RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498817.5

ALS2CL-210, Transcript of ALS2 C-terminal like, humanhuman

TSL 3

Gene ALS2CL, Length 1,065 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CL-210ENST00000498817 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.73■■■■■ 5.71
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ALS2CL-210ENST00000498817 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.94■■■■■ 4.46
ALS2CL-210ENST00000498817 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.82■■■■■ 4.45
ALS2CL-210ENST00000498817 NACADO15069 1562 aa42.73■■■■■ 4.43
ALS2CL-210ENST00000498817 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.23■■■■■ 4.35
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ALS2CL-210ENST00000498817 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.94■■■■■ 4.3
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ALS2CL-210ENST00000498817 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.55■■■■■ 4.08
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ALS2CL-210ENST00000498817 SMARCA2P51531 1590 aa39.29■■■■□ 3.88
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ALS2CL-210ENST00000498817 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.89■■■■□ 3.66
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ALS2CL-210ENST00000498817 TOPBP1Q92547 1522 aa37.24■■■■□ 3.55
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ALS2CL-210ENST00000498817 IFT140Q96RY7 1462 aa37.12■■■■□ 3.53
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ALS2CL-210ENST00000498817 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.71■■■■□ 3.47
ALS2CL-210ENST00000498817 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
ALS2CL-210ENST00000498817 FBLN2P98095 1184 aa36.54■■■■□ 3.44
ALS2CL-210ENST00000498817 CHD1O14646 1710 aa36.45■■■■□ 3.43
ALS2CL-210ENST00000498817 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.42■■■■□ 3.42
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ALS2CL-210ENST00000498817 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.41■■■■□ 3.42
ALS2CL-210ENST00000498817 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.41■■■■□ 3.42
ALS2CL-210ENST00000498817 ARHGEF11O15085 1522 aa36.36■■■■□ 3.41
ALS2CL-210ENST00000498817 WDR97A6NE52 1622 aa36.36■■■■□ 3.41
ALS2CL-210ENST00000498817 GRIN2BQ13224 1484 aa36.34■■■■□ 3.41
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ALS2CL-210ENST00000498817 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.28■■■■□ 3.4
ALS2CL-210ENST00000498817 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.26■■■■□ 3.4
ALS2CL-210ENST00000498817 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
ALS2CL-210ENST00000498817 SYNJ1O43426 1573 aa36.21■■■■□ 3.39
ALS2CL-210ENST00000498817 TOP2BQ02880 1626 aa36.18■■■■□ 3.38
ALS2CL-210ENST00000498817 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.17■■■■□ 3.38
ALS2CL-210ENST00000498817 SYNJ2O15056 1496 aa36.17■■■■□ 3.38
ALS2CL-210ENST00000498817 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.16■■■■□ 3.38
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ALS2CL-210ENST00000498817 ADAMTS12P58397 1594 aa35.87■■■■□ 3.33
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ALS2CL-210ENST00000498817 CEP170Q5SW79 1584 aa35.74■■■■□ 3.31
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ALS2CL-210ENST00000498817 IGF1RP08069 1367 aa35.55■■■■□ 3.28
ALS2CL-210ENST00000498817 KIF27Q86VH2 1401 aa35.52■■■■□ 3.28
ALS2CL-210ENST00000498817 SHROOM2Q13796 1616 aa35.48■■■■□ 3.27
ALS2CL-210ENST00000498817 JPH4Q96JJ6 628 aa35.45■■■■□ 3.27
ALS2CL-210ENST00000498817 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
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