RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494993.1

HDDC3-203, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene HDDC3, Length 1,220 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-203ENST00000494993 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.47■■■■■ 6.47
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HDDC3-203ENST00000494993 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.38■■■■■ 5.18
HDDC3-203ENST00000494993 NACADO15069 1562 aa47.06■■■■■ 5.12
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HDDC3-203ENST00000494993 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.43■■■■■ 5.02
HDDC3-203ENST00000494993 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.43■■■■■ 5.02
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HDDC3-203ENST00000494993 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.39■■■■■ 4.86
HDDC3-203ENST00000494993 SCRIBQ14160 1630 aa45.37■■■■■ 4.85
HDDC3-203ENST00000494993 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.95■■■■■ 4.79
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HDDC3-203ENST00000494993 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.76■■■■■ 4.76
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HDDC3-203ENST00000494993 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.27■■■■■ 4.52
HDDC3-203ENST00000494993 SMARCA2P51531 1590 aa43.2■■■■■ 4.51
HDDC3-203ENST00000494993 HMGXB3Q12766 1538 aa43.13■■■■■ 4.5
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HDDC3-203ENST00000494993 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.88■■■■■ 4.45
HDDC3-203ENST00000494993 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
HDDC3-203ENST00000494993 CUX2O14529 1486 aa42.84■■■■■ 4.45
HDDC3-203ENST00000494993 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.73■■■■■ 4.43
HDDC3-203ENST00000494993 NESP48681 1621 aa42.71■■■■■ 4.43
HDDC3-203ENST00000494993 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.7■■■■■ 4.43
HDDC3-203ENST00000494993 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.47■■■■■ 4.39
HDDC3-203ENST00000494993 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
HDDC3-203ENST00000494993 WIZO95785 1651 aa42.28■■■■■ 4.36
HDDC3-203ENST00000494993 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.27■■■■■ 4.36
HDDC3-203ENST00000494993 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.16■■■■■ 4.34
HDDC3-203ENST00000494993 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.06■■■■■ 4.32
HDDC3-203ENST00000494993 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.84■■■■■ 4.29
HDDC3-203ENST00000494993 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.82■■■■■ 4.29
HDDC3-203ENST00000494993 WDR62O43379 1518 aa41.74■■■■■ 4.27
HDDC3-203ENST00000494993 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.73■■■■■ 4.27
HDDC3-203ENST00000494993 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.66■■■■■ 4.26
HDDC3-203ENST00000494993 CFTRP13569 1480 aa41.61■■■■■ 4.25
HDDC3-203ENST00000494993 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.61■■■■■ 4.25
HDDC3-203ENST00000494993 PRDM2Q13029 1718 aa41.38■■■■■ 4.22
HDDC3-203ENST00000494993 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
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HDDC3-203ENST00000494993 TOPBP1Q92547 1522 aa40.85■■■■■ 4.13
HDDC3-203ENST00000494993 IFT140Q96RY7 1462 aa40.83■■■■■ 4.13
HDDC3-203ENST00000494993 OSCARQ8IYS5 282 aa40.82■■■■■ 4.13
HDDC3-203ENST00000494993 TRIM41Q8WV44 630 aa40.82■■■■■ 4.13
HDDC3-203ENST00000494993 ABCC8Q09428 1581 aa40.76■■■■■ 4.12
HDDC3-203ENST00000494993 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
HDDC3-203ENST00000494993 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.73■■■■■ 4.11
HDDC3-203ENST00000494993 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
HDDC3-203ENST00000494993 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
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HDDC3-203ENST00000494993 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.4■■■■■ 4.06
HDDC3-203ENST00000494993 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.4■■■■■ 4.06
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HDDC3-203ENST00000494993 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.26■■■■■ 4.03
HDDC3-203ENST00000494993 ARHGEF11O15085 1522 aa40.24■■■■■ 4.03
HDDC3-203ENST00000494993 SOGA1O94964 1423 aa40.21■■■■■ 4.03
HDDC3-203ENST00000494993 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.18■■■■■ 4.02
HDDC3-203ENST00000494993 CUX1P39880 1505 aa40.16■■■■■ 4.02
HDDC3-203ENST00000494993 WDR97A6NE52 1622 aa40.13■■■■■ 4.02
HDDC3-203ENST00000494993 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
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HDDC3-203ENST00000494993 GRIN2BQ13224 1484 aa39.88■■■■□ 3.98
HDDC3-203ENST00000494993 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.85■■■■□ 3.97
HDDC3-203ENST00000494993 PBRM1Q86U86 1689 aa39.84■■■■□ 3.97
HDDC3-203ENST00000494993 ARAP1Q96P48 1450 aa39.84■■■■□ 3.97
HDDC3-203ENST00000494993 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.81■■■■□ 3.96
HDDC3-203ENST00000494993 SYNJ1O43426 1573 aa39.79■■■■□ 3.96
HDDC3-203ENST00000494993 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.77■■■■□ 3.96
HDDC3-203ENST00000494993 SYNJ2O15056 1496 aa39.75■■■■□ 3.95
HDDC3-203ENST00000494993 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.74■■■■□ 3.95
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HDDC3-203ENST00000494993 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.72■■■■□ 3.95
HDDC3-203ENST00000494993 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.6■■■■□ 3.93
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HDDC3-203ENST00000494993 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.55■■■■□ 3.92
HDDC3-203ENST00000494993 ADAMTS12P58397 1594 aa39.41■■■■□ 3.9
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HDDC3-203ENST00000494993 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.23■■■■□ 3.87
HDDC3-203ENST00000494993 NUP160Q12769 1436 aa39.23■■■■□ 3.87
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HDDC3-203ENST00000494993 SHROOM2Q13796 1616 aa39.13■■■■□ 3.85
HDDC3-203ENST00000494993 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.85■■■■□ 3.81
HDDC3-203ENST00000494993 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.83■■■■□ 3.81
HDDC3-203ENST00000494993 JPH4Q96JJ6 628 aa38.78■■■■□ 3.8
HDDC3-203ENST00000494993 CUL7Q14999 1698 aa38.74■■■■□ 3.79
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