RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498640.1

RARRES1-205, Transcript of retinoic acid receptor responder 1, humanhuman

TSL 3

Gene RARRES1, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1-205ENST00000498640 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.51■■■■■ 6.16
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RARRES1-205ENST00000498640 NACADO15069 1562 aa44.86■■■■■ 4.77
RARRES1-205ENST00000498640 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.61■■■■■ 4.73
RARRES1-205ENST00000498640 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.59■■■■■ 4.73
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RARRES1-205ENST00000498640 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.34■■■■■ 4.69
RARRES1-205ENST00000498640 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.07■■■■■ 4.65
RARRES1-205ENST00000498640 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.71■■■■■ 4.59
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RARRES1-205ENST00000498640 SCRIBQ14160 1630 aa43.44■■■■■ 4.54
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RARRES1-205ENST00000498640 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.35■■■■■ 4.37
RARRES1-205ENST00000498640 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.01■■■■■ 4.32
RARRES1-205ENST00000498640 SMARCA4P51532 1647 aa41.6■■■■■ 4.25
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RARRES1-205ENST00000498640 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.37■■■■■ 4.21
RARRES1-205ENST00000498640 SMARCA2P51531 1590 aa41.3■■■■■ 4.2
RARRES1-205ENST00000498640 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.27■■■■■ 4.2
RARRES1-205ENST00000498640 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.24■■■■■ 4.19
RARRES1-205ENST00000498640 HMGXB3Q12766 1538 aa41.23■■■■■ 4.19
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RARRES1-205ENST00000498640 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.33■■■■■ 4.05
RARRES1-205ENST00000498640 ERCC6Q03468 1493 aa40.2■■■■■ 4.03
RARRES1-205ENST00000498640 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.09■■■■■ 4.01
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RARRES1-205ENST00000498640 CFTRP13569 1480 aa39.89■■■■□ 3.98
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RARRES1-205ENST00000498640 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.65■■■■□ 3.94
RARRES1-205ENST00000498640 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.63■■■■□ 3.94
RARRES1-205ENST00000498640 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.62■■■■□ 3.93
RARRES1-205ENST00000498640 WDR62O43379 1518 aa39.59■■■■□ 3.93
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RARRES1-205ENST00000498640 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39■■■■□ 3.83
RARRES1-205ENST00000498640 ABCC8Q09428 1581 aa38.95■■■■□ 3.83
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RARRES1-205ENST00000498640 IFT140Q96RY7 1462 aa38.8■■■■□ 3.8
RARRES1-205ENST00000498640 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.71■■■■□ 3.79
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RARRES1-205ENST00000498640 WDR97A6NE52 1622 aa38.41■■■■□ 3.74
RARRES1-205ENST00000498640 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.38■■■■□ 3.73
RARRES1-205ENST00000498640 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.35■■■■□ 3.73
RARRES1-205ENST00000498640 TOP2BQ02880 1626 aa38.33■■■■□ 3.73
RARRES1-205ENST00000498640 SYNJ1O43426 1573 aa38.32■■■■□ 3.73
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RARRES1-205ENST00000498640 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.22■■■■□ 3.71
RARRES1-205ENST00000498640 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.21■■■■□ 3.71
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RARRES1-205ENST00000498640 CHD1O14646 1710 aa38.14■■■■□ 3.7
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RARRES1-205ENST00000498640 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.05■■■■□ 3.68
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RARRES1-205ENST00000498640 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.74■■■■□ 3.63
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RARRES1-205ENST00000498640 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.74■■■■□ 3.63
RARRES1-205ENST00000498640 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.74■■■■□ 3.63
RARRES1-205ENST00000498640 FBLN2P98095 1184 aa37.7■■■■□ 3.63
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RARRES1-205ENST00000498640 TRIM41Q8WV44 630 aa37.35■■■■□ 3.57
RARRES1-205ENST00000498640 SHROOM2Q13796 1616 aa37.3■■■■□ 3.56
RARRES1-205ENST00000498640 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.24■■■■□ 3.55
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RARRES1-205ENST00000498640 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa37.09■■■■□ 3.53
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