RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494971.2

USP20-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 3

Gene USP20, Length 503 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-208ENST00000494971 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.98■■■■■ 4.31
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USP20-208ENST00000494971 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.3■■■■□ 3.24
USP20-208ENST00000494971 NACADO15069 1562 aa35.24■■■■□ 3.23
USP20-208ENST00000494971 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.03■■■■□ 3.2
USP20-208ENST00000494971 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.01■■■■□ 3.19
USP20-208ENST00000494971 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
USP20-208ENST00000494971 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.76■■■■□ 3.16
USP20-208ENST00000494971 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.51■■■■□ 3.12
USP20-208ENST00000494971 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.3■■■■□ 3.08
USP20-208ENST00000494971 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.28■■■■□ 3.08
USP20-208ENST00000494971 SCRIBQ14160 1630 aa34.08■■■■□ 3.05
USP20-208ENST00000494971 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.97■■■■□ 3.03
USP20-208ENST00000494971 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.93■■■■□ 3.02
USP20-208ENST00000494971 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
USP20-208ENST00000494971 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.28■■■□□ 2.92
USP20-208ENST00000494971 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.08■■■□□ 2.89
USP20-208ENST00000494971 SMARCA4P51532 1647 aa32.61■■■□□ 2.81
USP20-208ENST00000494971 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
USP20-208ENST00000494971 NCAPD3P42695 1498 aa32.53■■■□□ 2.8
USP20-208ENST00000494971 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.5■■■□□ 2.79
USP20-208ENST00000494971 SMARCA2P51531 1590 aa32.45■■■□□ 2.78
USP20-208ENST00000494971 HMGXB3Q12766 1538 aa32.35■■■□□ 2.77
USP20-208ENST00000494971 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.34■■■□□ 2.77
USP20-208ENST00000494971 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.32■■■□□ 2.77
USP20-208ENST00000494971 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
USP20-208ENST00000494971 WIZO95785 1651 aa31.95■■■□□ 2.71
USP20-208ENST00000494971 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
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USP20-208ENST00000494971 ERCC6Q03468 1493 aa31.7■■■□□ 2.66
USP20-208ENST00000494971 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.68■■■□□ 2.66
USP20-208ENST00000494971 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
USP20-208ENST00000494971 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.55■■■□□ 2.64
USP20-208ENST00000494971 CUX2O14529 1486 aa31.5■■■□□ 2.63
USP20-208ENST00000494971 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.47■■■□□ 2.63
USP20-208ENST00000494971 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.39■■■□□ 2.62
USP20-208ENST00000494971 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
USP20-208ENST00000494971 CFTRP13569 1480 aa31.33■■■□□ 2.61
USP20-208ENST00000494971 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.25■■■□□ 2.59
USP20-208ENST00000494971 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.16■■■□□ 2.58
USP20-208ENST00000494971 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.16■■■□□ 2.58
USP20-208ENST00000494971 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.14■■■□□ 2.58
USP20-208ENST00000494971 WDR62O43379 1518 aa31.08■■■□□ 2.57
USP20-208ENST00000494971 PRDM2Q13029 1718 aa31.06■■■□□ 2.56
USP20-208ENST00000494971 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
USP20-208ENST00000494971 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
USP20-208ENST00000494971 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.78■■■□□ 2.52
USP20-208ENST00000494971 TOPBP1Q92547 1522 aa30.65■■■□□ 2.5
USP20-208ENST00000494971 ABCC8Q09428 1581 aa30.65■■■□□ 2.5
USP20-208ENST00000494971 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.61■■■□□ 2.49
USP20-208ENST00000494971 IFT140Q96RY7 1462 aa30.52■■■□□ 2.48
USP20-208ENST00000494971 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
USP20-208ENST00000494971 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
USP20-208ENST00000494971 CUX1P39880 1505 aa30.35■■■□□ 2.45
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USP20-208ENST00000494971 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.26■■■□□ 2.44
USP20-208ENST00000494971 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
USP20-208ENST00000494971 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.24■■■□□ 2.43
USP20-208ENST00000494971 SOGA1O94964 1423 aa30.23■■■□□ 2.43
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USP20-208ENST00000494971 OSCARQ8IYS5 282 aa30.12■■■□□ 2.41
USP20-208ENST00000494971 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
USP20-208ENST00000494971 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.06■■■□□ 2.4
USP20-208ENST00000494971 TOP2BQ02880 1626 aa30.04■■■□□ 2.4
USP20-208ENST00000494971 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.04■■■□□ 2.4
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USP20-208ENST00000494971 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.99■■■□□ 2.39
USP20-208ENST00000494971 GRIN2BQ13224 1484 aa29.93■■■□□ 2.38
USP20-208ENST00000494971 CHD1O14646 1710 aa29.91■■■□□ 2.38
USP20-208ENST00000494971 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.9■■■□□ 2.38
USP20-208ENST00000494971 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.89■■■□□ 2.38
USP20-208ENST00000494971 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.89■■■□□ 2.37
USP20-208ENST00000494971 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
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USP20-208ENST00000494971 FBLN2P98095 1184 aa29.8■■■□□ 2.36
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USP20-208ENST00000494971 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.67■■■□□ 2.34
USP20-208ENST00000494971 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.67■■■□□ 2.34
USP20-208ENST00000494971 ARHGEF11O15085 1522 aa29.65■■■□□ 2.34
USP20-208ENST00000494971 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.63■■■□□ 2.33
USP20-208ENST00000494971 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.62■■■□□ 2.33
USP20-208ENST00000494971 ADAMTS12P58397 1594 aa29.6■■■□□ 2.33
USP20-208ENST00000494971 TRIM41Q8WV44 630 aa29.59■■■□□ 2.33
USP20-208ENST00000494971 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.54■■■□□ 2.32
USP20-208ENST00000494971 GRIN2AQ12879 1464 aa29.54■■■□□ 2.32
USP20-208ENST00000494971 NUP160Q12769 1436 aa29.45■■■□□ 2.3
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USP20-208ENST00000494971 CEP170Q5SW79 1584 aa29.39■■■□□ 2.3
USP20-208ENST00000494971 IGF1RP08069 1367 aa29.38■■■□□ 2.29
USP20-208ENST00000494971 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.34■■■□□ 2.29
USP20-208ENST00000494971 CUL7Q14999 1698 aa29.3■■■□□ 2.28
USP20-208ENST00000494971 SHROOM2Q13796 1616 aa29.24■■■□□ 2.27
USP20-208ENST00000494971 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.18■■■□□ 2.26
USP20-208ENST00000494971 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.18■■■□□ 2.26
USP20-208ENST00000494971 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.17■■■□□ 2.26
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