RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495221.1

PDE1C-211, Transcript of phosphodiesterase 1C, humanhuman

TSL 4

Gene PDE1C, Length 540 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1C-211ENST00000495221 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.93■■■■■ 6.22
PDE1C-211ENST00000495221 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.41■■■■■ 5.34
PDE1C-211ENST00000495221 ABCC9O60706 1549 aa47.8■■■■■ 5.24
PDE1C-211ENST00000495221 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.81■■■■■ 4.92
PDE1C-211ENST00000495221 NACADO15069 1562 aa45.6■■■■■ 4.89
PDE1C-211ENST00000495221 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.14■■■■■ 4.82
PDE1C-211ENST00000495221 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.11■■■■■ 4.81
PDE1C-211ENST00000495221 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.87■■■■■ 4.77
PDE1C-211ENST00000495221 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.81■■■■■ 4.76
PDE1C-211ENST00000495221 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.67■■■■■ 4.74
PDE1C-211ENST00000495221 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.44■■■■■ 4.7
PDE1C-211ENST00000495221 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.43■■■■■ 4.7
PDE1C-211ENST00000495221 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.41■■■■■ 4.7
PDE1C-211ENST00000495221 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44■■■■■ 4.63
PDE1C-211ENST00000495221 SCRIBQ14160 1630 aa43.96■■■■■ 4.63
PDE1C-211ENST00000495221 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
PDE1C-211ENST00000495221 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.3■■■■■ 4.52
PDE1C-211ENST00000495221 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.06■■■■■ 4.48
PDE1C-211ENST00000495221 SMARCA4P51532 1647 aa42.05■■■■■ 4.32
PDE1C-211ENST00000495221 NCAPD3P42695 1498 aa42.02■■■■■ 4.32
PDE1C-211ENST00000495221 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.92■■■■■ 4.3
PDE1C-211ENST00000495221 SMARCA2P51531 1590 aa41.91■■■■■ 4.3
PDE1C-211ENST00000495221 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
PDE1C-211ENST00000495221 HMGXB3Q12766 1538 aa41.83■■■■■ 4.29
PDE1C-211ENST00000495221 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.68■■■■■ 4.26
PDE1C-211ENST00000495221 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
PDE1C-211ENST00000495221 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.51■■■■■ 4.24
PDE1C-211ENST00000495221 ERCC6Q03468 1493 aa41.28■■■■■ 4.2
PDE1C-211ENST00000495221 CUX2O14529 1486 aa41.18■■■■■ 4.18
PDE1C-211ENST00000495221 NESP48681 1621 aa41.16■■■■■ 4.18
PDE1C-211ENST00000495221 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.1■■■■■ 4.17
PDE1C-211ENST00000495221 WIZO95785 1651 aa41.08■■■■■ 4.17
PDE1C-211ENST00000495221 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.9■■■■■ 4.14
PDE1C-211ENST00000495221 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.13
PDE1C-211ENST00000495221 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.8■■■■■ 4.12
PDE1C-211ENST00000495221 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
PDE1C-211ENST00000495221 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.76■■■■■ 4.11
PDE1C-211ENST00000495221 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.72■■■■■ 4.11
PDE1C-211ENST00000495221 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
PDE1C-211ENST00000495221 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.4■■■■■ 4.06
PDE1C-211ENST00000495221 CFTRP13569 1480 aa40.38■■■■■ 4.05
PDE1C-211ENST00000495221 WDR62O43379 1518 aa40.34■■■■■ 4.05
PDE1C-211ENST00000495221 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.32■■■■■ 4.04
PDE1C-211ENST00000495221 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.27■■■■■ 4.04
PDE1C-211ENST00000495221 PRDM2Q13029 1718 aa40.22■■■■■ 4.03
PDE1C-211ENST00000495221 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.07■■■■■ 4
PDE1C-211ENST00000495221 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
PDE1C-211ENST00000495221 TOPBP1Q92547 1522 aa39.57■■■■□ 3.93
