RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498768.1

SLC35F5-212, Transcript of solute carrier family 35 member F5, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC35F5, Length 1,711 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F5-212ENST00000498768 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.58■■■■■ 5.69
SLC35F5-212ENST00000498768 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.76■■■■■ 4.76
SLC35F5-212ENST00000498768 ABCC9O60706 1549 aa43.86■■■■■ 4.61
SLC35F5-212ENST00000498768 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.43■■■■■ 4.38
SLC35F5-212ENST00000498768 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
SLC35F5-212ENST00000498768 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.11■■■■■ 4.33
SLC35F5-212ENST00000498768 NACADO15069 1562 aa42.08■■■■■ 4.33
SLC35F5-212ENST00000498768 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.82■■■■■ 4.29
SLC35F5-212ENST00000498768 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.74■■■■■ 4.27
SLC35F5-212ENST00000498768 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.18■■■■■ 4.18
SLC35F5-212ENST00000498768 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.1■■■■■ 4.17
SLC35F5-212ENST00000498768 SCRIBQ14160 1630 aa41.05■■■■■ 4.16
SLC35F5-212ENST00000498768 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.89■■■■■ 4.14
SLC35F5-212ENST00000498768 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.88■■■■■ 4.13
SLC35F5-212ENST00000498768 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.17■■■■■ 4.02
SLC35F5-212ENST00000498768 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
SLC35F5-212ENST00000498768 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.61■■■■□ 3.93
SLC35F5-212ENST00000498768 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
SLC35F5-212ENST00000498768 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.5■■■■□ 3.91
SLC35F5-212ENST00000498768 SMARCA4P51532 1647 aa39.2■■■■□ 3.87
SLC35F5-212ENST00000498768 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.16■■■■□ 3.86
SLC35F5-212ENST00000498768 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.05■■■■□ 3.84
SLC35F5-212ENST00000498768 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.97■■■■□ 3.83
SLC35F5-212ENST00000498768 NCAPD3P42695 1498 aa38.88■■■■□ 3.81
SLC35F5-212ENST00000498768 SMARCA2P51531 1590 aa38.86■■■■□ 3.81
SLC35F5-212ENST00000498768 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.84■■■■□ 3.81
SLC35F5-212ENST00000498768 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.74■■■■□ 3.79
SLC35F5-212ENST00000498768 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
SLC35F5-212ENST00000498768 HMGXB3Q12766 1538 aa38.66■■■■□ 3.78
SLC35F5-212ENST00000498768 WIZO95785 1651 aa38.64■■■■□ 3.78
SLC35F5-212ENST00000498768 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.24■■■■□ 3.71
SLC35F5-212ENST00000498768 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.16■■■■□ 3.7
SLC35F5-212ENST00000498768 NESP48681 1621 aa38.03■■■■□ 3.68
SLC35F5-212ENST00000498768 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.8■■■■□ 3.64
SLC35F5-212ENST00000498768 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.79■■■■□ 3.64
SLC35F5-212ENST00000498768 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.79■■■■□ 3.64
SLC35F5-212ENST00000498768 ERCC6Q03468 1493 aa37.75■■■■□ 3.63
SLC35F5-212ENST00000498768 CFTRP13569 1480 aa37.59■■■■□ 3.61
SLC35F5-212ENST00000498768 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.58■■■■□ 3.61
SLC35F5-212ENST00000498768 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.48■■■■□ 3.59
SLC35F5-212ENST00000498768 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.38■■■■□ 3.57
SLC35F5-212ENST00000498768 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
SLC35F5-212ENST00000498768 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.29■■■■□ 3.56
SLC35F5-212ENST00000498768 TRIM41Q8WV44 630 aa37.2■■■■□ 3.55
SLC35F5-212ENST00000498768 PRDM2Q13029 1718 aa37.2■■■■□ 3.55
SLC35F5-212ENST00000498768 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.18■■■■□ 3.54
SLC35F5-212ENST00000498768 CUX2O14529 1486 aa37.17■■■■□ 3.54
