RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497028.5

ZFAND4-209, Transcript of zinc finger AN1-type containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene ZFAND4, Length 920 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFAND4-209ENST00000497028 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.17■■■■■ 7.38
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ZFAND4-209ENST00000497028 WDR97A6NE52 1622 aa43.9■■■■■ 4.62
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ZFAND4-209ENST00000497028 GRIN2BQ13224 1484 aa43.69■■■■■ 4.58
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