RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495341.5

LMNA-215, Transcript of lamin A/C, humanhuman

TSL 5

Gene LMNA, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNA-215ENST00000495341 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.03■■■■■ 4.16
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LMNA-215ENST00000495341 ABCC9O60706 1549 aa36.54■■■■□ 3.44
LMNA-215ENST00000495341 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.86■■■■□ 3.17
LMNA-215ENST00000495341 NACADO15069 1562 aa34.65■■■■□ 3.14
LMNA-215ENST00000495341 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.61■■■■□ 3.13
LMNA-215ENST00000495341 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.22■■■■□ 3.07
LMNA-215ENST00000495341 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
LMNA-215ENST00000495341 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.06■■■■□ 3.04
LMNA-215ENST00000495341 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34■■■■□ 3.03
LMNA-215ENST00000495341 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.99■■■■□ 3.03
LMNA-215ENST00000495341 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.88■■■■□ 3.01
LMNA-215ENST00000495341 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.79■■■■□ 3
LMNA-215ENST00000495341 SCRIBQ14160 1630 aa33.52■■■□□ 2.96
LMNA-215ENST00000495341 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.38■■■□□ 2.93
LMNA-215ENST00000495341 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.98■■■□□ 2.87
LMNA-215ENST00000495341 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.97■■■□□ 2.87
LMNA-215ENST00000495341 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.88■■■□□ 2.85
LMNA-215ENST00000495341 NCAPD3P42695 1498 aa31.97■■■□□ 2.71
LMNA-215ENST00000495341 SMARCA4P51532 1647 aa31.96■■■□□ 2.71
LMNA-215ENST00000495341 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.93■■■□□ 2.7
LMNA-215ENST00000495341 SMARCA2P51531 1590 aa31.87■■■□□ 2.69
LMNA-215ENST00000495341 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
LMNA-215ENST00000495341 HMGXB3Q12766 1538 aa31.79■■■□□ 2.68
LMNA-215ENST00000495341 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
LMNA-215ENST00000495341 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.62■■■□□ 2.65
LMNA-215ENST00000495341 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.62■■■□□ 2.65
LMNA-215ENST00000495341 ERCC6Q03468 1493 aa31.57■■■□□ 2.64
LMNA-215ENST00000495341 NESP48681 1621 aa31.44■■■□□ 2.62
LMNA-215ENST00000495341 CUX2O14529 1486 aa31.38■■■□□ 2.61
LMNA-215ENST00000495341 WIZO95785 1651 aa31.25■■■□□ 2.59
LMNA-215ENST00000495341 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.24■■■□□ 2.59
LMNA-215ENST00000495341 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.08■■■□□ 2.57
LMNA-215ENST00000495341 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.07■■■□□ 2.56
LMNA-215ENST00000495341 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
LMNA-215ENST00000495341 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
LMNA-215ENST00000495341 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.05■■■□□ 2.56
LMNA-215ENST00000495341 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.01■■■□□ 2.55
LMNA-215ENST00000495341 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
LMNA-215ENST00000495341 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.8■■■□□ 2.52
LMNA-215ENST00000495341 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.74■■■□□ 2.51
LMNA-215ENST00000495341 CFTRP13569 1480 aa30.73■■■□□ 2.51
LMNA-215ENST00000495341 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.71■■■□□ 2.51
LMNA-215ENST00000495341 WDR62O43379 1518 aa30.69■■■□□ 2.5
LMNA-215ENST00000495341 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.52■■■□□ 2.48
LMNA-215ENST00000495341 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
LMNA-215ENST00000495341 PRDM2Q13029 1718 aa30.4■■■□□ 2.46
