RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494800.1

HDAC4-211, Transcript of histone deacetylase 4, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC4, Length 451 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4-211ENST00000494800 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.99■■■■■ 4.47
HDAC4-211ENST00000494800 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.31■■■■□ 3.72
HDAC4-211ENST00000494800 ABCC9O60706 1549 aa37.69■■■■□ 3.62
HDAC4-211ENST00000494800 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.21■■■■□ 3.39
HDAC4-211ENST00000494800 NACADO15069 1562 aa36.1■■■■□ 3.37
HDAC4-211ENST00000494800 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.1■■■■□ 3.37
HDAC4-211ENST00000494800 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.82■■■■□ 3.32
HDAC4-211ENST00000494800 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
HDAC4-211ENST00000494800 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.57■■■■□ 3.29
HDAC4-211ENST00000494800 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.23■■■■□ 3.23
HDAC4-211ENST00000494800 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.19■■■■□ 3.22
HDAC4-211ENST00000494800 BICRAQ9NZM4 1560 aa35■■■■□ 3.19
HDAC4-211ENST00000494800 SCRIBQ14160 1630 aa34.93■■■■□ 3.18
HDAC4-211ENST00000494800 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.77■■■■□ 3.16
HDAC4-211ENST00000494800 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.69■■■■□ 3.14
HDAC4-211ENST00000494800 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
HDAC4-211ENST00000494800 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.06■■■■□ 3.04
HDAC4-211ENST00000494800 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.92■■■■□ 3.02
HDAC4-211ENST00000494800 SMARCA4P51532 1647 aa33.39■■■□□ 2.94
HDAC4-211ENST00000494800 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
HDAC4-211ENST00000494800 NCAPD3P42695 1498 aa33.31■■■□□ 2.92
HDAC4-211ENST00000494800 SMARCA2P51531 1590 aa33.27■■■□□ 2.92
HDAC4-211ENST00000494800 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.27■■■□□ 2.92
HDAC4-211ENST00000494800 HMGXB3Q12766 1538 aa33.12■■■□□ 2.89
HDAC4-211ENST00000494800 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.09■■■□□ 2.89
HDAC4-211ENST00000494800 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.07■■■□□ 2.88
HDAC4-211ENST00000494800 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
HDAC4-211ENST00000494800 WIZO95785 1651 aa32.72■■■□□ 2.83
HDAC4-211ENST00000494800 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
HDAC4-211ENST00000494800 ERCC6Q03468 1493 aa32.59■■■□□ 2.81
HDAC4-211ENST00000494800 NESP48681 1621 aa32.51■■■□□ 2.79
HDAC4-211ENST00000494800 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.47■■■□□ 2.79
HDAC4-211ENST00000494800 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
HDAC4-211ENST00000494800 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.34■■■□□ 2.77
HDAC4-211ENST00000494800 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.32■■■□□ 2.76
HDAC4-211ENST00000494800 CUX2O14529 1486 aa32.29■■■□□ 2.76
HDAC4-211ENST00000494800 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.11■■■□□ 2.73
HDAC4-211ENST00000494800 CFTRP13569 1480 aa32.09■■■□□ 2.73
HDAC4-211ENST00000494800 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
HDAC4-211ENST00000494800 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.02■■■□□ 2.72
HDAC4-211ENST00000494800 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.97■■■□□ 2.71
HDAC4-211ENST00000494800 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.97■■■□□ 2.71
HDAC4-211ENST00000494800 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.95■■■□□ 2.7
HDAC4-211ENST00000494800 WDR62O43379 1518 aa31.82■■■□□ 2.68
HDAC4-211ENST00000494800 PRDM2Q13029 1718 aa31.77■■■□□ 2.68
HDAC4-211ENST00000494800 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
HDAC4-211ENST00000494800 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
