RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502256.1

TNIP2-202, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene TNIP2, Length 923 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP2-202ENST00000502256 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.25■■■■□ 3.87
TNIP2-202ENST00000502256 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.03■■■■□ 3.2
TNIP2-202ENST00000502256 ABCC9O60706 1549 aa34.46■■■■□ 3.11
TNIP2-202ENST00000502256 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.02■■■□□ 2.88
TNIP2-202ENST00000502256 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.92■■■□□ 2.86
TNIP2-202ENST00000502256 NACADO15069 1562 aa32.89■■■□□ 2.86
TNIP2-202ENST00000502256 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
TNIP2-202ENST00000502256 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.55■■■□□ 2.8
TNIP2-202ENST00000502256 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.4■■■□□ 2.78
TNIP2-202ENST00000502256 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.39■■■□□ 2.78
TNIP2-202ENST00000502256 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.13■■■□□ 2.73
TNIP2-202ENST00000502256 SCRIBQ14160 1630 aa32.05■■■□□ 2.72
TNIP2-202ENST00000502256 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.04■■■□□ 2.72
TNIP2-202ENST00000502256 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.66■■■□□ 2.66
TNIP2-202ENST00000502256 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.57■■■□□ 2.64
TNIP2-202ENST00000502256 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
TNIP2-202ENST00000502256 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.16■■■□□ 2.58
TNIP2-202ENST00000502256 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.93■■■□□ 2.54
TNIP2-202ENST00000502256 SMARCA4P51532 1647 aa30.56■■■□□ 2.48
TNIP2-202ENST00000502256 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.46
TNIP2-202ENST00000502256 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.36■■■□□ 2.45
TNIP2-202ENST00000502256 SMARCA2P51531 1590 aa30.33■■■□□ 2.45
TNIP2-202ENST00000502256 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.3■■■□□ 2.44
TNIP2-202ENST00000502256 NCAPD3P42695 1498 aa30.3■■■□□ 2.44
TNIP2-202ENST00000502256 HMGXB3Q12766 1538 aa30.22■■■□□ 2.43
TNIP2-202ENST00000502256 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.16■■■□□ 2.42
TNIP2-202ENST00000502256 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
TNIP2-202ENST00000502256 WIZO95785 1651 aa30.03■■■□□ 2.4
TNIP2-202ENST00000502256 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
TNIP2-202ENST00000502256 NESP48681 1621 aa29.78■■■□□ 2.36
TNIP2-202ENST00000502256 ERCC6Q03468 1493 aa29.71■■■□□ 2.35
TNIP2-202ENST00000502256 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
TNIP2-202ENST00000502256 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.61■■■□□ 2.33
TNIP2-202ENST00000502256 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.49■■■□□ 2.31
TNIP2-202ENST00000502256 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.42■■■□□ 2.3
TNIP2-202ENST00000502256 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
TNIP2-202ENST00000502256 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.37■■■□□ 2.29
TNIP2-202ENST00000502256 CUX2O14529 1486 aa29.36■■■□□ 2.29
TNIP2-202ENST00000502256 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.25■■■□□ 2.27
TNIP2-202ENST00000502256 CFTRP13569 1480 aa29.23■■■□□ 2.27
TNIP2-202ENST00000502256 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.17■■■□□ 2.26
TNIP2-202ENST00000502256 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.17■■■□□ 2.26
TNIP2-202ENST00000502256 PRDM2Q13029 1718 aa29.17■■■□□ 2.26
TNIP2-202ENST00000502256 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.15■■■□□ 2.26
TNIP2-202ENST00000502256 WDR62O43379 1518 aa29.05■■■□□ 2.24
TNIP2-202ENST00000502256 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
TNIP2-202ENST00000502256 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
