RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498147.5

PDCD6IP-217, Transcript of programmed cell death 6 interacting protein, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD6IP, Length 802 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD6IP-217ENST00000498147 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.62■■■■■ 5.21
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PDCD6IP-217ENST00000498147 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.37■■■■■ 4.21
PDCD6IP-217ENST00000498147 NACADO15069 1562 aa40.86■■■■■ 4.13
PDCD6IP-217ENST00000498147 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.71■■■■■ 4.11
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PDCD6IP-217ENST00000498147 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.52■■■■■ 4.08
PDCD6IP-217ENST00000498147 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.27■■■■■ 4.04
PDCD6IP-217ENST00000498147 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.98■■■■□ 3.99
PDCD6IP-217ENST00000498147 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.62■■■■□ 3.93
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PDCD6IP-217ENST00000498147 SCRIBQ14160 1630 aa39.32■■■■□ 3.88
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PDCD6IP-217ENST00000498147 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.22■■■■□ 3.87
PDCD6IP-217ENST00000498147 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.86■■■■□ 3.81
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PDCD6IP-217ENST00000498147 NESP48681 1621 aa37.51■■■■□ 3.6
PDCD6IP-217ENST00000498147 HMGXB3Q12766 1538 aa37.41■■■■□ 3.58
PDCD6IP-217ENST00000498147 SMARCA4P51532 1647 aa37.38■■■■□ 3.57
PDCD6IP-217ENST00000498147 SMARCA2P51531 1590 aa37.38■■■■□ 3.57
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PDCD6IP-217ENST00000498147 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.04■■■■□ 3.52
PDCD6IP-217ENST00000498147 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
PDCD6IP-217ENST00000498147 TRIM41Q8WV44 630 aa36.94■■■■□ 3.5
PDCD6IP-217ENST00000498147 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.94■■■■□ 3.5
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PDCD6IP-217ENST00000498147 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.75■■■■□ 3.47
PDCD6IP-217ENST00000498147 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.58■■■■□ 3.45
PDCD6IP-217ENST00000498147 WDR62O43379 1518 aa36.54■■■■□ 3.44
PDCD6IP-217ENST00000498147 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.53■■■■□ 3.44
PDCD6IP-217ENST00000498147 WIZO95785 1651 aa36.32■■■■□ 3.41
PDCD6IP-217ENST00000498147 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.29■■■■□ 3.4
PDCD6IP-217ENST00000498147 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.18■■■■□ 3.38
PDCD6IP-217ENST00000498147 OSCARQ8IYS5 282 aa36.12■■■■□ 3.37
PDCD6IP-217ENST00000498147 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
PDCD6IP-217ENST00000498147 CFTRP13569 1480 aa35.98■■■■□ 3.35
PDCD6IP-217ENST00000498147 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.92■■■■□ 3.34
PDCD6IP-217ENST00000498147 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.92■■■■□ 3.34
PDCD6IP-217ENST00000498147 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.92■■■■□ 3.34
PDCD6IP-217ENST00000498147 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
PDCD6IP-217ENST00000498147 PRDM2Q13029 1718 aa35.71■■■■□ 3.31
PDCD6IP-217ENST00000498147 ARHGEF11O15085 1522 aa35.67■■■■□ 3.3
PDCD6IP-217ENST00000498147 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
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PDCD6IP-217ENST00000498147 IFT140Q96RY7 1462 aa35.55■■■■□ 3.28
PDCD6IP-217ENST00000498147 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
PDCD6IP-217ENST00000498147 TOPBP1Q92547 1522 aa35.43■■■■□ 3.26
PDCD6IP-217ENST00000498147 CHD1O14646 1710 aa35.4■■■■□ 3.26
PDCD6IP-217ENST00000498147 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.4■■■■□ 3.26
PDCD6IP-217ENST00000498147 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.31■■■■□ 3.24
PDCD6IP-217ENST00000498147 ARAP1Q96P48 1450 aa35.29■■■■□ 3.24
PDCD6IP-217ENST00000498147 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
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PDCD6IP-217ENST00000498147 ABCC8Q09428 1581 aa35.18■■■■□ 3.22
PDCD6IP-217ENST00000498147 FBLN2P98095 1184 aa35.11■■■■□ 3.21
PDCD6IP-217ENST00000498147 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.02■■■■□ 3.2
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PDCD6IP-217ENST00000498147 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.88■■■■□ 3.17
PDCD6IP-217ENST00000498147 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
PDCD6IP-217ENST00000498147 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.86■■■■□ 3.17
PDCD6IP-217ENST00000498147 SOGA1O94964 1423 aa34.79■■■■□ 3.16
PDCD6IP-217ENST00000498147 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
PDCD6IP-217ENST00000498147 SYNJ1O43426 1573 aa34.75■■■■□ 3.15
PDCD6IP-217ENST00000498147 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.71■■■■□ 3.15
PDCD6IP-217ENST00000498147 WDR97A6NE52 1622 aa34.7■■■■□ 3.14
PDCD6IP-217ENST00000498147 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
PDCD6IP-217ENST00000498147 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.66■■■■□ 3.14
PDCD6IP-217ENST00000498147 GRIN2BQ13224 1484 aa34.58■■■■□ 3.13
PDCD6IP-217ENST00000498147 CUX1P39880 1505 aa34.57■■■■□ 3.12
PDCD6IP-217ENST00000498147 SYNJ2O15056 1496 aa34.57■■■■□ 3.12
PDCD6IP-217ENST00000498147 PBRM1Q86U86 1689 aa34.54■■■■□ 3.12
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PDCD6IP-217ENST00000498147 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.36■■■■□ 3.09
PDCD6IP-217ENST00000498147 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.32■■■■□ 3.08
PDCD6IP-217ENST00000498147 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.21■■■■□ 3.07
PDCD6IP-217ENST00000498147 GRIN2AQ12879 1464 aa34.17■■■■□ 3.06
PDCD6IP-217ENST00000498147 CEP170Q5SW79 1584 aa34.17■■■■□ 3.06
PDCD6IP-217ENST00000498147 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.12■■■■□ 3.05
PDCD6IP-217ENST00000498147 ADAMTS12P58397 1594 aa34.11■■■■□ 3.05
PDCD6IP-217ENST00000498147 NUP160Q12769 1436 aa34.06■■■■□ 3.04
PDCD6IP-217ENST00000498147 SHROOM2Q13796 1616 aa34.06■■■■□ 3.04
PDCD6IP-217ENST00000498147 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.89■■■■□ 3.02
PDCD6IP-217ENST00000498147 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.88■■■■□ 3.01
PDCD6IP-217ENST00000498147 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.82■■■■□ 3.01
PDCD6IP-217ENST00000498147 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
PDCD6IP-217ENST00000498147 TOP2BQ02880 1626 aa33.79■■■■□ 3
PDCD6IP-217ENST00000498147 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.76■■■■□ 3
PDCD6IP-217ENST00000498147 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.69■■■□□ 2.98
PDCD6IP-217ENST00000498147 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.69■■■□□ 2.98
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