RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496065.1

C4B-215, Transcript of complement C4B (Chido blood group), humanhuman

TSL 3

Gene C4B, Length 974 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4B-215ENST00000496065 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.78■■■■■ 6.68
C4B-215ENST00000496065 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.66■■■■■ 5.7
C4B-215ENST00000496065 ABCC9O60706 1549 aa50.34■■■■■ 5.65
C4B-215ENST00000496065 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.09■■■■■ 5.29
C4B-215ENST00000496065 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.88■■■■■ 5.26
C4B-215ENST00000496065 NACADO15069 1562 aa47.88■■■■■ 5.25
C4B-215ENST00000496065 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.38■■■■■ 5.18
C4B-215ENST00000496065 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.12■■■■■ 5.13
C4B-215ENST00000496065 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.01■■■■■ 5.12
C4B-215ENST00000496065 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.93■■■■■ 5.1
C4B-215ENST00000496065 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.89■■■■■ 5.1
C4B-215ENST00000496065 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.83■■■■■ 5.09
C4B-215ENST00000496065 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.62■■■■■ 5.05
C4B-215ENST00000496065 SCRIBQ14160 1630 aa46.21■■■■■ 4.99
C4B-215ENST00000496065 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.11■■■■■ 4.97
C4B-215ENST00000496065 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.47■■■■■ 4.87
C4B-215ENST00000496065 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.44■■■■■ 4.87
C4B-215ENST00000496065 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.31■■■■■ 4.84
C4B-215ENST00000496065 NCAPD3P42695 1498 aa44.25■■■■■ 4.67
C4B-215ENST00000496065 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.15■■■■■ 4.66
C4B-215ENST00000496065 SMARCA4P51532 1647 aa44.13■■■■■ 4.66
C4B-215ENST00000496065 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.04■■■■■ 4.64
C4B-215ENST00000496065 SMARCA2P51531 1590 aa44.03■■■■■ 4.64
C4B-215ENST00000496065 HMGXB3Q12766 1538 aa43.89■■■■■ 4.62
C4B-215ENST00000496065 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
C4B-215ENST00000496065 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.74■■■■■ 4.59
C4B-215ENST00000496065 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.73■■■■■ 4.59
C4B-215ENST00000496065 ERCC6Q03468 1493 aa43.45■■■■■ 4.55
C4B-215ENST00000496065 NESP48681 1621 aa43.34■■■■■ 4.53
C4B-215ENST00000496065 CUX2O14529 1486 aa43.21■■■■■ 4.51
C4B-215ENST00000496065 WIZO95785 1651 aa43.18■■■■■ 4.5
C4B-215ENST00000496065 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.12■■■■■ 4.49
C4B-215ENST00000496065 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.05■■■■■ 4.48
C4B-215ENST00000496065 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.94■■■■■ 4.46
C4B-215ENST00000496065 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.94■■■■■ 4.46
C4B-215ENST00000496065 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.78■■■■■ 4.44
C4B-215ENST00000496065 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
C4B-215ENST00000496065 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
C4B-215ENST00000496065 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.7■■■■■ 4.43
C4B-215ENST00000496065 CFTRP13569 1480 aa42.51■■■■■ 4.4
C4B-215ENST00000496065 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.49■■■■■ 4.39
C4B-215ENST00000496065 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.41■■■■■ 4.38
C4B-215ENST00000496065 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.4■■■■■ 4.38
C4B-215ENST00000496065 WDR62O43379 1518 aa42.31■■■■■ 4.36
C4B-215ENST00000496065 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.27■■■■■ 4.36
C4B-215ENST00000496065 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
C4B-215ENST00000496065 PRDM2Q13029 1718 aa41.92■■■■■ 4.3