TNIP2-202ENST00000502256 TOPBP1Q92547 1522 aa28.69■■■□□ 2.18
TNIP2-202ENST00000502256 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.67■■■□□ 2.18
TNIP2-202ENST00000502256 ABCC8Q09428 1581 aa28.58■■■□□ 2.17
TNIP2-202ENST00000502256 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.56■■■□□ 2.16
TNIP2-202ENST00000502256 IFT140Q96RY7 1462 aa28.51■■■□□ 2.15
TNIP2-202ENST00000502256 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
TNIP2-202ENST00000502256 CUX1P39880 1505 aa28.45■■■□□ 2.15
TNIP2-202ENST00000502256 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
TNIP2-202ENST00000502256 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
TNIP2-202ENST00000502256 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
TNIP2-202ENST00000502256 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.38■■■□□ 2.13
TNIP2-202ENST00000502256 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.34■■■□□ 2.13
TNIP2-202ENST00000502256 SOGA1O94964 1423 aa28.27■■■□□ 2.12
TNIP2-202ENST00000502256 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.25■■■□□ 2.115e-19■■■■■ 94.4
TNIP2-202ENST00000502256 WDR97A6NE52 1622 aa28.21■■■□□ 2.11
TNIP2-202ENST00000502256 SYNJ1O43426 1573 aa28.19■■■□□ 2.1
TNIP2-202ENST00000502256 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TNIP2-202ENST00000502256 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.17■■■□□ 2.1
TNIP2-202ENST00000502256 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.17■■■□□ 2.1
TNIP2-202ENST00000502256 TOP2BQ02880 1626 aa28.14■■■□□ 2.1
TNIP2-202ENST00000502256 CHD1O14646 1710 aa28.12■■■□□ 2.09
TNIP2-202ENST00000502256 PBRM1Q86U86 1689 aa28.07■■■□□ 2.08
TNIP2-202ENST00000502256 OSCARQ8IYS5 282 aa28.05■■■□□ 2.08
TNIP2-202ENST00000502256 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.03■■■□□ 2.08
TNIP2-202ENST00000502256 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.02■■■□□ 2.08
TNIP2-202ENST00000502256 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28■■■□□ 2.07
TNIP2-202ENST00000502256 GRIN2BQ13224 1484 aa27.97■■■□□ 2.07
TNIP2-202ENST00000502256 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.97■■■□□ 2.07
TNIP2-202ENST00000502256 FBLN2P98095 1184 aa27.97■■■□□ 2.07
TNIP2-202ENST00000502256 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
TNIP2-202ENST00000502256 SYNJ2O15056 1496 aa27.82■■■□□ 2.04
TNIP2-202ENST00000502256 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.79■■■□□ 2.04
TNIP2-202ENST00000502256 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.79■■■□□ 2.04
TNIP2-202ENST00000502256 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.79■■■□□ 2.04
TNIP2-202ENST00000502256 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
TNIP2-202ENST00000502256 ADAMTS12P58397 1594 aa27.77■■■□□ 2.04
TNIP2-202ENST00000502256 TRIM41Q8WV44 630 aa27.75■■■□□ 2.03
TNIP2-202ENST00000502256 ARHGEF11O15085 1522 aa27.73■■■□□ 2.03
TNIP2-202ENST00000502256 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.7■■■□□ 2.02
TNIP2-202ENST00000502256 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.69■■■□□ 2.02
TNIP2-202ENST00000502256 GRIN2AQ12879 1464 aa27.64■■■□□ 2.02
TNIP2-202ENST00000502256 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.61■■■□□ 2.01
TNIP2-202ENST00000502256 CEP170Q5SW79 1584 aa27.57■■■□□ 2
TNIP2-202ENST00000502256 KIF27Q86VH2 1401 aa27.56■■■□□ 2
TNIP2-202ENST00000502256 ARAP1Q96P48 1450 aa27.51■■□□□ 1.99
TNIP2-202ENST00000502256 NUP160Q12769 1436 aa27.49■■□□□ 1.99
TNIP2-202ENST00000502256 CUL7Q14999 1698 aa27.48■■□□□ 1.99
TNIP2-202ENST00000502256 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.43■■□□□ 1.98
TNIP2-202ENST00000502256 IGF1RP08069 1367 aa27.41■■□□□ 1.98
TNIP2-202ENST00000502256 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.37■■□□□ 1.97
TNIP2-202ENST00000502256 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.37■■□□□ 1.97
TNIP2-202ENST00000502256 SHROOM2Q13796 1616 aa27.35■■□□□ 1.97
TNIP2-202ENST00000502256 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15 ms