SLC35F5-212ENST00000498768 WDR62O43379 1518 aa37.03■■■■□ 3.52
SLC35F5-212ENST00000498768 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37■■■■□ 3.51
SLC35F5-212ENST00000498768 TOPBP1Q92547 1522 aa36.79■■■■□ 3.48
SLC35F5-212ENST00000498768 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.76■■■■□ 3.48
SLC35F5-212ENST00000498768 ABCC8Q09428 1581 aa36.76■■■■□ 3.47
SLC35F5-212ENST00000498768 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.71■■■■□ 3.47
SLC35F5-212ENST00000498768 CUX1P39880 1505 aa36.6■■■■□ 3.45
SLC35F5-212ENST00000498768 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.43
SLC35F5-212ENST00000498768 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.5■■■■□ 3.43
SLC35F5-212ENST00000498768 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
SLC35F5-212ENST00000498768 IFT140Q96RY7 1462 aa36.47■■■■□ 3.43
SLC35F5-212ENST00000498768 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.46■■■■□ 3.43
SLC35F5-212ENST00000498768 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.42■■■■□ 3.42
SLC35F5-212ENST00000498768 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
SLC35F5-212ENST00000498768 SOGA1O94964 1423 aa36.38■■■■□ 3.41
SLC35F5-212ENST00000498768 SYNJ1O43426 1573 aa36.35■■■■□ 3.41
SLC35F5-212ENST00000498768 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
SLC35F5-212ENST00000498768 TOP2BQ02880 1626 aa36.28■■■■□ 3.4
SLC35F5-212ENST00000498768 EEA1Q15075 1411 aa36.25■■■■□ 3.39
SLC35F5-212ENST00000498768 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.25■■■■□ 3.39
SLC35F5-212ENST00000498768 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.24■■■■□ 3.396e-15■■■■■ 43
SLC35F5-212ENST00000498768 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
SLC35F5-212ENST00000498768 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
SLC35F5-212ENST00000498768 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.06■■■■□ 3.36
SLC35F5-212ENST00000498768 WDR97A6NE52 1622 aa36.05■■■■□ 3.36
SLC35F5-212ENST00000498768 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.05■■■■□ 3.36
SLC35F5-212ENST00000498768 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.02■■■■□ 3.36
SLC35F5-212ENST00000498768 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.94■■■■□ 3.34
SLC35F5-212ENST00000498768 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.93■■■■□ 3.34
SLC35F5-212ENST00000498768 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.91■■■■□ 3.34
SLC35F5-212ENST00000498768 GRIN2BQ13224 1484 aa35.88■■■■□ 3.33
SLC35F5-212ENST00000498768 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.88■■■■□ 3.33
SLC35F5-212ENST00000498768 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.86■■■■□ 3.33
SLC35F5-212ENST00000498768 FBLN2P98095 1184 aa35.83■■■■□ 3.33
SLC35F5-212ENST00000498768 PBRM1Q86U86 1689 aa35.79■■■■□ 3.32
SLC35F5-212ENST00000498768 OSCARQ8IYS5 282 aa35.78■■■■□ 3.32
SLC35F5-212ENST00000498768 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.78■■■■□ 3.32
SLC35F5-212ENST00000498768 GOLGA3Q08378 1498 aa35.74■■■■□ 3.31
SLC35F5-212ENST00000498768 KIF21BO75037 1637 aa35.73■■■■□ 3.31
SLC35F5-212ENST00000498768 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
SLC35F5-212ENST00000498768 CHD1O14646 1710 aa35.69■■■■□ 3.3
SLC35F5-212ENST00000498768 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
SLC35F5-212ENST00000498768 KIF27Q86VH2 1401 aa35.63■■■■□ 3.29
SLC35F5-212ENST00000498768 SYNJ2O15056 1496 aa35.63■■■■□ 3.29
SLC35F5-212ENST00000498768 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.6■■■■□ 3.29
SLC35F5-212ENST00000498768 CEP162Q5TB80 1403 aa35.57■■■■□ 3.29
SLC35F5-212ENST00000498768 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.54■■■■□ 3.28
SLC35F5-212ENST00000498768 ADAMTS12P58397 1594 aa35.54■■■■□ 3.28
SLC35F5-212ENST00000498768 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
SLC35F5-212ENST00000498768 IGF1RP08069 1367 aa35.52■■■■□ 3.28
SLC35F5-212ENST00000498768 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.5■■■■□ 3.27
SLC35F5-212ENST00000498768 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
SLC35F5-212ENST00000498768 PRXQ9BXM0 1461 aa35.47■■■■□ 3.27
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