HDAC4-211ENST00000494800 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.5■■■□□ 2.63
HDAC4-211ENST00000494800 ABCC8Q09428 1581 aa31.47■■■□□ 2.63
HDAC4-211ENST00000494800 TOPBP1Q92547 1522 aa31.4■■■□□ 2.62
HDAC4-211ENST00000494800 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.37■■■□□ 2.61
HDAC4-211ENST00000494800 IFT140Q96RY7 1462 aa31.31■■■□□ 2.6
HDAC4-211ENST00000494800 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
HDAC4-211ENST00000494800 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
HDAC4-211ENST00000494800 CUX1P39880 1505 aa31.07■■■□□ 2.56
HDAC4-211ENST00000494800 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
HDAC4-211ENST00000494800 SOGA1O94964 1423 aa31.04■■■□□ 2.56
HDAC4-211ENST00000494800 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.03■■■□□ 2.56
HDAC4-211ENST00000494800 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
HDAC4-211ENST00000494800 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.97■■■□□ 2.55
HDAC4-211ENST00000494800 OSCARQ8IYS5 282 aa30.94■■■□□ 2.54
HDAC4-211ENST00000494800 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.94■■■□□ 2.54
HDAC4-211ENST00000494800 WDR97A6NE52 1622 aa30.87■■■□□ 2.53
HDAC4-211ENST00000494800 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
HDAC4-211ENST00000494800 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.86■■■□□ 2.53
HDAC4-211ENST00000494800 TOP2BQ02880 1626 aa30.77■■■□□ 2.52
HDAC4-211ENST00000494800 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.75■■■□□ 2.51
HDAC4-211ENST00000494800 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.73■■■□□ 2.51
HDAC4-211ENST00000494800 SYNJ1O43426 1573 aa30.71■■■□□ 2.51
HDAC4-211ENST00000494800 GRIN2BQ13224 1484 aa30.7■■■□□ 2.51
HDAC4-211ENST00000494800 FBLN2P98095 1184 aa30.69■■■□□ 2.5
HDAC4-211ENST00000494800 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.67■■■□□ 2.5
HDAC4-211ENST00000494800 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.66■■■□□ 2.5
HDAC4-211ENST00000494800 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
HDAC4-211ENST00000494800 CHD1O14646 1710 aa30.61■■■□□ 2.49
HDAC4-211ENST00000494800 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.58■■■□□ 2.49
HDAC4-211ENST00000494800 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
HDAC4-211ENST00000494800 PBRM1Q86U86 1689 aa30.55■■■□□ 2.48
HDAC4-211ENST00000494800 SYNJ2O15056 1496 aa30.52■■■□□ 2.48
HDAC4-211ENST00000494800 TRIM41Q8WV44 630 aa30.42■■■□□ 2.46
HDAC4-211ENST00000494800 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.37■■■□□ 2.45
HDAC4-211ENST00000494800 ARHGEF11O15085 1522 aa30.37■■■□□ 2.45
HDAC4-211ENST00000494800 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.36■■■□□ 2.45
HDAC4-211ENST00000494800 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.36■■■□□ 2.45
HDAC4-211ENST00000494800 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.36■■■□□ 2.45
HDAC4-211ENST00000494800 ADAMTS12P58397 1594 aa30.32■■■□□ 2.45
HDAC4-211ENST00000494800 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.32■■■□□ 2.44
HDAC4-211ENST00000494800 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.3■■■□□ 2.44
HDAC4-211ENST00000494800 GRIN2AQ12879 1464 aa30.29■■■□□ 2.44
HDAC4-211ENST00000494800 KIF27Q86VH2 1401 aa30.26■■■□□ 2.43
HDAC4-211ENST00000494800 NUP160Q12769 1436 aa30.14■■■□□ 2.42
HDAC4-211ENST00000494800 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.14■■■□□ 2.42
HDAC4-211ENST00000494800 IGF1RP08069 1367 aa30.1■■■□□ 2.41
HDAC4-211ENST00000494800 CEP170Q5SW79 1584 aa30.1■■■□□ 2.41
HDAC4-211ENST00000494800 ARAP1Q96P48 1450 aa30.09■■■□□ 2.41
HDAC4-211ENST00000494800 CUL7Q14999 1698 aa30.06■■■□□ 2.4
HDAC4-211ENST00000494800 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.95■■■□□ 2.39
HDAC4-211ENST00000494800 SHROOM2Q13796 1616 aa29.91■■■□□ 2.38
HDAC4-211ENST00000494800 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.88■■■□□ 2.37
HDAC4-211ENST00000494800 JPH4Q96JJ6 628 aa29.87■■■□□ 2.37
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