RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495348.1

PHF21B-211, Transcript of PHD finger protein 21B, humanhuman

TSL 3

Gene PHF21B, Length 528 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21B-211ENST00000495348 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.47■■■■□ 3.27
PHF21B-211ENST00000495348 ABCC9O60706 1549 aa32.32■■■□□ 2.76
PHF21B-211ENST00000495348 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.01■■■□□ 2.72
PHF21B-211ENST00000495348 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.66■■■□□ 2.5
PHF21B-211ENST00000495348 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.59■■■□□ 2.49
PHF21B-211ENST00000495348 NACADO15069 1562 aa30.37■■■□□ 2.45
PHF21B-211ENST00000495348 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.13■■■□□ 2.41
PHF21B-211ENST00000495348 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.4
PHF21B-211ENST00000495348 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.91■■■□□ 2.38
PHF21B-211ENST00000495348 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.83■■■□□ 2.37
PHF21B-211ENST00000495348 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.71■■■□□ 2.35
PHF21B-211ENST00000495348 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.37■■■□□ 2.29
PHF21B-211ENST00000495348 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
PHF21B-211ENST00000495348 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.3■■■□□ 2.28
PHF21B-211ENST00000495348 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.2■■■□□ 2.26
PHF21B-211ENST00000495348 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.18■■■□□ 2.26
PHF21B-211ENST00000495348 SCRIBQ14160 1630 aa29.11■■■□□ 2.25
PHF21B-211ENST00000495348 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PHF21B-211ENST00000495348 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.44■■■□□ 2.14
PHF21B-211ENST00000495348 CUX2O14529 1486 aa28.06■■■□□ 2.08
PHF21B-211ENST00000495348 NCAPD3P42695 1498 aa28.02■■■□□ 2.08
PHF21B-211ENST00000495348 ERCC6Q03468 1493 aa27.99■■■□□ 2.07
PHF21B-211ENST00000495348 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.87■■■□□ 2.05
PHF21B-211ENST00000495348 SMARCA2P51531 1590 aa27.82■■■□□ 2.04
PHF21B-211ENST00000495348 HMGXB3Q12766 1538 aa27.77■■■□□ 2.04
PHF21B-211ENST00000495348 SMARCA4P51532 1647 aa27.74■■■□□ 2.03
PHF21B-211ENST00000495348 NESP48681 1621 aa27.63■■■□□ 2.01
PHF21B-211ENST00000495348 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
PHF21B-211ENST00000495348 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
PHF21B-211ENST00000495348 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.48■■□□□ 1.99
PHF21B-211ENST00000495348 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
PHF21B-211ENST00000495348 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.45■■□□□ 1.99
PHF21B-211ENST00000495348 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.33■■□□□ 1.97
PHF21B-211ENST00000495348 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.3■■□□□ 1.96
PHF21B-211ENST00000495348 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.29■■□□□ 1.96
PHF21B-211ENST00000495348 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.15■■□□□ 1.94
PHF21B-211ENST00000495348 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.09■■□□□ 1.93
PHF21B-211ENST00000495348 TRIM41Q8WV44 630 aa27.03■■□□□ 1.92
PHF21B-211ENST00000495348 WDR62O43379 1518 aa27.02■■□□□ 1.92
PHF21B-211ENST00000495348 WIZO95785 1651 aa26.95■■□□□ 1.91
PHF21B-211ENST00000495348 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.92■■□□□ 1.9
PHF21B-211ENST00000495348 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.84■■□□□ 1.89
PHF21B-211ENST00000495348 CFTRP13569 1480 aa26.75■■□□□ 1.87
PHF21B-211ENST00000495348 OSCARQ8IYS5 282 aa26.74■■□□□ 1.87
PHF21B-211ENST00000495348 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PHF21B-211ENST00000495348 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
PHF21B-211ENST00000495348 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
PHF21B-211ENST00000495348 PRDM2Q13029 1718 aa26.48■■□□□ 1.83
