RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497953.5

GLT8D1-215, Transcript of glycosyltransferase 8 domain containing 1, human

TSL 3

Gene GLT8D1, Length 789 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GLT8D1-215	ENST00000497953	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		58.95	■■■■■ 7.03
GLT8D1-215	ENST00000497953	ABCC9	O60706	1549 aa		52.86	■■■■■ 6.05
GLT8D1-215	ENST00000497953	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		52.85	■■■■■ 6.05
GLT8D1-215	ENST00000497953	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		50.34	■■■■■ 5.65
GLT8D1-215	ENST00000497953	NACAD	O15069	1562 aa		50	■■■■■ 5.59
GLT8D1-215	ENST00000497953	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.83	■■■■■ 5.57
GLT8D1-215	ENST00000497953	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		49.5	■■■■■ 5.51
GLT8D1-215	ENST00000497953	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		49.3	■■■■■ 5.48
GLT8D1-215	ENST00000497953	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	49.24	■■■■■ 5.47
GLT8D1-215	ENST00000497953	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		49.09	■■■■■ 5.45
GLT8D1-215	ENST00000497953	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.86	■■■■■ 5.41
GLT8D1-215	ENST00000497953	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		48.81	■■■■■ 5.4
GLT8D1-215	ENST00000497953	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		48.69	■■■■■ 5.39
GLT8D1-215	ENST00000497953	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		48.22	■■■■■ 5.31
GLT8D1-215	ENST00000497953	SCRIB	Q14160	1630 aa		48.2	■■■■■ 5.31
GLT8D1-215	ENST00000497953	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		47.73	■■■■■ 5.23
GLT8D1-215	ENST00000497953	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	47.64	■■■■■ 5.22
GLT8D1-215	ENST00000497953	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		47.62	■■■■■ 5.21
GLT8D1-215	ENST00000497953	NCAPD3	P42695	1498 aa		46.15	■■■■■ 4.98
GLT8D1-215	ENST00000497953	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		46.02	■■■■■ 4.96
GLT8D1-215	ENST00000497953	SMARCA4	P51532	1647 aa		45.96	■■■■■ 4.95
GLT8D1-215	ENST00000497953	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.91	■■■■■ 4.94
GLT8D1-215	ENST00000497953	HMGXB3	Q12766	1538 aa		45.81	■■■■■ 4.92
GLT8D1-215	ENST00000497953	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.78	■■■■■ 4.92
GLT8D1-215	ENST00000497953	ERCC6	Q03468	1493 aa		45.68	■■■■■ 4.9
GLT8D1-215	ENST00000497953	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	45.61	■■■■■ 4.89
GLT8D1-215	ENST00000497953	CUX2	O14529	1486 aa		45.55	■■■■■ 4.88
GLT8D1-215	ENST00000497953	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		45.5	■■■■■ 4.87
GLT8D1-215	ENST00000497953	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		45.46	■■■■■ 4.87
GLT8D1-215	ENST00000497953	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.41	■■■■■ 4.86
GLT8D1-215	ENST00000497953	NES	P48681	1621 aa		45.4	■■■■■ 4.86
GLT8D1-215	ENST00000497953	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		45.11	■■■■■ 4.81
GLT8D1-215	ENST00000497953	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	44.91	■■■■■ 4.78
GLT8D1-215	ENST00000497953	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		44.89	■■■■■ 4.78
GLT8D1-215	ENST00000497953	WIZ	O95785	1651 aa		44.86	■■■■■ 4.77
GLT8D1-215	ENST00000497953	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		44.78	■■■■■ 4.76
GLT8D1-215	ENST00000497953	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		44.77	■■■■■ 4.76
GLT8D1-215	ENST00000497953	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.51	■■■■■ 4.72
GLT8D1-215	ENST00000497953	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		44.47	■■■■■ 4.71
GLT8D1-215	ENST00000497953	WDR62	O43379	1518 aa		44.34	■■■■■ 4.69
GLT8D1-215	ENST00000497953	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.33	■■■■■ 4.69
GLT8D1-215	ENST00000497953	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		44.33	■■■■■ 4.69
GLT8D1-215	ENST00000497953	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		44.27	■■■■■ 4.68
GLT8D1-215	ENST00000497953	CFTR	P13569	1480 aa		44.26	■■■■■ 4.68
GLT8D1-215	ENST00000497953	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	43.87	■■■■■ 4.61
GLT8D1-215	ENST00000497953	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.83	■■■■■ 4.61
GLT8D1-215	ENST00000497953	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.75	■■■■■ 4.59
GLT8D1-215	ENST00000497953	TRIM41	Q8WV44	630 aa		43.55	■■■■■ 4.56
GLT8D1-215	ENST00000497953	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		43.5	■■■■■ 4.55
