RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496699.1

PTGFRN-202, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

TSL 2

Gene PTGFRN, Length 553 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-202ENST00000496699 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.03■■■□□ 2.24
PTGFRN-202ENST00000496699 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.75■■□□□ 1.71
PTGFRN-202ENST00000496699 ABCC9O60706 1549 aa25.33■■□□□ 1.65
PTGFRN-202ENST00000496699 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.27■■□□□ 1.48
PTGFRN-202ENST00000496699 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.26■■□□□ 1.47
PTGFRN-202ENST00000496699 NACADO15069 1562 aa24.25■■□□□ 1.47
PTGFRN-202ENST00000496699 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
PTGFRN-202ENST00000496699 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.1■■□□□ 1.45
PTGFRN-202ENST00000496699 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.99■■□□□ 1.43
PTGFRN-202ENST00000496699 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.76■■□□□ 1.39
PTGFRN-202ENST00000496699 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
PTGFRN-202ENST00000496699 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.65■■□□□ 1.38
PTGFRN-202ENST00000496699 SCRIBQ14160 1630 aa23.53■■□□□ 1.36
PTGFRN-202ENST00000496699 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.43■■□□□ 1.34
PTGFRN-202ENST00000496699 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.27■■□□□ 1.32
PTGFRN-202ENST00000496699 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PTGFRN-202ENST00000496699 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.89■■□□□ 1.25
PTGFRN-202ENST00000496699 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.75■■□□□ 1.23
PTGFRN-202ENST00000496699 SMARCA4P51532 1647 aa22.51■■□□□ 1.19
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PTGFRN-202ENST00000496699 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.44■■□□□ 1.18
PTGFRN-202ENST00000496699 NCAPD3P42695 1498 aa22.43■■□□□ 1.18
PTGFRN-202ENST00000496699 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.4■■□□□ 1.18
PTGFRN-202ENST00000496699 SMARCA2P51531 1590 aa22.33■■□□□ 1.17
PTGFRN-202ENST00000496699 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.3■■□□□ 1.16
PTGFRN-202ENST00000496699 HMGXB3Q12766 1538 aa22.26■■□□□ 1.15
PTGFRN-202ENST00000496699 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTGFRN-202ENST00000496699 WIZO95785 1651 aa22.13■■□□□ 1.13
PTGFRN-202ENST00000496699 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PTGFRN-202ENST00000496699 NESP48681 1621 aa21.94■■□□□ 1.1
PTGFRN-202ENST00000496699 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PTGFRN-202ENST00000496699 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.78■■□□□ 1.08
PTGFRN-202ENST00000496699 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.77■■□□□ 1.08
PTGFRN-202ENST00000496699 ERCC6Q03468 1493 aa21.76■■□□□ 1.07
PTGFRN-202ENST00000496699 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.65■■□□□ 1.06
PTGFRN-202ENST00000496699 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.64■■□□□ 1.06
PTGFRN-202ENST00000496699 CFTRP13569 1480 aa21.63■■□□□ 1.05
PTGFRN-202ENST00000496699 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa21.61■■□□□ 1.05
PTGFRN-202ENST00000496699 CUX2O14529 1486 aa21.57■■□□□ 1.04
PTGFRN-202ENST00000496699 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PTGFRN-202ENST00000496699 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PTGFRN-202ENST00000496699 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.49■■□□□ 1.03
PTGFRN-202ENST00000496699 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.45■■□□□ 1.02
PTGFRN-202ENST00000496699 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.44■■□□□ 1.02
PTGFRN-202ENST00000496699 WDR62O43379 1518 aa21.39■■□□□ 1.01
PTGFRN-202ENST00000496699 PRDM2Q13029 1718 aa21.35■■□□□ 1.01
PTGFRN-202ENST00000496699 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
PTGFRN-202ENST00000496699 TOPBP1Q92547 1522 aa21.15■□□□□ 0.98
PTGFRN-202ENST00000496699 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.1■□□□□ 0.97
PTGFRN-202ENST00000496699 ABCC8Q09428 1581 aa21.09■□□□□ 0.97
PTGFRN-202ENST00000496699 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.05■□□□□ 0.96
PTGFRN-202ENST00000496699 IFT140Q96RY7 1462 aa21.01■□□□□ 0.95
PTGFRN-202ENST00000496699 CUX1P39880 1505 aa21■□□□□ 0.95
PTGFRN-202ENST00000496699 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
PTGFRN-202ENST00000496699 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
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PTGFRN-202ENST00000496699 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.92■□□□□ 0.94
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PTGFRN-202ENST00000496699 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PTGFRN-202ENST00000496699 SYNJ1O43426 1573 aa20.79■□□□□ 0.92
PTGFRN-202ENST00000496699 TOP2BQ02880 1626 aa20.76■□□□□ 0.91
PTGFRN-202ENST00000496699 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.76■□□□□ 0.91
PTGFRN-202ENST00000496699 WDR97A6NE52 1622 aa20.73■□□□□ 0.91
PTGFRN-202ENST00000496699 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.71■□□□□ 0.91
PTGFRN-202ENST00000496699 OSCARQ8IYS5 282 aa20.7■□□□□ 0.9
PTGFRN-202ENST00000496699 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.63■□□□□ 0.89
PTGFRN-202ENST00000496699 GRIN2BQ13224 1484 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGFRN-202ENST00000496699 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGFRN-202ENST00000496699 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.62■□□□□ 0.89
PTGFRN-202ENST00000496699 CHD1O14646 1710 aa20.57■□□□□ 0.88
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PTGFRN-202ENST00000496699 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PTGFRN-202ENST00000496699 SYNJ2O15056 1496 aa20.5■□□□□ 0.87
PTGFRN-202ENST00000496699 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.43■□□□□ 0.86
PTGFRN-202ENST00000496699 ADAMTS12P58397 1594 aa20.42■□□□□ 0.86
PTGFRN-202ENST00000496699 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.39■□□□□ 0.85
PTGFRN-202ENST00000496699 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.39■□□□□ 0.85
PTGFRN-202ENST00000496699 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa20.38■□□□□ 0.85
PTGFRN-202ENST00000496699 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.38■□□□□ 0.85
PTGFRN-202ENST00000496699 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.38■□□□□ 0.85
PTGFRN-202ENST00000496699 GRIN2AQ12879 1464 aa20.37■□□□□ 0.85
PTGFRN-202ENST00000496699 ARHGEF11O15085 1522 aa20.37■□□□□ 0.85
PTGFRN-202ENST00000496699 KIF27Q86VH2 1401 aa20.36■□□□□ 0.85
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PTGFRN-202ENST00000496699 CEP170Q5SW79 1584 aa20.29■□□□□ 0.84
PTGFRN-202ENST00000496699 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.27■□□□□ 0.84
PTGFRN-202ENST00000496699 ARAP1Q96P48 1450 aa20.23■□□□□ 0.83
PTGFRN-202ENST00000496699 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.21■□□□□ 0.83
PTGFRN-202ENST00000496699 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.2■□□□□ 0.82
PTGFRN-202ENST00000496699 CUL7Q14999 1698 aa20.19■□□□□ 0.82
PTGFRN-202ENST00000496699 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.17■□□□□ 0.82
PTGFRN-202ENST00000496699 SHROOM2Q13796 1616 aa20.14■□□□□ 0.81
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