RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496187.5

CCZ1B-213, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-213ENST00000496187 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.05■■■■■ 8.32
CCZ1B-213ENST00000496187 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.92■■■■■ 7.18
CCZ1B-213ENST00000496187 ABCC9O60706 1549 aa59.05■■■■■ 7.04
CCZ1B-213ENST00000496187 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.67■■■■■ 6.66
CCZ1B-213ENST00000496187 NACADO15069 1562 aa56.46■■■■■ 6.63
CCZ1B-213ENST00000496187 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.34■■■■■ 6.61
CCZ1B-213ENST00000496187 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.93■■■■■ 6.54
CCZ1B-213ENST00000496187 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.73■■■■■ 6.51
CCZ1B-213ENST00000496187 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.48■■■■■ 6.47
CCZ1B-213ENST00000496187 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.26■■■■■ 6.44
CCZ1B-213ENST00000496187 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.07■■■■■ 6.41
CCZ1B-213ENST00000496187 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.8■■■■■ 6.36
CCZ1B-213ENST00000496187 SCRIBQ14160 1630 aa54.59■■■■■ 6.33
CCZ1B-213ENST00000496187 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.51■■■■■ 6.32
CCZ1B-213ENST00000496187 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.38■■■■■ 6.3
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CCZ1B-213ENST00000496187 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.4■■■■■ 6.14
CCZ1B-213ENST00000496187 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.15■■■■■ 6.1
CCZ1B-213ENST00000496187 SMARCA4P51532 1647 aa52.15■■■■■ 5.94
CCZ1B-213ENST00000496187 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.08■■■■■ 5.93
CCZ1B-213ENST00000496187 NCAPD3P42695 1498 aa52.05■■■■■ 5.92
CCZ1B-213ENST00000496187 SMARCA2P51531 1590 aa51.99■■■■■ 5.91
CCZ1B-213ENST00000496187 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.98■■■■■ 5.91
CCZ1B-213ENST00000496187 HMGXB3Q12766 1538 aa51.78■■■■■ 5.88
CCZ1B-213ENST00000496187 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.63■■■■■ 5.86
CCZ1B-213ENST00000496187 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.62■■■■■ 5.85
CCZ1B-213ENST00000496187 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.61■■■■■ 5.85
CCZ1B-213ENST00000496187 ERCC6Q03468 1493 aa51.07■■■■■ 5.77
CCZ1B-213ENST00000496187 WIZO95785 1651 aa51.06■■■■■ 5.76
CCZ1B-213ENST00000496187 NESP48681 1621 aa50.89■■■■■ 5.74
CCZ1B-213ENST00000496187 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.86■■■■■ 5.73
CCZ1B-213ENST00000496187 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.82■■■■■ 5.73
CCZ1B-213ENST00000496187 CUX2O14529 1486 aa50.67■■■■■ 5.7
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CCZ1B-213ENST00000496187 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.53■■■■■ 5.68
CCZ1B-213ENST00000496187 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.53■■■■■ 5.68
CCZ1B-213ENST00000496187 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.33■■■■■ 5.65
CCZ1B-213ENST00000496187 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.27■■■■■ 5.64
CCZ1B-213ENST00000496187 CFTRP13569 1480 aa50.09■■■■■ 5.61
CCZ1B-213ENST00000496187 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.99■■■■■ 5.59
CCZ1B-213ENST00000496187 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.98■■■■■ 5.59
CCZ1B-213ENST00000496187 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.95■■■■■ 5.59
CCZ1B-213ENST00000496187 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.9■■■■■ 5.58
CCZ1B-213ENST00000496187 WDR62O43379 1518 aa49.81■■■■■ 5.56
CCZ1B-213ENST00000496187 PRDM2Q13029 1718 aa49.75■■■■■ 5.55
CCZ1B-213ENST00000496187 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.65■■■■■ 5.54
CCZ1B-213ENST00000496187 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.41■■■■■ 5.5
CCZ1B-213ENST00000496187 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.26■■■■■ 5.48