GLT8D1-215	ENST00000497953	IFT140	Q96RY7	1462 aa		43.43	■■■■■ 4.54
GLT8D1-215	ENST00000497953	TOPBP1	Q92547	1522 aa		43.42	■■■■■ 4.54
GLT8D1-215	ENST00000497953	ABCC8	Q09428	1581 aa		43.36	■■■■■ 4.53
GLT8D1-215	ENST00000497953	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	43.32	■■■■■ 4.53
GLT8D1-215	ENST00000497953	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		43.26	■■■■■ 4.52
GLT8D1-215	ENST00000497953	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	43.08	■■■■■ 4.49
GLT8D1-215	ENST00000497953	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	43	■■■■■ 4.47
GLT8D1-215	ENST00000497953	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	42.98	■■■■■ 4.47
GLT8D1-215	ENST00000497953	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	42.95	■■■■■ 4.47
GLT8D1-215	ENST00000497953	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		42.87	■■■■■ 4.45
GLT8D1-215	ENST00000497953	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		42.87	■■■■■ 4.45
GLT8D1-215	ENST00000497953	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		42.87	■■■■■ 4.45
GLT8D1-215	ENST00000497953	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.82	■■■■■ 4.45
GLT8D1-215	ENST00000497953	SOGA1	O94964	1423 aa		42.8	■■■■■ 4.44
GLT8D1-215	ENST00000497953	ARHGEF11	O15085	1522 aa		42.76	■■■■■ 4.44
GLT8D1-215	ENST00000497953	FBLN2	P98095	1184 aa		42.73	■■■■■ 4.43
GLT8D1-215	ENST00000497953	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.73	■■■■■ 4.43
GLT8D1-215	ENST00000497953	CHD1	O14646	1710 aa		42.72	■■■■■ 4.43
GLT8D1-215	ENST00000497953	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	42.72	■■■■■ 4.43
GLT8D1-215	ENST00000497953	CUX1	P39880	1505 aa		42.68	■■■■■ 4.42
GLT8D1-215	ENST00000497953	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	42.64	■■■■■ 4.42
GLT8D1-215	ENST00000497953	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.59	■■■■■ 4.41
GLT8D1-215	ENST00000497953	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		42.53	■■■■■ 4.4
GLT8D1-215	ENST00000497953	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		42.49	■■■■■ 4.39
GLT8D1-215	ENST00000497953	GRIN2B	Q13224	1484 aa		42.43	■■■■■ 4.38
GLT8D1-215	ENST00000497953	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	42.43	■■■■■ 4.38
GLT8D1-215	ENST00000497953	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	42.41	■■■■■ 4.38
GLT8D1-215	ENST00000497953	ARAP1	Q96P48	1450 aa		42.35	■■■■■ 4.37
GLT8D1-215	ENST00000497953	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		42.29	■■■■■ 4.36
GLT8D1-215	ENST00000497953	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.28	■■■■■ 4.36
GLT8D1-215	ENST00000497953	SYNJ2	O15056	1496 aa		42.28	■■■■■ 4.36
GLT8D1-215	ENST00000497953	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		42.26	■■■■■ 4.36
GLT8D1-215	ENST00000497953	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		42.24	■■■■■ 4.35
GLT8D1-215	ENST00000497953	PBRM1	Q86U86	1689 aa		42.21	■■■■■ 4.35
GLT8D1-215	ENST00000497953	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		42.14	■■■■■ 4.34
GLT8D1-215	ENST00000497953	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.12	■■■■■ 4.33
GLT8D1-215	ENST00000497953	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.04	■■■■■ 4.32
GLT8D1-215	ENST00000497953	TOP2B	Q02880	1626 aa		42	■■■■■ 4.31
GLT8D1-215	ENST00000497953	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		41.98	■■■■■ 4.31
GLT8D1-215	ENST00000497953	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.87	■■■■■ 4.29
GLT8D1-215	ENST00000497953	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.84	■■■■■ 4.29
GLT8D1-215	ENST00000497953	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.76	■■■■■ 4.28
GLT8D1-215	ENST00000497953	NUP160	Q12769	1436 aa		41.72	■■■■■ 4.27
GLT8D1-215	ENST00000497953	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.71	■■■■■ 4.27
GLT8D1-215	ENST00000497953	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41.69	■■■■■ 4.26
GLT8D1-215	ENST00000497953	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		41.59	■■■■■ 4.25
GLT8D1-215	ENST00000497953	SHROOM2	Q13796	1616 aa		41.49	■■■■■ 4.23
GLT8D1-215	ENST00000497953	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	41.35	■■■■■ 4.21
GLT8D1-215	ENST00000497953	JPH4	Q96JJ6	628 aa		41.33	■■■■■ 4.21
GLT8D1-215	ENST00000497953	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.24	■■■■■ 4.19
GLT8D1-215	ENST00000497953	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.24	■■■■■ 4.19

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