PHF21B-211ENST00000495348 IFT140Q96RY7 1462 aa26.4■■□□□ 1.82
PHF21B-211ENST00000495348 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.37■■□□□ 1.81
PHF21B-211ENST00000495348 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.37■■□□□ 1.81
PHF21B-211ENST00000495348 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.37■■□□□ 1.81
PHF21B-211ENST00000495348 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PHF21B-211ENST00000495348 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.3■■□□□ 1.8
PHF21B-211ENST00000495348 TOPBP1Q92547 1522 aa26.29■■□□□ 1.8
PHF21B-211ENST00000495348 ABCC8Q09428 1581 aa26.27■■□□□ 1.8
PHF21B-211ENST00000495348 ARHGEF11O15085 1522 aa26.25■■□□□ 1.79
PHF21B-211ENST00000495348 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
PHF21B-211ENST00000495348 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.17■■□□□ 1.78
PHF21B-211ENST00000495348 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.11■■□□□ 1.77
PHF21B-211ENST00000495348 CHD1O14646 1710 aa26.07■■□□□ 1.76
PHF21B-211ENST00000495348 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.06■■□□□ 1.76
PHF21B-211ENST00000495348 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PHF21B-211ENST00000495348 FBLN2P98095 1184 aa26.02■■□□□ 1.76
PHF21B-211ENST00000495348 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PHF21B-211ENST00000495348 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
PHF21B-211ENST00000495348 ARAP1Q96P48 1450 aa25.96■■□□□ 1.75
PHF21B-211ENST00000495348 SOGA1O94964 1423 aa25.88■■□□□ 1.73
PHF21B-211ENST00000495348 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.88■■□□□ 1.73
PHF21B-211ENST00000495348 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PHF21B-211ENST00000495348 WDR97A6NE52 1622 aa25.84■■□□□ 1.73
PHF21B-211ENST00000495348 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.8■■□□□ 1.72
PHF21B-211ENST00000495348 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PHF21B-211ENST00000495348 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.78■■□□□ 1.72
PHF21B-211ENST00000495348 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PHF21B-211ENST00000495348 SYNJ1O43426 1573 aa25.76■■□□□ 1.71
PHF21B-211ENST00000495348 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.75■■□□□ 1.71
PHF21B-211ENST00000495348 GRIN2BQ13224 1484 aa25.71■■□□□ 1.71
PHF21B-211ENST00000495348 CUX1P39880 1505 aa25.68■■□□□ 1.7
PHF21B-211ENST00000495348 SYNJ2O15056 1496 aa25.66■■□□□ 1.7
PHF21B-211ENST00000495348 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.57■■□□□ 1.68
PHF21B-211ENST00000495348 PBRM1Q86U86 1689 aa25.56■■□□□ 1.68
PHF21B-211ENST00000495348 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
PHF21B-211ENST00000495348 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.47■■□□□ 1.67
PHF21B-211ENST00000495348 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.45■■□□□ 1.67
PHF21B-211ENST00000495348 GRIN2AQ12879 1464 aa25.36■■□□□ 1.65
PHF21B-211ENST00000495348 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
PHF21B-211ENST00000495348 ADAMTS12P58397 1594 aa25.29■■□□□ 1.64
PHF21B-211ENST00000495348 NUP160Q12769 1436 aa25.29■■□□□ 1.64
PHF21B-211ENST00000495348 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.28■■□□□ 1.64
PHF21B-211ENST00000495348 CEP170Q5SW79 1584 aa25.27■■□□□ 1.64
PHF21B-211ENST00000495348 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.24■■□□□ 1.63
PHF21B-211ENST00000495348 SHROOM2Q13796 1616 aa25.21■■□□□ 1.63
PHF21B-211ENST00000495348 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PHF21B-211ENST00000495348 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.19■■□□□ 1.62
PHF21B-211ENST00000495348 TOP2BQ02880 1626 aa25.19■■□□□ 1.62
PHF21B-211ENST00000495348 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.17■■□□□ 1.62
PHF21B-211ENST00000495348 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
PHF21B-211ENST00000495348 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.06■■□□□ 1.6
PHF21B-211ENST00000495348 JPH4Q96JJ6 628 aa25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms