RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495174.5

SH3BP1-208, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 947 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-208ENST00000495174 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.54■■■□□ 2.96
SH3BP1-208ENST00000495174 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP1-208ENST00000495174 ABCC9O60706 1549 aa29.2■■■□□ 2.27
SH3BP1-208ENST00000495174 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.19■■■□□ 2.1
SH3BP1-208ENST00000495174 NACADO15069 1562 aa28.16■■■□□ 2.1
SH3BP1-208ENST00000495174 MYO15BQ96JP2 1530 aa28■■■□□ 2.07
SH3BP1-208ENST00000495174 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.93■■■□□ 2.06
SH3BP1-208ENST00000495174 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
SH3BP1-208ENST00000495174 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.82■■■□□ 2.04
SH3BP1-208ENST00000495174 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.58■■■□□ 2.01
SH3BP1-208ENST00000495174 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.3■■□□□ 1.96
SH3BP1-208ENST00000495174 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.23■■□□□ 1.95
SH3BP1-208ENST00000495174 SCRIBQ14160 1630 aa27.19■■□□□ 1.94
SH3BP1-208ENST00000495174 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.1■■□□□ 1.93
SH3BP1-208ENST00000495174 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.83■■□□□ 1.89
SH3BP1-208ENST00000495174 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
SH3BP1-208ENST00000495174 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.49■■□□□ 1.83
SH3BP1-208ENST00000495174 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.3■■□□□ 1.8
SH3BP1-208ENST00000495174 SMARCA4P51532 1647 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BP1-208ENST00000495174 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
SH3BP1-208ENST00000495174 NCAPD3P42695 1498 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP1-208ENST00000495174 SMARCA2P51531 1590 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP1-208ENST00000495174 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP1-208ENST00000495174 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP1-208ENST00000495174 HMGXB3Q12766 1538 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP1-208ENST00000495174 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.81■■□□□ 1.72
SH3BP1-208ENST00000495174 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
SH3BP1-208ENST00000495174 WIZO95785 1651 aa25.56■■□□□ 1.68
SH3BP1-208ENST00000495174 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
SH3BP1-208ENST00000495174 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP1-208ENST00000495174 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SH3BP1-208ENST00000495174 NESP48681 1621 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP1-208ENST00000495174 ERCC6Q03468 1493 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP1-208ENST00000495174 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP1-208ENST00000495174 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.1■■□□□ 1.61
SH3BP1-208ENST00000495174 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP1-208ENST00000495174 CUX2O14529 1486 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP1-208ENST00000495174 CFTRP13569 1480 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP1-208ENST00000495174 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SH3BP1-208ENST00000495174 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP1-208ENST00000495174 PRDM2Q13029 1718 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP1-208ENST00000495174 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP1-208ENST00000495174 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP1-208ENST00000495174 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.83■■□□□ 1.56
SH3BP1-208ENST00000495174 WDR62O43379 1518 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP1-208ENST00000495174 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
SH3BP1-208ENST00000495174 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SH3BP1-208ENST00000495174 ABCC8Q09428 1581 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BP1-208ENST00000495174 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.46■■□□□ 1.51
SH3BP1-208ENST00000495174 TOPBP1Q92547 1522 aa24.45■■□□□ 1.51
SH3BP1-208ENST00000495174 IFT140Q96RY7 1462 aa24.33■■□□□ 1.49
SH3BP1-208ENST00000495174 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.3■■□□□ 1.48
SH3BP1-208ENST00000495174 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SH3BP1-208ENST00000495174 CUX1P39880 1505 aa24.23■■□□□ 1.47
SH3BP1-208ENST00000495174 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP1-208ENST00000495174 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SH3BP1-208ENST00000495174 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP1-208ENST00000495174 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
SH3BP1-208ENST00000495174 SOGA1O94964 1423 aa24.13■■□□□ 1.45
SH3BP1-208ENST00000495174 WDR97A6NE52 1622 aa24.12■■□□□ 1.45
SH3BP1-208ENST00000495174 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP1-208ENST00000495174 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP1-208ENST00000495174 TOP2BQ02880 1626 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP1-208ENST00000495174 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP1-208ENST00000495174 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.446e-6■■■■□ 23.2
SH3BP1-208ENST00000495174 SYNJ1O43426 1573 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP1-208ENST00000495174 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.95■■□□□ 1.43
SH3BP1-208ENST00000495174 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
SH3BP1-208ENST00000495174 OSCARQ8IYS5 282 aa23.95■■□□□ 1.42
SH3BP1-208ENST00000495174 PBRM1Q86U86 1689 aa23.89■■□□□ 1.41
SH3BP1-208ENST00000495174 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.88■■□□□ 1.41
SH3BP1-208ENST00000495174 GRIN2BQ13224 1484 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP1-208ENST00000495174 CHD1O14646 1710 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP1-208ENST00000495174 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.87■■□□□ 1.41
SH3BP1-208ENST00000495174 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
SH3BP1-208ENST00000495174 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.82■■□□□ 1.4
SH3BP1-208ENST00000495174 SYNJ2O15056 1496 aa23.74■■□□□ 1.39
SH3BP1-208ENST00000495174 FBLN2P98095 1184 aa23.72■■□□□ 1.39
SH3BP1-208ENST00000495174 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.69■■□□□ 1.38
SH3BP1-208ENST00000495174 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SH3BP1-208ENST00000495174 ADAMTS12P58397 1594 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP1-208ENST00000495174 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1-208ENST00000495174 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1-208ENST00000495174 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1-208ENST00000495174 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1-208ENST00000495174 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP1-208ENST00000495174 KIF27Q86VH2 1401 aa23.58■■□□□ 1.36
SH3BP1-208ENST00000495174 GRIN2AQ12879 1464 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP1-208ENST00000495174 ARHGEF11O15085 1522 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP1-208ENST00000495174 CUL7Q14999 1698 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP1-208ENST00000495174 NUP160Q12769 1436 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP1-208ENST00000495174 IGF1RP08069 1367 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP1-208ENST00000495174 CEP170Q5SW79 1584 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP1-208ENST00000495174 TRIM41Q8WV44 630 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP1-208ENST00000495174 SHROOM2Q13796 1616 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP1-208ENST00000495174 ARAP1Q96P48 1450 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP1-208ENST00000495174 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP1-208ENST00000495174 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP1-208ENST00000495174 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.29■■□□□ 1.32
SH3BP1-208ENST00000495174 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.24■■□□□ 1.31
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