURA-202ENST00000502351 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.14■■■■■ 6.1
PURA-202ENST00000502351 SCRIBQ14160 1630 aa53.13■■■■■ 6.1
PURA-202ENST00000502351 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.61■■■■■ 6.01
PURA-202ENST00000502351 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.97■■■■■ 5.91
PURA-202ENST00000502351 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.86■■■■■ 5.89
PURA-202ENST00000502351 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.54■■■■■ 5.84
PURA-202ENST00000502351 SMARCA4P51532 1647 aa50.76■■■■■ 5.72
PURA-202ENST00000502351 NCAPD3P42695 1498 aa50.6■■■■■ 5.69
PURA-202ENST00000502351 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.6■■■■■ 5.69
PURA-202ENST00000502351 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.59■■■■■ 5.69
PURA-202ENST00000502351 SMARCA2P51531 1590 aa50.42■■■■■ 5.66
PURA-202ENST00000502351 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.42■■■■■ 5.66
PURA-202ENST00000502351 HMGXB3Q12766 1538 aa50.28■■■■■ 5.64
PURA-202ENST00000502351 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.27■■■■■ 5.64
PURA-202ENST00000502351 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.1■■■■■ 5.61
PURA-202ENST00000502351 WIZO95785 1651 aa49.84■■■■■ 5.57
PURA-202ENST00000502351 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.68■■■■■ 5.54
PURA-202ENST00000502351 NESP48681 1621 aa49.6■■■■■ 5.53
PURA-202ENST00000502351 ERCC6Q03468 1493 aa49.35■■■■■ 5.49
PURA-202ENST00000502351 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.26■■■■■ 5.48
PURA-202ENST00000502351 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.22■■■■■ 5.47
PURA-202ENST00000502351 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.09■■■■■ 5.45
PURA-202ENST00000502351 CUX2O14529 1486 aa48.97■■■■■ 5.43
PURA-202ENST00000502351 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.93■■■■■ 5.42
PURA-202ENST00000502351 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.92■■■■■ 5.42
PURA-202ENST00000502351 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.87■■■■■ 5.41
PURA-202ENST00000502351 CFTRP13569 1480 aa48.75■■■■■ 5.4
PURA-202ENST00000502351 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.7■■■■■ 5.39
PURA-202ENST00000502351 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.54■■■■■ 5.36
PURA-202ENST00000502351 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.49■■■■■ 5.35
PURA-202ENST00000502351 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.47■■■■■ 5.35
PURA-202ENST00000502351 WDR62O43379 1518 aa48.38■■■■■ 5.34
PURA-202ENST00000502351 PRDM2Q13029 1718 aa48.27■■■■■ 5.32
PURA-202ENST00000502351 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.15■■■■■ 5.3
PURA-202ENST00000502351 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.11■■■■■ 5.29
PURA-202ENST00000502351 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.97■■■■■ 5.27
PURA-202ENST00000502351 TOPBP1Q92547 1522 aa47.75■■■■■ 5.23
PURA-202ENST00000502351 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.62■■■■■ 5.21
PURA-202ENST00000502351 ABCC8Q09428 1581 aa47.57■■■■■ 5.21
PURA-202ENST00000502351 IFT140Q96RY7 1462 aa47.46■■■■■ 5.19
PURA-202ENST00000502351 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.42■■■■■ 5.18
PURA-202ENST00000502351 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.33■■■■■ 5.17
PURA-202ENST00000502351 CUX1P39880 1505 aa47.3■■■■■ 5.16
PURA-202ENST00000502351 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.28■■■■■ 5.16
PURA-202ENST00000502351 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.18■■■■■ 5.14
PURA-202ENST00000502351 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.15■■■■■ 5.14
PURA-202ENST00000502351 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
PURA-202ENST00000502351 SOGA1O94964 1423 aa47.08■■■■■ 5.13
PURA-202ENST00000502351 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.08■■■■■ 5.13
PURA-202ENST00000502351 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.92■■■■■ 5.1
PURA-202ENST00000502351 OSCARQ8IYS5 282 aa46.88■■■■■ 5.1
PURA-202ENST00000502351 WDR97A6NE52 1622 aa46.79■■■■■ 5.08
PURA-202ENST00000502351 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.79■■■■■ 5.08
PURA-202ENST00000502351 SYNJ1O43426 1573 aa46.77■■■■■ 5.08
PURA-202ENST00000502351 TOP2BQ02880 1626 aa46.73■■■■■ 5.07
PURA-202ENST00000502351 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.73■■■■■ 5.07
PURA-202ENST00000502351 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.65■■■■■ 5.06
PURA-202ENST00000502351 CHD1O14646 1710 aa46.61■■■■■ 5.05
PURA-202ENST00000502351 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.59■■■■■ 5.05
PURA-202ENST00000502351 GRIN2BQ13224 1484 aa46.55■■■■■ 5.04
PURA-202ENST00000502351 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.53■■■■■ 5.04
PURA-202ENST00000502351 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.52■■■■■ 5.04
PURA-202ENST00000502351 FBLN2P98095 1184 aa46.47■■■■■ 5.03
PURA-202ENST00000502351 PBRM1Q86U86 1689 aa46.46■■■■■ 5.03
PURA-202ENST00000502351 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.44■■■■■ 5.03
PURA-202ENST00000502351 SYNJ2O15056 1496 aa46.31■■■■■ 5
PURA-202ENST00000502351 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.27■■■■■ 5
PURA-202ENST00000502351 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.25■■■■■ 4.99
PURA-202ENST00000502351 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.25■■■■■ 4.99
PURA-202ENST00000502351 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.25■■■■■ 4.99
PURA-202ENST00000502351 TRIM41Q8WV44 630 aa46.22■■■■■ 4.99
PURA-202ENST00000502351 ARHGEF11O15085 1522 aa46.2■■■■■ 4.99
PURA-202ENST00000502351 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.13■■■■■ 4.98
PURA-202ENST00000502351 ADAMTS12P58397 1594 aa46.1■■■■■ 4.97
PURA-202ENST00000502351 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.05■■■■■ 4.96
PURA-202ENST00000502351 GRIN2AQ12879 1464 aa45.99■■■■■ 4.95
PURA-202ENST00000502351 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.95■■■■■ 4.95
PURA-202ENST00000502351 ARAP1Q96P48 1450 aa45.85■■■■■ 4.93
PURA-202ENST00000502351 CEP170Q5SW79 1584 aa45.84■■■■■ 4.93
PURA-202ENST00000502351 NUP160Q12769 1436 aa45.83■■■■■ 4.93
PURA-202ENST00000502351 KIF27Q86VH2 1401 aa45.78■■■■■ 4.92
PURA-202ENST00000502351 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.77■■■■■ 4.92
PURA-202ENST00000502351 IGF1RP08069 1367 aa45.75■■■■■ 4.91
PURA-202ENST00000502351 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.57■■■■■ 4.89
PURA-202ENST00000502351 CUL7Q14999 1698 aa45.53■■■■■ 4.88
PURA-202ENST00000502351 SHROOM2Q13796 1616 aa45.52■■■■■ 4.88
PURA-202ENST00000502351 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.47■■■■■ 4.87
PURA-202ENST00000502351 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.41■■■■■ 4.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.3 ms