LMNA-215ENST00000495341 TOPBP1Q92547 1522 aa30.14■■■□□ 2.42
LMNA-215ENST00000495341 IFT140Q96RY7 1462 aa30.1■■■□□ 2.41
LMNA-215ENST00000495341 ABCC8Q09428 1581 aa30.08■■■□□ 2.41
LMNA-215ENST00000495341 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.05■■■□□ 2.4
LMNA-215ENST00000495341 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
LMNA-215ENST00000495341 OSCARQ8IYS5 282 aa29.98■■■□□ 2.39
LMNA-215ENST00000495341 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
LMNA-215ENST00000495341 TRIM41Q8WV44 630 aa29.9■■■□□ 2.38
LMNA-215ENST00000495341 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
LMNA-215ENST00000495341 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
LMNA-215ENST00000495341 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
LMNA-215ENST00000495341 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.78■■■□□ 2.36
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LMNA-215ENST00000495341 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.71■■■□□ 2.35
LMNA-215ENST00000495341 CUX1P39880 1505 aa29.71■■■□□ 2.35
LMNA-215ENST00000495341 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
LMNA-215ENST00000495341 FBLN2P98095 1184 aa29.6■■■□□ 2.33
LMNA-215ENST00000495341 CHD1O14646 1710 aa29.57■■■□□ 2.32
LMNA-215ENST00000495341 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.56■■■□□ 2.32
LMNA-215ENST00000495341 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.56■■■□□ 2.32
LMNA-215ENST00000495341 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.56■■■□□ 2.32
LMNA-215ENST00000495341 WDR97A6NE52 1622 aa29.55■■■□□ 2.32
LMNA-215ENST00000495341 ARHGEF11O15085 1522 aa29.51■■■□□ 2.32
LMNA-215ENST00000495341 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.51■■■□□ 2.31
LMNA-215ENST00000495341 GRIN2BQ13224 1484 aa29.45■■■□□ 2.31
LMNA-215ENST00000495341 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
LMNA-215ENST00000495341 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
LMNA-215ENST00000495341 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.37■■■□□ 2.29
LMNA-215ENST00000495341 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.36■■■□□ 2.29
LMNA-215ENST00000495341 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
LMNA-215ENST00000495341 PBRM1Q86U86 1689 aa29.32■■■□□ 2.28
LMNA-215ENST00000495341 SYNJ2O15056 1496 aa29.32■■■□□ 2.28
LMNA-215ENST00000495341 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.29■■■□□ 2.28
LMNA-215ENST00000495341 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.29■■■□□ 2.28
LMNA-215ENST00000495341 SYNJ1O43426 1573 aa29.29■■■□□ 2.28
LMNA-215ENST00000495341 TOP2BQ02880 1626 aa29.28■■■□□ 2.28
LMNA-215ENST00000495341 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.27■■■□□ 2.28
LMNA-215ENST00000495341 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.25■■■□□ 2.27
LMNA-215ENST00000495341 ARAP1Q96P48 1450 aa29.23■■■□□ 2.27
LMNA-215ENST00000495341 ADAMTS12P58397 1594 aa29.08■■■□□ 2.25
LMNA-215ENST00000495341 GRIN2AQ12879 1464 aa29.07■■■□□ 2.24
LMNA-215ENST00000495341 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.02■■■□□ 2.24
LMNA-215ENST00000495341 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29■■■□□ 2.23
LMNA-215ENST00000495341 CEP170Q5SW79 1584 aa28.94■■■□□ 2.22
LMNA-215ENST00000495341 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
LMNA-215ENST00000495341 NUP160Q12769 1436 aa28.94■■■□□ 2.22
LMNA-215ENST00000495341 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.82■■■□□ 2.2
LMNA-215ENST00000495341 SHROOM2Q13796 1616 aa28.76■■■□□ 2.19
LMNA-215ENST00000495341 KIF27Q86VH2 1401 aa28.75■■■□□ 2.19
LMNA-215ENST00000495341 IGF1RP08069 1367 aa28.68■■■□□ 2.18
LMNA-215ENST00000495341 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
LMNA-215ENST00000495341 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.66■■■□□ 2.18
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