RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494526.1

FBXO18-215, Transcript of F-box DNA helicase 1, humanhuman

TSL 2

Gene FBXO18, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18-215ENST00000494526 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.2■■■□□ 2.74
FBXO18-215ENST00000494526 ABCC9O60706 1549 aa28.95■■■□□ 2.23
FBXO18-215ENST00000494526 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.75■■■□□ 2.19
FBXO18-215ENST00000494526 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.56■■■□□ 2
FBXO18-215ENST00000494526 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.48■■□□□ 1.99
FBXO18-215ENST00000494526 NACADO15069 1562 aa27.26■■□□□ 1.96
FBXO18-215ENST00000494526 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.13■■□□□ 1.93
FBXO18-215ENST00000494526 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.07■■□□□ 1.92
FBXO18-215ENST00000494526 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.83■■□□□ 1.89
FBXO18-215ENST00000494526 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.67■■□□□ 1.86
FBXO18-215ENST00000494526 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
FBXO18-215ENST00000494526 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.58■■□□□ 1.85
FBXO18-215ENST00000494526 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.51■■□□□ 1.83
FBXO18-215ENST00000494526 SCRIBQ14160 1630 aa26.35■■□□□ 1.81
FBXO18-215ENST00000494526 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.22■■□□□ 1.79
FBXO18-215ENST00000494526 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.04■■□□□ 1.76
FBXO18-215ENST00000494526 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.04■■□□□ 1.76
FBXO18-215ENST00000494526 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
FBXO18-215ENST00000494526 NCAPD3P42695 1498 aa25.21■■□□□ 1.63
FBXO18-215ENST00000494526 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.15■■□□□ 1.62
FBXO18-215ENST00000494526 SMARCA4P51532 1647 aa25.07■■□□□ 1.6
FBXO18-215ENST00000494526 SMARCA2P51531 1590 aa25.06■■□□□ 1.6
FBXO18-215ENST00000494526 ERCC6Q03468 1493 aa25.04■■□□□ 1.6
FBXO18-215ENST00000494526 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
FBXO18-215ENST00000494526 HMGXB3Q12766 1538 aa24.96■■□□□ 1.59
FBXO18-215ENST00000494526 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
FBXO18-215ENST00000494526 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.9■■□□□ 1.58
FBXO18-215ENST00000494526 CUX2O14529 1486 aa24.84■■□□□ 1.57
FBXO18-215ENST00000494526 NESP48681 1621 aa24.83■■□□□ 1.57
FBXO18-215ENST00000494526 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.83■■□□□ 1.57
FBXO18-215ENST00000494526 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.76■■□□□ 1.55
FBXO18-215ENST00000494526 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.59■■□□□ 1.53
FBXO18-215ENST00000494526 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.58■■□□□ 1.53
FBXO18-215ENST00000494526 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.52■■□□□ 1.52
FBXO18-215ENST00000494526 WIZO95785 1651 aa24.51■■□□□ 1.51
FBXO18-215ENST00000494526 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
FBXO18-215ENST00000494526 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.4■■□□□ 1.5
FBXO18-215ENST00000494526 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
FBXO18-215ENST00000494526 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.3■■□□□ 1.48
FBXO18-215ENST00000494526 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.23■■□□□ 1.47
FBXO18-215ENST00000494526 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.22■■□□□ 1.47
FBXO18-215ENST00000494526 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
FBXO18-215ENST00000494526 CFTRP13569 1480 aa24.17■■□□□ 1.46
FBXO18-215ENST00000494526 WDR62O43379 1518 aa24.15■■□□□ 1.46
FBXO18-215ENST00000494526 CCDC88BA6NC98 1476 aa24■■□□□ 1.43
FBXO18-215ENST00000494526 TRIM41Q8WV44 630 aa23.99■■□□□ 1.43
FBXO18-215ENST00000494526 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
FBXO18-215ENST00000494526 OSCARQ8IYS5 282 aa23.91■■□□□ 1.42