CCZ1B-213ENST00000496187 ABCC8Q09428 1581 aa49.16■■■■■ 5.46
CCZ1B-213ENST00000496187 TOPBP1Q92547 1522 aa49.08■■■■■ 5.45
CCZ1B-213ENST00000496187 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.01■■■■■ 5.44
CCZ1B-213ENST00000496187 IFT140Q96RY7 1462 aa48.95■■■■■ 5.43
CCZ1B-213ENST00000496187 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.66■■■■■ 5.38
CCZ1B-213ENST00000496187 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.61■■■■■ 5.37
CCZ1B-213ENST00000496187 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.54■■■■■ 5.36
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CCZ1B-213ENST00000496187 OSCARQ8IYS5 282 aa48.49■■■■■ 5.35
CCZ1B-213ENST00000496187 CUX1P39880 1505 aa48.48■■■■■ 5.35
CCZ1B-213ENST00000496187 SOGA1O94964 1423 aa48.45■■■■■ 5.35
CCZ1B-213ENST00000496187 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.43■■■■■ 5.34
CCZ1B-213ENST00000496187 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.37■■■■■ 5.33
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CCZ1B-213ENST00000496187 WDR97A6NE52 1622 aa48.27■■■■■ 5.32
CCZ1B-213ENST00000496187 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.2■■■■■ 5.31
CCZ1B-213ENST00000496187 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.05■■■■■ 5.28
CCZ1B-213ENST00000496187 CHD1O14646 1710 aa48.01■■■■■ 5.28
CCZ1B-213ENST00000496187 FBLN2P98095 1184 aa48■■■■■ 5.27
CCZ1B-213ENST00000496187 TOP2BQ02880 1626 aa47.98■■■■■ 5.27
CCZ1B-213ENST00000496187 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.97■■■■■ 5.27
CCZ1B-213ENST00000496187 GRIN2BQ13224 1484 aa47.97■■■■■ 5.27
CCZ1B-213ENST00000496187 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.95■■■■■ 5.27
CCZ1B-213ENST00000496187 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.94■■■■■ 5.26
CCZ1B-213ENST00000496187 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.91■■■■■ 5.26
CCZ1B-213ENST00000496187 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.89■■■■■ 5.26
CCZ1B-213ENST00000496187 SYNJ1O43426 1573 aa47.88■■■■■ 5.25
CCZ1B-213ENST00000496187 TRIM41Q8WV44 630 aa47.86■■■■■ 5.25
CCZ1B-213ENST00000496187 PBRM1Q86U86 1689 aa47.82■■■■■ 5.25
CCZ1B-213ENST00000496187 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.79■■■■■ 5.24
CCZ1B-213ENST00000496187 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.78■■■■■ 5.24
CCZ1B-213ENST00000496187 SYNJ2O15056 1496 aa47.71■■■■■ 5.23
CCZ1B-213ENST00000496187 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.7■■■■■ 5.23
CCZ1B-213ENST00000496187 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.7■■■■■ 5.23
CCZ1B-213ENST00000496187 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.7■■■■■ 5.23
CCZ1B-213ENST00000496187 ARHGEF11O15085 1522 aa47.64■■■■■ 5.22
CCZ1B-213ENST00000496187 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.44■■■■■ 5.18
CCZ1B-213ENST00000496187 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.4■■■■■ 5.18
CCZ1B-213ENST00000496187 ADAMTS12P58397 1594 aa47.39■■■■■ 5.18
CCZ1B-213ENST00000496187 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.33■■■■■ 5.17
CCZ1B-213ENST00000496187 GRIN2AQ12879 1464 aa47.32■■■■■ 5.17
CCZ1B-213ENST00000496187 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.26■■■■■ 5.16
CCZ1B-213ENST00000496187 ARAP1Q96P48 1450 aa47.18■■■■■ 5.14
CCZ1B-213ENST00000496187 KIF27Q86VH2 1401 aa47.13■■■■■ 5.14
CCZ1B-213ENST00000496187 NUP160Q12769 1436 aa47.1■■■■■ 5.13
CCZ1B-213ENST00000496187 CEP170Q5SW79 1584 aa47.06■■■■■ 5.12
CCZ1B-213ENST00000496187 CUL7Q14999 1698 aa46.91■■■■■ 5.1
CCZ1B-213ENST00000496187 IGF1RP08069 1367 aa46.89■■■■■ 5.1
CCZ1B-213ENST00000496187 SHROOM2Q13796 1616 aa46.8■■■■■ 5.08
CCZ1B-213ENST00000496187 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.69■■■■■ 5.07
CCZ1B-213ENST00000496187 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.68■■■■■ 5.06
CCZ1B-213ENST00000496187 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa46.67■■■■■ 5.06
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