RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497065.1

SPEG-223, Transcript of SPEG complex locus, human

TSL 4

Gene SPEG, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPEG-223	ENST00000497065	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		44.53	■■■■■ 4.72
SPEG-223	ENST00000497065	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.74	■■■■□ 3.95
SPEG-223	ENST00000497065	ABCC9	O60706	1549 aa		39.34	■■■■□ 3.89
SPEG-223	ENST00000497065	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.58	■■■■□ 3.61
SPEG-223	ENST00000497065	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.46	■■■■□ 3.59
SPEG-223	ENST00000497065	NACAD	O15069	1562 aa		37.4	■■■■□ 3.58
SPEG-223	ENST00000497065	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	37.05	■■■■□ 3.52
SPEG-223	ENST00000497065	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		36.96	■■■■□ 3.51
SPEG-223	ENST00000497065	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.83	■■■■□ 3.49
SPEG-223	ENST00000497065	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		36.72	■■■■□ 3.47
SPEG-223	ENST00000497065	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	36.69	■■■■□ 3.46
SPEG-223	ENST00000497065	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.49	■■■■□ 3.43
SPEG-223	ENST00000497065	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.4	■■■■□ 3.42
SPEG-223	ENST00000497065	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		36.34	■■■■□ 3.41
SPEG-223	ENST00000497065	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		35.92	■■■■□ 3.34
SPEG-223	ENST00000497065	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.55	■■■■□ 3.28
SPEG-223	ENST00000497065	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.52	■■■■□ 3.28
SPEG-223	ENST00000497065	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.32	■■■■□ 3.24
SPEG-223	ENST00000497065	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.68	■■■■□ 3.14
SPEG-223	ENST00000497065	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	34.54	■■■■□ 3.12
SPEG-223	ENST00000497065	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.52	■■■■□ 3.12
SPEG-223	ENST00000497065	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.48	■■■■□ 3.11
SPEG-223	ENST00000497065	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.45	■■■■□ 3.11
SPEG-223	ENST00000497065	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.38	■■■■□ 3.09
SPEG-223	ENST00000497065	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.34	■■■■□ 3.09
SPEG-223	ENST00000497065	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.27	■■■■□ 3.08
SPEG-223	ENST00000497065	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.23	■■■■□ 3.07
SPEG-223	ENST00000497065	WIZ	O95785	1651 aa		34.04	■■■■□ 3.04
SPEG-223	ENST00000497065	NES	P48681	1621 aa		33.94	■■■■□ 3.02
SPEG-223	ENST00000497065	ERCC6	Q03468	1493 aa		33.91	■■■■□ 3.02
SPEG-223	ENST00000497065	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	33.81	■■■■□ 3
SPEG-223	ENST00000497065	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.68	■■■□□ 2.98
SPEG-223	ENST00000497065	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
SPEG-223	ENST00000497065	CUX2	O14529	1486 aa		33.56	■■■□□ 2.96
SPEG-223	ENST00000497065	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.55	■■■□□ 2.96
SPEG-223	ENST00000497065	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.49	■■■□□ 2.95
SPEG-223	ENST00000497065	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
SPEG-223	ENST00000497065	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.45	■■■□□ 2.94
SPEG-223	ENST00000497065	CFTR	P13569	1480 aa		33.23	■■■□□ 2.91
SPEG-223	ENST00000497065	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SPEG-223	ENST00000497065	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.19	■■■□□ 2.9
SPEG-223	ENST00000497065	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SPEG-223	ENST00000497065	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.18	■■■□□ 2.9
SPEG-223	ENST00000497065	WDR62	O43379	1518 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SPEG-223	ENST00000497065	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.05	■■■□□ 2.88
SPEG-223	ENST00000497065	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
SPEG-223	ENST00000497065	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.89	■■■□□ 2.86
SPEG-223	ENST00000497065	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
SPEG-223	ENST00000497065	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.63	■■■□□ 2.81
SPEG-223	ENST00000497065	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SPEG-223	ENST00000497065	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.47	■■■□□ 2.79
SPEG-223	ENST00000497065	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.46	■■■□□ 2.79
SPEG-223	ENST00000497065	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
SPEG-223	ENST00000497065	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
SPEG-223	ENST00000497065	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
SPEG-223	ENST00000497065	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
SPEG-223	ENST00000497065	CUX1	P39880	1505 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SPEG-223	ENST00000497065	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SPEG-223	ENST00000497065	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.23	■■■□□ 2.75
SPEG-223	ENST00000497065	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.17	■■■□□ 2.74
SPEG-223	ENST00000497065	SOGA1	O94964	1423 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SPEG-223	ENST00000497065	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SPEG-223	ENST00000497065	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.73
SPEG-223	ENST00000497065	CHD1	O14646	1710 aa		32	■■■□□ 2.71
SPEG-223	ENST00000497065	WDR97	A6NE52	1622 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SPEG-223	ENST00000497065	SYNJ1	O43426	1573 aa		31.93	■■■□□ 2.7
SPEG-223	ENST00000497065	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	31.91	■■■□□ 2.7
SPEG-223	ENST00000497065	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SPEG-223	ENST00000497065	FBLN2	P98095	1184 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SPEG-223	ENST00000497065	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SPEG-223	ENST00000497065	TOP2B	Q02880	1626 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SPEG-223	ENST00000497065	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31.86	■■■□□ 2.69
SPEG-223	ENST00000497065	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.83	■■■□□ 2.69
SPEG-223	ENST00000497065	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SPEG-223	ENST00000497065	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.82	■■■□□ 2.68
SPEG-223	ENST00000497065	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.79	■■■□□ 2.68
SPEG-223	ENST00000497065	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SPEG-223	ENST00000497065	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
SPEG-223	ENST00000497065	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SPEG-223	ENST00000497065	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SPEG-223	ENST00000497065	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SPEG-223	ENST00000497065	ARHGEF11	O15085	1522 aa		31.68	■■■□□ 2.66
SPEG-223	ENST00000497065	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
SPEG-223	ENST00000497065	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SPEG-223	ENST00000497065	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SPEG-223	ENST00000497065	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.54	■■■□□ 2.64
SPEG-223	ENST00000497065	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.43	■■■□□ 2.62
SPEG-223	ENST00000497065	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.42	■■■□□ 2.62
SPEG-223	ENST00000497065	ARAP1	Q96P48	1450 aa		31.41	■■■□□ 2.62
SPEG-223	ENST00000497065	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SPEG-223	ENST00000497065	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.38	■■■□□ 2.61
SPEG-223	ENST00000497065	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SPEG-223	ENST00000497065	NUP160	Q12769	1436 aa		31.26	■■■□□ 2.6
SPEG-223	ENST00000497065	KIF27	Q86VH2	1401 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SPEG-223	ENST00000497065	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SPEG-223	ENST00000497065	CUL7	Q14999	1698 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SPEG-223	ENST00000497065	IGF1R	P08069	1367 aa		31.12	■■■□□ 2.57
SPEG-223	ENST00000497065	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SPEG-223	ENST00000497065	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SPEG-223	ENST00000497065	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	30.97	■■■□□ 2.55

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