FBXO18-215ENST00000494526 PRDM2Q13029 1718 aa23.75■■□□□ 1.39
FBXO18-215ENST00000494526 IFT140Q96RY7 1462 aa23.74■■□□□ 1.39
FBXO18-215ENST00000494526 TOPBP1Q92547 1522 aa23.73■■□□□ 1.39
FBXO18-215ENST00000494526 ABCC8Q09428 1581 aa23.7■■□□□ 1.38
FBXO18-215ENST00000494526 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
FBXO18-215ENST00000494526 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.61■■□□□ 1.37
FBXO18-215ENST00000494526 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
FBXO18-215ENST00000494526 FBLN2P98095 1184 aa23.58■■□□□ 1.37
FBXO18-215ENST00000494526 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.365e-7■■■■■ 37.7
FBXO18-215ENST00000494526 SOGA1O94964 1423 aa23.49■■□□□ 1.35
FBXO18-215ENST00000494526 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
FBXO18-215ENST00000494526 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
FBXO18-215ENST00000494526 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
FBXO18-215ENST00000494526 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.46■■□□□ 1.35
FBXO18-215ENST00000494526 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
FBXO18-215ENST00000494526 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.38■■□□□ 1.33
FBXO18-215ENST00000494526 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.38■■□□□ 1.33
FBXO18-215ENST00000494526 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.38■■□□□ 1.33
FBXO18-215ENST00000494526 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.38■■□□□ 1.33
FBXO18-215ENST00000494526 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.36■■□□□ 1.33
FBXO18-215ENST00000494526 ARHGEF11O15085 1522 aa23.35■■□□□ 1.33
FBXO18-215ENST00000494526 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
FBXO18-215ENST00000494526 CUX1P39880 1505 aa23.31■■□□□ 1.32
FBXO18-215ENST00000494526 CHD1O14646 1710 aa23.28■■□□□ 1.32
FBXO18-215ENST00000494526 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.26■■□□□ 1.31
FBXO18-215ENST00000494526 GRIN2BQ13224 1484 aa23.22■■□□□ 1.31
FBXO18-215ENST00000494526 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
FBXO18-215ENST00000494526 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
FBXO18-215ENST00000494526 WDR97A6NE52 1622 aa23.16■■□□□ 1.3
FBXO18-215ENST00000494526 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.15■■□□□ 1.3
FBXO18-215ENST00000494526 SYNJ2O15056 1496 aa23.11■■□□□ 1.29
FBXO18-215ENST00000494526 ARAP1Q96P48 1450 aa23.11■■□□□ 1.29
FBXO18-215ENST00000494526 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
FBXO18-215ENST00000494526 SYNJ1O43426 1573 aa23.09■■□□□ 1.29
FBXO18-215ENST00000494526 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.07■■□□□ 1.28
FBXO18-215ENST00000494526 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.02■■□□□ 1.28
FBXO18-215ENST00000494526 PBRM1Q86U86 1689 aa22.99■■□□□ 1.27
FBXO18-215ENST00000494526 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.94■■□□□ 1.26
FBXO18-215ENST00000494526 TOP2BQ02880 1626 aa22.92■■□□□ 1.26
FBXO18-215ENST00000494526 GRIN2AQ12879 1464 aa22.89■■□□□ 1.25
FBXO18-215ENST00000494526 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.87■■□□□ 1.25
FBXO18-215ENST00000494526 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.85■■□□□ 1.25
FBXO18-215ENST00000494526 ADAMTS12P58397 1594 aa22.8■■□□□ 1.24
FBXO18-215ENST00000494526 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
FBXO18-215ENST00000494526 NUP160Q12769 1436 aa22.77■■□□□ 1.24
FBXO18-215ENST00000494526 CEP170Q5SW79 1584 aa22.75■■□□□ 1.23
FBXO18-215ENST00000494526 JPH4Q96JJ6 628 aa22.72■■□□□ 1.23
FBXO18-215ENST00000494526 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.72■■□□□ 1.23
FBXO18-215ENST00000494526 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
FBXO18-215ENST00000494526 KIF27Q86VH2 1401 aa22.61■■□□□ 1.21
FBXO18-215ENST00000494526 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
FBXO18-215ENST00000494526 IGF1RP08069 1367 aa22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.1 ms