RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494607.5

PQLC1-208, Transcript of PQ loop repeat containing 1, human

TSL 3

Gene PQLC1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PQLC1-208	ENST00000494607	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		38.84	■■■■□ 3.81
PQLC1-208	ENST00000494607	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		34.54	■■■■□ 3.12
PQLC1-208	ENST00000494607	ABCC9	O60706	1549 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PQLC1-208	ENST00000494607	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		32.44	■■■□□ 2.78
PQLC1-208	ENST00000494607	NACAD	O15069	1562 aa		32.43	■■■□□ 2.78
PQLC1-208	ENST00000494607	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
PQLC1-208	ENST00000494607	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.35	■■■□□ 2.77
PQLC1-208	ENST00000494607	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.3	■■■□□ 2.76
PQLC1-208	ENST00000494607	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.2	■■■□□ 2.74
PQLC1-208	ENST00000494607	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PQLC1-208	ENST00000494607	SCRIB	Q14160	1630 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PQLC1-208	ENST00000494607	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		31.39	■■■□□ 2.61
PQLC1-208	ENST00000494607	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	31.37	■■■□□ 2.61
PQLC1-208	ENST00000494607	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PQLC1-208	ENST00000494607	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		30.64	■■■□□ 2.5
PQLC1-208	ENST00000494607	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	30.58	■■■□□ 2.49
PQLC1-208	ENST00000494607	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		30.41	■■■□□ 2.46
PQLC1-208	ENST00000494607	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		30.21	■■■□□ 2.43
PQLC1-208	ENST00000494607	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.14	■■■□□ 2.42
PQLC1-208	ENST00000494607	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.12	■■■□□ 2.41
PQLC1-208	ENST00000494607	SMARCA2	P51531	1590 aa		29.94	■■■□□ 2.38
PQLC1-208	ENST00000494607	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		29.92	■■■□□ 2.38
PQLC1-208	ENST00000494607	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		29.9	■■■□□ 2.38
PQLC1-208	ENST00000494607	NCAPD3	P42695	1498 aa		29.9	■■■□□ 2.38
PQLC1-208	ENST00000494607	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		29.85	■■■□□ 2.37
PQLC1-208	ENST00000494607	HMGXB3	Q12766	1538 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PQLC1-208	ENST00000494607	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
PQLC1-208	ENST00000494607	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.62	■■■□□ 2.33
PQLC1-208	ENST00000494607	WIZ	O95785	1651 aa		29.58	■■■□□ 2.33
PQLC1-208	ENST00000494607	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.34	■■■□□ 2.29
PQLC1-208	ENST00000494607	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PQLC1-208	ENST00000494607	NES	P48681	1621 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PQLC1-208	ENST00000494607	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PQLC1-208	ENST00000494607	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PQLC1-208	ENST00000494607	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PQLC1-208	ENST00000494607	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
PQLC1-208	ENST00000494607	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PQLC1-208	ENST00000494607	CFTR	P13569	1480 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PQLC1-208	ENST00000494607	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		28.77	■■■□□ 2.2
PQLC1-208	ENST00000494607	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		28.7	■■■□□ 2.18
PQLC1-208	ENST00000494607	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.69	■■■□□ 2.18
PQLC1-208	ENST00000494607	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	28.67	■■■□□ 2.18
PQLC1-208	ENST00000494607	CUX2	O14529	1486 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PQLC1-208	ENST00000494607	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		28.67	■■■□□ 2.18
PQLC1-208	ENST00000494607	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		28.6	■■■□□ 2.17
PQLC1-208	ENST00000494607	WDR62	O43379	1518 aa		28.51	■■■□□ 2.15
PQLC1-208	ENST00000494607	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
PQLC1-208	ENST00000494607	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.31	■■■□□ 2.12
PQLC1-208	ENST00000494607	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.25	■■■□□ 2.11
PQLC1-208	ENST00000494607	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.24	■■■□□ 2.11
PQLC1-208	ENST00000494607	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.08	■■■□□ 2.09
PQLC1-208	ENST00000494607	CUX1	P39880	1505 aa		28.05	■■■□□ 2.08
PQLC1-208	ENST00000494607	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.02	■■■□□ 2.08
PQLC1-208	ENST00000494607	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PQLC1-208	ENST00000494607	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.96	■■■□□ 2.07
PQLC1-208	ENST00000494607	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PQLC1-208	ENST00000494607	SOGA1	O94964	1423 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PQLC1-208	ENST00000494607	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PQLC1-208	ENST00000494607	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PQLC1-208	ENST00000494607	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PQLC1-208	ENST00000494607	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PQLC1-208	ENST00000494607	SYNJ1	O43426	1573 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PQLC1-208	ENST00000494607	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PQLC1-208	ENST00000494607	WDR97	A6NE52	1622 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PQLC1-208	ENST00000494607	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	27.73	■■■□□ 2.03
PQLC1-208	ENST00000494607	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PQLC1-208	ENST00000494607	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PQLC1-208	ENST00000494607	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PQLC1-208	ENST00000494607	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PQLC1-208	ENST00000494607	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PQLC1-208	ENST00000494607	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PQLC1-208	ENST00000494607	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.52	■■■□□ 2
PQLC1-208	ENST00000494607	PBRM1	Q86U86	1689 aa		27.52	■■■□□ 2
PQLC1-208	ENST00000494607	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		27.51	■■■□□ 2
PQLC1-208	ENST00000494607	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		27.47	■■□□□ 1.99
PQLC1-208	ENST00000494607	CHD1	O14646	1710 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PQLC1-208	ENST00000494607	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.41	■■□□□ 1.98
PQLC1-208	ENST00000494607	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.4	■■□□□ 1.98
PQLC1-208	ENST00000494607	FBLN2	P98095	1184 aa		27.39	■■□□□ 1.98
PQLC1-208	ENST00000494607	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PQLC1-208	ENST00000494607	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.36	■■□□□ 1.97
PQLC1-208	ENST00000494607	TRIM41	Q8WV44	630 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PQLC1-208	ENST00000494607	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PQLC1-208	ENST00000494607	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.29	■■□□□ 1.96
PQLC1-208	ENST00000494607	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.22	■■□□□ 1.95
PQLC1-208	ENST00000494607	IGF1R	P08069	1367 aa		27.2	■■□□□ 1.94
PQLC1-208	ENST00000494607	CUL7	Q14999	1698 aa		27.19	■■□□□ 1.94
PQLC1-208	ENST00000494607	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.14	■■□□□ 1.94
PQLC1-208	ENST00000494607	NUP160	Q12769	1436 aa		27.09	■■□□□ 1.93
PQLC1-208	ENST00000494607	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		27.06	■■□□□ 1.92
PQLC1-208	ENST00000494607	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27.06	■■□□□ 1.92
PQLC1-208	ENST00000494607	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.05	■■□□□ 1.92
PQLC1-208	ENST00000494607	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		27.05	■■□□□ 1.92
PQLC1-208	ENST00000494607	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.03	■■□□□ 1.92
PQLC1-208	ENST00000494607	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		27	■■□□□ 1.91
PQLC1-208	ENST00000494607	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		27	■■□□□ 1.91
PQLC1-208	ENST00000494607	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		27	■■□□□ 1.91
PQLC1-208	ENST00000494607	EEA1	Q15075	1411 aa		26.97	■■□□□ 1.91
PQLC1-208	ENST00000494607	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		26.93	■■□□□ 1.9
PQLC1-208	ENST00000494607	SHROOM2	Q13796	1616 aa		26.88	■■□□□ 1.89

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