C4B-215ENST00000496065 TOPBP1Q92547 1522 aa41.64■■■■■ 4.26
C4B-215ENST00000496065 ABCC8Q09428 1581 aa41.63■■■■■ 4.26
C4B-215ENST00000496065 IFT140Q96RY7 1462 aa41.56■■■■■ 4.24
C4B-215ENST00000496065 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
C4B-215ENST00000496065 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.5■■■■■ 4.23
C4B-215ENST00000496065 OSCARQ8IYS5 282 aa41.43■■■■■ 4.22
C4B-215ENST00000496065 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
C4B-215ENST00000496065 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
C4B-215ENST00000496065 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
C4B-215ENST00000496065 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.15■■■■■ 4.18
C4B-215ENST00000496065 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
C4B-215ENST00000496065 SOGA1O94964 1423 aa41.13■■■■■ 4.17
C4B-215ENST00000496065 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.09■■■■■ 4.17
C4B-215ENST00000496065 TRIM41Q8WV44 630 aa41.08■■■■■ 4.17
C4B-215ENST00000496065 CUX1P39880 1505 aa41.06■■■■■ 4.16
C4B-215ENST00000496065 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.04■■■■■ 4.16
C4B-215ENST00000496065 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
C4B-215ENST00000496065 FBLN2P98095 1184 aa40.86■■■■■ 4.13
C4B-215ENST00000496065 WDR97A6NE52 1622 aa40.82■■■■■ 4.12
C4B-215ENST00000496065 CHD1O14646 1710 aa40.71■■■■■ 4.11
C4B-215ENST00000496065 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.7■■■■■ 4.11
C4B-215ENST00000496065 GRIN2BQ13224 1484 aa40.69■■■■■ 4.1
C4B-215ENST00000496065 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.66■■■■■ 4.1
C4B-215ENST00000496065 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.66■■■■■ 4.1
C4B-215ENST00000496065 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.66■■■■■ 4.1
C4B-215ENST00000496065 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
C4B-215ENST00000496065 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.09
C4B-215ENST00000496065 ARHGEF11O15085 1522 aa40.62■■■■■ 4.09
C4B-215ENST00000496065 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.62■■■■■ 4.09
C4B-215ENST00000496065 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.6■■■■■ 4.09
C4B-215ENST00000496065 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.6■■■■■ 4.09
C4B-215ENST00000496065 TOP2BQ02880 1626 aa40.51■■■■■ 4.08
C4B-215ENST00000496065 SYNJ2O15056 1496 aa40.49■■■■■ 4.07
C4B-215ENST00000496065 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.46■■■■■ 4.07
C4B-215ENST00000496065 SYNJ1O43426 1573 aa40.45■■■■■ 4.07
C4B-215ENST00000496065 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.43■■■■■ 4.06
C4B-215ENST00000496065 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.41■■■■■ 4.06
C4B-215ENST00000496065 PBRM1Q86U86 1689 aa40.4■■■■■ 4.06
C4B-215ENST00000496065 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.33■■■■■ 4.05
C4B-215ENST00000496065 ARAP1Q96P48 1450 aa40.25■■■■■ 4.03
C4B-215ENST00000496065 GRIN2AQ12879 1464 aa40.14■■■■■ 4.02
C4B-215ENST00000496065 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.12■■■■■ 4.01
C4B-215ENST00000496065 ADAMTS12P58397 1594 aa40.11■■■■■ 4.01
C4B-215ENST00000496065 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.11■■■■■ 4.01
C4B-215ENST00000496065 NUP160Q12769 1436 aa39.99■■■■□ 3.99
C4B-215ENST00000496065 CEP170Q5SW79 1584 aa39.92■■■■□ 3.98
C4B-215ENST00000496065 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
C4B-215ENST00000496065 KIF27Q86VH2 1401 aa39.82■■■■□ 3.97
C4B-215ENST00000496065 IGF1RP08069 1367 aa39.78■■■■□ 3.96
C4B-215ENST00000496065 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.72■■■■□ 3.95
C4B-215ENST00000496065 SHROOM2Q13796 1616 aa39.69■■■■□ 3.94
C4B-215ENST00000496065 JPH4Q96JJ6 628 aa39.69■■■■□ 3.94
C4B-215ENST00000496065 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP39.62■■■■□ 3.93
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