RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495931.1

PRRT4-206, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene PRRT4, Length 814 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-206ENST00000495931 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.31■■■■■ 6.92
PRRT4-206ENST00000495931 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.07■■■■■ 5.93
PRRT4-206ENST00000495931 ABCC9O60706 1549 aa51.84■■■■■ 5.89
PRRT4-206ENST00000495931 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.36■■■■■ 5.49
PRRT4-206ENST00000495931 NACADO15069 1562 aa49.16■■■■■ 5.46
PRRT4-206ENST00000495931 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49■■■■■ 5.43
PRRT4-206ENST00000495931 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.7■■■■■ 5.39
PRRT4-206ENST00000495931 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.53■■■■■ 5.36
PRRT4-206ENST00000495931 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.44■■■■■ 5.34
PRRT4-206ENST00000495931 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.4■■■■■ 5.34
PRRT4-206ENST00000495931 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.38■■■■■ 5.34
PRRT4-206ENST00000495931 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.23■■■■■ 5.31
PRRT4-206ENST00000495931 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.13■■■■■ 5.3
PRRT4-206ENST00000495931 SCRIBQ14160 1630 aa47.56■■■■■ 5.2
PRRT4-206ENST00000495931 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.38■■■■■ 5.17
PRRT4-206ENST00000495931 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.83■■■■■ 5.09
PRRT4-206ENST00000495931 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.79■■■■■ 5.08
PRRT4-206ENST00000495931 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.58■■■■■ 5.05
PRRT4-206ENST00000495931 NCAPD3P42695 1498 aa45.42■■■■■ 4.86
PRRT4-206ENST00000495931 SMARCA4P51532 1647 aa45.39■■■■■ 4.86
PRRT4-206ENST00000495931 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.37■■■■■ 4.85
PRRT4-206ENST00000495931 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.22■■■■■ 4.83
PRRT4-206ENST00000495931 SMARCA2P51531 1590 aa45.2■■■■■ 4.83
PRRT4-206ENST00000495931 HMGXB3Q12766 1538 aa45.07■■■■■ 4.81
PRRT4-206ENST00000495931 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.03■■■■■ 4.8
PRRT4-206ENST00000495931 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.94■■■■■ 4.79
PRRT4-206ENST00000495931 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.87■■■■■ 4.77
PRRT4-206ENST00000495931 NESP48681 1621 aa44.72■■■■■ 4.75
PRRT4-206ENST00000495931 ERCC6Q03468 1493 aa44.55■■■■■ 4.72
PRRT4-206ENST00000495931 WIZO95785 1651 aa44.48■■■■■ 4.71
PRRT4-206ENST00000495931 CUX2O14529 1486 aa44.36■■■■■ 4.69
PRRT4-206ENST00000495931 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.26■■■■■ 4.68
PRRT4-206ENST00000495931 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.19■■■■■ 4.66
PRRT4-206ENST00000495931 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
PRRT4-206ENST00000495931 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.07■■■■■ 4.65
PRRT4-206ENST00000495931 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.06■■■■■ 4.64
PRRT4-206ENST00000495931 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.05■■■■■ 4.64
PRRT4-206ENST00000495931 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.04■■■■■ 4.64
PRRT4-206ENST00000495931 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.86■■■■■ 4.61
PRRT4-206ENST00000495931 CFTRP13569 1480 aa43.64■■■■■ 4.58
PRRT4-206ENST00000495931 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.61■■■■■ 4.57
PRRT4-206ENST00000495931 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.54■■■■■ 4.56
PRRT4-206ENST00000495931 WDR62O43379 1518 aa43.53■■■■■ 4.56
PRRT4-206ENST00000495931 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.5■■■■■ 4.55
PRRT4-206ENST00000495931 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.43■■■■■ 4.54
PRRT4-206ENST00000495931 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.26■■■■■ 4.52
PRRT4-206ENST00000495931 PRDM2Q13029 1718 aa43.14■■■■■ 4.5