PDE1C-211ENST00000495221 ABCC8Q09428 1581 aa39.57■■■■□ 3.92
PDE1C-211ENST00000495221 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.51■■■■□ 3.92
PDE1C-211ENST00000495221 IFT140Q96RY7 1462 aa39.49■■■■□ 3.91
PDE1C-211ENST00000495221 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
PDE1C-211ENST00000495221 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
PDE1C-211ENST00000495221 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.24■■■■□ 3.87
PDE1C-211ENST00000495221 OSCARQ8IYS5 282 aa39.22■■■■□ 3.87
PDE1C-211ENST00000495221 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.18■■■■□ 3.86
PDE1C-211ENST00000495221 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.85
PDE1C-211ENST00000495221 TRIM41Q8WV44 630 aa39.01■■■■□ 3.84
PDE1C-211ENST00000495221 CUX1P39880 1505 aa39■■■■□ 3.83
PDE1C-211ENST00000495221 WDR97A6NE52 1622 aa38.99■■■■□ 3.83
PDE1C-211ENST00000495221 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.98■■■■□ 3.83
PDE1C-211ENST00000495221 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.98■■■■□ 3.83
PDE1C-211ENST00000495221 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.96■■■■□ 3.83
PDE1C-211ENST00000495221 SOGA1O94964 1423 aa38.96■■■■□ 3.83
PDE1C-211ENST00000495221 CHD1O14646 1710 aa38.92■■■■□ 3.82
PDE1C-211ENST00000495221 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.79■■■■□ 3.8
PDE1C-211ENST00000495221 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.79■■■■□ 3.8
PDE1C-211ENST00000495221 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.79■■■■□ 3.8
PDE1C-211ENST00000495221 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
PDE1C-211ENST00000495221 ARHGEF11O15085 1522 aa38.68■■■■□ 3.78
PDE1C-211ENST00000495221 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.66■■■■□ 3.78
PDE1C-211ENST00000495221 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.65■■■■□ 3.78
PDE1C-211ENST00000495221 GRIN2BQ13224 1484 aa38.64■■■■□ 3.78
PDE1C-211ENST00000495221 PBRM1Q86U86 1689 aa38.63■■■■□ 3.77
PDE1C-211ENST00000495221 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.6■■■■□ 3.77
PDE1C-211ENST00000495221 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.59■■■■□ 3.77
PDE1C-211ENST00000495221 FBLN2P98095 1184 aa38.58■■■■□ 3.77
PDE1C-211ENST00000495221 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.56■■■■□ 3.76
PDE1C-211ENST00000495221 TOP2BQ02880 1626 aa38.55■■■■□ 3.76
PDE1C-211ENST00000495221 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.54■■■■□ 3.76
PDE1C-211ENST00000495221 SYNJ2O15056 1496 aa38.48■■■■□ 3.75
PDE1C-211ENST00000495221 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.47■■■■□ 3.75
PDE1C-211ENST00000495221 SYNJ1O43426 1573 aa38.47■■■■□ 3.75
PDE1C-211ENST00000495221 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.44■■■■□ 3.74
PDE1C-211ENST00000495221 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.42■■■■□ 3.74
PDE1C-211ENST00000495221 ARAP1Q96P48 1450 aa38.3■■■■□ 3.72
PDE1C-211ENST00000495221 ADAMTS12P58397 1594 aa38.23■■■■□ 3.71
PDE1C-211ENST00000495221 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.22■■■■□ 3.71
PDE1C-211ENST00000495221 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.16■■■■□ 3.7
PDE1C-211ENST00000495221 GRIN2AQ12879 1464 aa38.15■■■■□ 3.7
PDE1C-211ENST00000495221 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.07■■■■□ 3.69
PDE1C-211ENST00000495221 NUP160Q12769 1436 aa38.02■■■■□ 3.68
PDE1C-211ENST00000495221 CEP170Q5SW79 1584 aa38■■■■□ 3.67
PDE1C-211ENST00000495221 SHROOM2Q13796 1616 aa37.88■■■■□ 3.65
PDE1C-211ENST00000495221 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.78■■■■□ 3.64
PDE1C-211ENST00000495221 KIF27Q86VH2 1401 aa37.73■■■■□ 3.63
PDE1C-211ENST00000495221 CUL7Q14999 1698 aa37.72■■■■□ 3.63
PDE1C-211ENST00000495221 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.69■■■■□ 3.62
PDE1C-211ENST00000495221 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.67■■■■□ 3.62
PDE1C-211ENST00000495221 IGF1RP08069 1367 aa37.61■■■■□ 3.61
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