RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.68■■■■■ 6.98
SIMC1-208ENST00000495423 ABCC9O60706 1549 aa53.13■■■■■ 6.1
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.97■■■■■ 6.07
SIMC1-208ENST00000495423 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.51■■■■■ 5.68
SIMC1-208ENST00000495423 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.16■■■■■ 5.62
SIMC1-208ENST00000495423 NACADO15069 1562 aa50.09■■■■■ 5.61
SIMC1-208ENST00000495423 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.52■■■■■ 5.52
SIMC1-208ENST00000495423 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.45■■■■■ 5.51
SIMC1-208ENST00000495423 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.31■■■■■ 5.48
SIMC1-208ENST00000495423 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.31■■■■■ 5.48
SIMC1-208ENST00000495423 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.08■■■■■ 5.45
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SIMC1-208ENST00000495423 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.42■■■■■ 5.34
SIMC1-208ENST00000495423 SCRIBQ14160 1630 aa48.09■■■■■ 5.29
SIMC1-208ENST00000495423 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.07■■■■■ 5.29
SIMC1-208ENST00000495423 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.93■■■■■ 5.26
SIMC1-208ENST00000495423 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.88■■■■■ 5.25
SIMC1-208ENST00000495423 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.38■■■■■ 5.02
SIMC1-208ENST00000495423 NCAPD3P42695 1498 aa46.2■■■■■ 4.99
SIMC1-208ENST00000495423 CUX2O14529 1486 aa46.04■■■■■ 4.96
SIMC1-208ENST00000495423 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.98■■■■■ 4.95
SIMC1-208ENST00000495423 SMARCA4P51532 1647 aa45.9■■■■■ 4.94
SIMC1-208ENST00000495423 ERCC6Q03468 1493 aa45.9■■■■■ 4.94
SIMC1-208ENST00000495423 SMARCA2P51531 1590 aa45.88■■■■■ 4.94
SIMC1-208ENST00000495423 HMGXB3Q12766 1538 aa45.87■■■■■ 4.93
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SIMC1-208ENST00000495423 NESP48681 1621 aa45.55■■■■■ 4.88
SIMC1-208ENST00000495423 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.51■■■■■ 4.88
SIMC1-208ENST00000495423 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.5■■■■■ 4.87
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SIMC1-208ENST00000495423 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.28■■■■■ 4.84
SIMC1-208ENST00000495423 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.18■■■■■ 4.82
SIMC1-208ENST00000495423 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.09■■■■■ 4.81
SIMC1-208ENST00000495423 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.93■■■■■ 4.78
SIMC1-208ENST00000495423 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.72■■■■■ 4.75
SIMC1-208ENST00000495423 WIZO95785 1651 aa44.67■■■■■ 4.74
SIMC1-208ENST00000495423 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.59■■■■■ 4.73
SIMC1-208ENST00000495423 WDR62O43379 1518 aa44.55■■■■■ 4.72
SIMC1-208ENST00000495423 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.34■■■■■ 4.69
SIMC1-208ENST00000495423 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.23■■■■■ 4.67
SIMC1-208ENST00000495423 CFTRP13569 1480 aa44.18■■■■■ 4.66
SIMC1-208ENST00000495423 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
SIMC1-208ENST00000495423 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.07■■■■■ 4.65
SIMC1-208ENST00000495423 TRIM41Q8WV44 630 aa44.07■■■■■ 4.65
SIMC1-208ENST00000495423 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
SIMC1-208ENST00000495423 PRDM2Q13029 1718 aa43.91■■■■■ 4.62
SIMC1-208ENST00000495423 OSCARQ8IYS5 282 aa43.76■■■■■ 4.6
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.52■■■■■ 4.56
SIMC1-208ENST00000495423 IFT140Q96RY7 1462 aa43.46■■■■■ 4.55
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
SIMC1-208ENST00000495423 TOPBP1Q92547 1522 aa43.38■■■■■ 4.53
SIMC1-208ENST00000495423 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
SIMC1-208ENST00000495423 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
SIMC1-208ENST00000495423 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.37■■■■■ 4.53
SIMC1-208ENST00000495423 ABCC8Q09428 1581 aa43.29■■■■■ 4.52
SIMC1-208ENST00000495423 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
SIMC1-208ENST00000495423 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.22■■■■■ 4.51
SIMC1-208ENST00000495423 ARHGEF11O15085 1522 aa43.15■■■■■ 4.5
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SIMC1-208ENST00000495423 CHD1O14646 1710 aa43.04■■■■■ 4.48
SIMC1-208ENST00000495423 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.94■■■■■ 4.46
SIMC1-208ENST00000495423 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
SIMC1-208ENST00000495423 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.72■■■■■ 4.43
SIMC1-208ENST00000495423 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.7■■■■■ 4.43
SIMC1-208ENST00000495423 ARAP1Q96P48 1450 aa42.68■■■■■ 4.42
SIMC1-208ENST00000495423 WDR97A6NE52 1622 aa42.68■■■■■ 4.42
SIMC1-208ENST00000495423 SOGA1O94964 1423 aa42.64■■■■■ 4.42
SIMC1-208ENST00000495423 FBLN2P98095 1184 aa42.63■■■■■ 4.41
SIMC1-208ENST00000495423 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
SIMC1-208ENST00000495423 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.57■■■■■ 4.41
SIMC1-208ENST00000495423 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.52■■■■■ 4.4
SIMC1-208ENST00000495423 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.49■■■■■ 4.39
SIMC1-208ENST00000495423 CUX1P39880 1505 aa42.48■■■■■ 4.39
SIMC1-208ENST00000495423 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.38
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SIMC1-208ENST00000495423 GRIN2BQ13224 1484 aa42.36■■■■■ 4.37
SIMC1-208ENST00000495423 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.34■■■■■ 4.37
SIMC1-208ENST00000495423 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
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SIMC1-208ENST00000495423 SYNJ2O15056 1496 aa42.29■■■■■ 4.36
SIMC1-208ENST00000495423 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.16■■■■■ 4.34
SIMC1-208ENST00000495423 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.13■■■■■ 4.33
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SIMC1-208ENST00000495423 GRIN2AQ12879 1464 aa41.84■■■■■ 4.29
SIMC1-208ENST00000495423 ADAMTS12P58397 1594 aa41.81■■■■■ 4.28
SIMC1-208ENST00000495423 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.8■■■■■ 4.28
SIMC1-208ENST00000495423 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.78■■■■■ 4.28
SIMC1-208ENST00000495423 TOP2BQ02880 1626 aa41.75■■■■■ 4.27
SIMC1-208ENST00000495423 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.75■■■■■ 4.27
SIMC1-208ENST00000495423 CEP170Q5SW79 1584 aa41.73■■■■■ 4.27
SIMC1-208ENST00000495423 NUP160Q12769 1436 aa41.72■■■■■ 4.27
SIMC1-208ENST00000495423 SHROOM2Q13796 1616 aa41.67■■■■■ 4.26
SIMC1-208ENST00000495423 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
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SIMC1-208ENST00000495423 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.58■■■■■ 4.25
SIMC1-208ENST00000495423 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
SIMC1-208ENST00000495423 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.37■■■■■ 4.21
SIMC1-208ENST00000495423 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
SIMC1-208ENST00000495423 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.24■■■■■ 4.19
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