RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495732.5

PCOLCE2-210, Transcript of procollagen C-endopeptidase enhancer 2, humanhuman

TSL 3

Gene PCOLCE2, Length 704 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCE2-210ENST00000495732 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.16■■■■■ 7.06
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PCOLCE2-210ENST00000495732 CUL7Q14999 1698 aa41.4■■■■■ 4.22
PCOLCE2-210ENST00000495732 SHROOM2Q13796 1616 aa41.35■■■■■ 4.21
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Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 346.2 ms