RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496527.1

CHRD-217, Transcript of chordin, humanhuman

TSL 4

Gene CHRD, Length 588 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRD-217ENST00000496527 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.03■■■■■ 6.4
CHRD-217ENST00000496527 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.87■■■■■ 5.41
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CHRD-217ENST00000496527 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.11■■■■■ 4.97
CHRD-217ENST00000496527 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.05■■■■■ 4.96
CHRD-217ENST00000496527 NACADO15069 1562 aa46■■■■■ 4.95
CHRD-217ENST00000496527 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.82■■■■■ 4.93
CHRD-217ENST00000496527 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.7■■■■■ 4.91
CHRD-217ENST00000496527 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.51■■■■■ 4.88
CHRD-217ENST00000496527 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.92■■■■■ 4.78
CHRD-217ENST00000496527 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.8■■■■■ 4.761e-8■□□□□ 8.3
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CHRD-217ENST00000496527 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.17■■■■■ 4.66
CHRD-217ENST00000496527 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.96■■■■■ 4.63
CHRD-217ENST00000496527 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
CHRD-217ENST00000496527 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.3■■■■■ 4.52
CHRD-217ENST00000496527 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.04■■■■■ 4.48
CHRD-217ENST00000496527 SMARCA4P51532 1647 aa42.68■■■■■ 4.42
CHRD-217ENST00000496527 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
CHRD-217ENST00000496527 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.48■■■■■ 4.39
CHRD-217ENST00000496527 NCAPD3P42695 1498 aa42.46■■■■■ 4.39
CHRD-217ENST00000496527 SMARCA2P51531 1590 aa42.43■■■■■ 4.38
CHRD-217ENST00000496527 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.4■■■■■ 4.38
CHRD-217ENST00000496527 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.25■■■■■ 4.35
CHRD-217ENST00000496527 HMGXB3Q12766 1538 aa42.22■■■■■ 4.35
CHRD-217ENST00000496527 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
CHRD-217ENST00000496527 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
CHRD-217ENST00000496527 WIZO95785 1651 aa41.94■■■■■ 4.3
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CHRD-217ENST00000496527 NESP48681 1621 aa41.43■■■■■ 4.22
CHRD-217ENST00000496527 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.32■■■■■ 4.2
CHRD-217ENST00000496527 ERCC6Q03468 1493 aa41.31■■■■■ 4.2
CHRD-217ENST00000496527 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.25■■■■■ 4.19
CHRD-217ENST00000496527 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.1■■■■■ 4.17
CHRD-217ENST00000496527 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.04■■■■■ 4.16
CHRD-217ENST00000496527 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
CHRD-217ENST00000496527 CFTRP13569 1480 aa40.97■■■■■ 4.15
CHRD-217ENST00000496527 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.9■■■■■ 4.14
CHRD-217ENST00000496527 CUX2O14529 1486 aa40.83■■■■■ 4.13
CHRD-217ENST00000496527 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
CHRD-217ENST00000496527 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.76■■■■■ 4.12
CHRD-217ENST00000496527 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.7■■■■■ 4.11
CHRD-217ENST00000496527 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.64■■■■■ 4.1
CHRD-217ENST00000496527 PRDM2Q13029 1718 aa40.59■■■■■ 4.09
CHRD-217ENST00000496527 WDR62O43379 1518 aa40.48■■■■■ 4.07
CHRD-217ENST00000496527 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
CHRD-217ENST00000496527 ABCC8Q09428 1581 aa40.12■■■■■ 4.01
CHRD-217ENST00000496527 TOPBP1Q92547 1522 aa40.1■■■■■ 4.01
CHRD-217ENST00000496527 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.04■■■■■ 4
CHRD-217ENST00000496527 IFT140Q96RY7 1462 aa39.86■■■■□ 3.97
CHRD-217ENST00000496527 CUX1P39880 1505 aa39.78■■■■□ 3.96
CHRD-217ENST00000496527 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.75■■■■□ 3.95
CHRD-217ENST00000496527 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.67■■■■□ 3.94
CHRD-217ENST00000496527 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.66■■■■□ 3.94
CHRD-217ENST00000496527 SOGA1O94964 1423 aa39.64■■■■□ 3.94
CHRD-217ENST00000496527 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.62■■■■□ 3.93
CHRD-217ENST00000496527 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.62■■■■□ 3.93
CHRD-217ENST00000496527 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.6■■■■□ 3.93
CHRD-217ENST00000496527 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.57■■■■□ 3.92
CHRD-217ENST00000496527 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
CHRD-217ENST00000496527 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.47■■■■□ 3.91
CHRD-217ENST00000496527 TOP2BQ02880 1626 aa39.43■■■■□ 3.9
CHRD-217ENST00000496527 SYNJ1O43426 1573 aa39.42■■■■□ 3.9
CHRD-217ENST00000496527 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.41■■■■□ 3.9
CHRD-217ENST00000496527 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
CHRD-217ENST00000496527 WDR97A6NE52 1622 aa39.32■■■■□ 3.88
CHRD-217ENST00000496527 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.28■■■■□ 3.88
CHRD-217ENST00000496527 OSCARQ8IYS5 282 aa39.22■■■■□ 3.87
CHRD-217ENST00000496527 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.16■■■■□ 3.86
CHRD-217ENST00000496527 GRIN2BQ13224 1484 aa39.15■■■■□ 3.86
CHRD-217ENST00000496527 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.09■■■■□ 3.85
CHRD-217ENST00000496527 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.08■■■■□ 3.85
CHRD-217ENST00000496527 FBLN2P98095 1184 aa39.07■■■■□ 3.85
CHRD-217ENST00000496527 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.04■■■■□ 3.84
CHRD-217ENST00000496527 PBRM1Q86U86 1689 aa39.01■■■■□ 3.84
CHRD-217ENST00000496527 CHD1O14646 1710 aa38.97■■■■□ 3.83
CHRD-217ENST00000496527 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
CHRD-217ENST00000496527 SYNJ2O15056 1496 aa38.89■■■■□ 3.82
CHRD-217ENST00000496527 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.8■■■■□ 3.8
CHRD-217ENST00000496527 KIF27Q86VH2 1401 aa38.75■■■■□ 3.79
CHRD-217ENST00000496527 ADAMTS12P58397 1594 aa38.72■■■■□ 3.79
CHRD-217ENST00000496527 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.71■■■■□ 3.79
CHRD-217ENST00000496527 TRIM41Q8WV44 630 aa38.7■■■■□ 3.79
CHRD-217ENST00000496527 GRIN2AQ12879 1464 aa38.63■■■■□ 3.77
CHRD-217ENST00000496527 IGF1RP08069 1367 aa38.59■■■■□ 3.77
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CHRD-217ENST00000496527 ARHGEF11O15085 1522 aa38.51■■■■□ 3.76
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CHRD-217ENST00000496527 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.49■■■■□ 3.75
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CHRD-217ENST00000496527 NUP160Q12769 1436 aa38.46■■■■□ 3.75
CHRD-217ENST00000496527 CUL7Q14999 1698 aa38.43■■■■□ 3.74
CHRD-217ENST00000496527 CEP170Q5SW79 1584 aa38.41■■■■□ 3.74
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CHRD-217ENST00000496527 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.23■■■■□ 3.71
CHRD-217ENST00000496527 CHIC1Q5VXU3 224 aa38.2■■■■□ 3.71
CHRD-217ENST00000496527 ARAP1Q96P48 1450 aa38.19■■■■□ 3.7
CHRD-217ENST00000496527 JPH4Q96JJ6 628 aa38.13■■■■□ 3.69
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