RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.29■■■■■ 4.84
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HOXD11-202ENST00000498438 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.03■■■■□ 3.36
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HOXD11-202ENST00000498438 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.09■■■■□ 3.21
HOXD11-202ENST00000498438 SMARCA2P51531 1590 aa35.04■■■■□ 3.2
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HOXD11-202ENST00000498438 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.87■■■■□ 3.17
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HOXD11-202ENST00000498438 ERCC6Q03468 1493 aa34.36■■■■□ 3.09
HOXD11-202ENST00000498438 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.24■■■■□ 3.07
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HOXD11-202ENST00000498438 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.01■■■■□ 3.04
HOXD11-202ENST00000498438 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34■■■■□ 3.03
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HOXD11-202ENST00000498438 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.69■■■□□ 2.98
HOXD11-202ENST00000498438 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.69■■■□□ 2.98
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HOXD11-202ENST00000498438 PRDM2Q13029 1718 aa33.59■■■□□ 2.97
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HOXD11-202ENST00000498438 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.71■■■□□ 2.83
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HOXD11-202ENST00000498438 WDR97A6NE52 1622 aa32.51■■■□□ 2.79
HOXD11-202ENST00000498438 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.43■■■□□ 2.78
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HOXD11-202ENST00000498438 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.42■■■□□ 2.78
HOXD11-202ENST00000498438 CHD1O14646 1710 aa32.42■■■□□ 2.78
HOXD11-202ENST00000498438 SYNJ1O43426 1573 aa32.41■■■□□ 2.78
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HOXD11-202ENST00000498438 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.17■■■□□ 2.74
HOXD11-202ENST00000498438 SYNJ2O15056 1496 aa32.16■■■□□ 2.74
HOXD11-202ENST00000498438 TRIM41Q8WV44 630 aa32.16■■■□□ 2.74
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HOXD11-202ENST00000498438 CEP170Q5SW79 1584 aa31.81■■■□□ 2.68
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HOXD11-202ENST00000498438 KIF27Q86VH2 1401 aa31.76■■■□□ 2.68
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HOXD11-202ENST00000498438 CUL7Q14999 1698 aa31.64■■■□□ 2.66
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HOXD11-202ENST00000498438 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.47■■■□□ 2.63
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