PRRT4-206ENST00000495931 TOPBP1Q92547 1522 aa42.79■■■■■ 4.44
PRRT4-206ENST00000495931 ABCC8Q09428 1581 aa42.74■■■■■ 4.43
PRRT4-206ENST00000495931 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.69■■■■■ 4.42
PRRT4-206ENST00000495931 IFT140Q96RY7 1462 aa42.64■■■■■ 4.42
PRRT4-206ENST00000495931 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.61■■■■■ 4.41
PRRT4-206ENST00000495931 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
PRRT4-206ENST00000495931 OSCARQ8IYS5 282 aa42.43■■■■■ 4.38
PRRT4-206ENST00000495931 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
PRRT4-206ENST00000495931 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.38
PRRT4-206ENST00000495931 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
PRRT4-206ENST00000495931 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.31■■■■■ 4.36
PRRT4-206ENST00000495931 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.3■■■■■ 4.36
PRRT4-206ENST00000495931 CUX1P39880 1505 aa42.25■■■■■ 4.35
PRRT4-206ENST00000495931 TRIM41Q8WV44 630 aa42.25■■■■■ 4.35
PRRT4-206ENST00000495931 SOGA1O94964 1423 aa42.18■■■■■ 4.34
PRRT4-206ENST00000495931 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.17■■■■■ 4.34
PRRT4-206ENST00000495931 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
PRRT4-206ENST00000495931 CHD1O14646 1710 aa42■■■■■ 4.31
PRRT4-206ENST00000495931 WDR97A6NE52 1622 aa41.95■■■■■ 4.31
PRRT4-206ENST00000495931 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.94■■■■■ 4.3
PRRT4-206ENST00000495931 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.94■■■■■ 4.3
PRRT4-206ENST00000495931 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.94■■■■■ 4.3
PRRT4-206ENST00000495931 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.83■■■■■ 4.29
PRRT4-206ENST00000495931 ARHGEF11O15085 1522 aa41.82■■■■■ 4.29
PRRT4-206ENST00000495931 FBLN2P98095 1184 aa41.82■■■■■ 4.29
PRRT4-206ENST00000495931 GRIN2BQ13224 1484 aa41.74■■■■■ 4.27
PRRT4-206ENST00000495931 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.7■■■■■ 4.27
PRRT4-206ENST00000495931 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.7■■■■■ 4.27
PRRT4-206ENST00000495931 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.67■■■■■ 4.26
PRRT4-206ENST00000495931 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.66■■■■■ 4.26
PRRT4-206ENST00000495931 SYNJ1O43426 1573 aa41.64■■■■■ 4.26
PRRT4-206ENST00000495931 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
PRRT4-206ENST00000495931 TOP2BQ02880 1626 aa41.62■■■■■ 4.25
PRRT4-206ENST00000495931 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.61■■■■■ 4.25
PRRT4-206ENST00000495931 PBRM1Q86U86 1689 aa41.6■■■■■ 4.25
PRRT4-206ENST00000495931 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.59■■■■■ 4.25
PRRT4-206ENST00000495931 SYNJ2O15056 1496 aa41.55■■■■■ 4.24
PRRT4-206ENST00000495931 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.54■■■■■ 4.24
PRRT4-206ENST00000495931 ARAP1Q96P48 1450 aa41.5■■■■■ 4.23
PRRT4-206ENST00000495931 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.49■■■■■ 4.23
PRRT4-206ENST00000495931 ADAMTS12P58397 1594 aa41.25■■■■■ 4.19
PRRT4-206ENST00000495931 GRIN2AQ12879 1464 aa41.21■■■■■ 4.19
PRRT4-206ENST00000495931 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.19■■■■■ 4.18
PRRT4-206ENST00000495931 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.17■■■■■ 4.18
PRRT4-206ENST00000495931 CEP170Q5SW79 1584 aa41.13■■■■■ 4.18
PRRT4-206ENST00000495931 NUP160Q12769 1436 aa41.1■■■■■ 4.17
PRRT4-206ENST00000495931 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.07■■■■■ 4.16
PRRT4-206ENST00000495931 SHROOM2Q13796 1616 aa40.87■■■■■ 4.13
PRRT4-206ENST00000495931 KIF27Q86VH2 1401 aa40.86■■■■■ 4.13
PRRT4-206ENST00000495931 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
PRRT4-206ENST00000495931 IGF1RP08069 1367 aa40.81■■■■■ 4.12
PRRT4-206ENST00000495931 JPH4Q96JJ6 628 aa40.67■■■■■ 4.1
PRRT4-206ENST00000495931 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.66■■■■■ 4.1
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