RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.44■■■■■ 5.18
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.29■■■■■ 4.36
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ABCC9O60706 1549 aa42.03■■■■■ 4.32
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.13■■■■■ 4.01
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.1■■■■■ 4.01
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NACADO15069 1562 aa39.95■■■■□ 3.99
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.5■■■■□ 3.91
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.37■■■■□ 3.89
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.29■■■■□ 3.88
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.16■■■■□ 3.86
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.11■■■■□ 3.85
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.09■■■■□ 3.85
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.9■■■■□ 3.82
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SCRIBQ14160 1630 aa38.65■■■■□ 3.78
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.41■■■■□ 3.74
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.94■■■■□ 3.66
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.92■■■■□ 3.66
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.81■■■■□ 3.64
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NCAPD3P42695 1498 aa36.91■■■■□ 3.5
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SMARCA4P51532 1647 aa36.88■■■■□ 3.49
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.86■■■■□ 3.49
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SMARCA2P51531 1590 aa36.76■■■■□ 3.48
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HMGXB3Q12766 1538 aa36.61■■■■□ 3.45
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.57■■■■□ 3.44
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.49■■■■□ 3.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ERCC6Q03468 1493 aa36.28■■■■□ 3.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NESP48681 1621 aa36.2■■■■□ 3.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WIZO95785 1651 aa36.13■■■■□ 3.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CUX2O14529 1486 aa35.99■■■■□ 3.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.98■■■■□ 3.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.86■■■■□ 3.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.83■■■■□ 3.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.67■■■■□ 3.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.59■■■■□ 3.29
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CFTRP13569 1480 aa35.48■■■■□ 3.27
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.46■■■■□ 3.27
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.41■■■■□ 3.26
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.41■■■■□ 3.26
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.35■■■■□ 3.25
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WDR62O43379 1518 aa35.3■■■■□ 3.24
HOXB-AS3-215ENST00000494420 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.21
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRDM2Q13029 1718 aa35.03■■■■□ 3.2
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TOPBP1Q92547 1522 aa34.77■■■■□ 3.16
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ABCC8Q09428 1581 aa34.75■■■■□ 3.15
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IFT140Q96RY7 1462 aa34.69■■■■□ 3.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.66■■■■□ 3.14
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OSCARQ8IYS5 282 aa34.57■■■■□ 3.12
HOXB-AS3-215ENST00000494420 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.1
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.38■■■■□ 3.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SOGA1O94964 1423 aa34.38■■■■□ 3.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.35■■■■□ 3.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CUX1P39880 1505 aa34.32■■■■□ 3.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.3■■■■□ 3.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRIM41Q8WV44 630 aa34.28■■■■□ 3.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FBLN2P98095 1184 aa34.18■■■■□ 3.06
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WDR97A6NE52 1622 aa34.04■■■■□ 3.04
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CHD1O14646 1710 aa34.01■■■■□ 3.03
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34■■■■□ 3.03
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GRIN2BQ13224 1484 aa33.98■■■■□ 3.03
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.97■■■■□ 3.03
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.96■■■■□ 3.03
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.93■■■■□ 3.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.93■■■■□ 3.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.91■■■■□ 3.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.91■■■■□ 3.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.91■■■■□ 3.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.91■■■■□ 3.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARHGEF11O15085 1522 aa33.87■■■■□ 3.01
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TOP2BQ02880 1626 aa33.86■■■■□ 3.01
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SYNJ1O43426 1573 aa33.84■■■■□ 3.01
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.82■■■■□ 3.01
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SYNJ2O15056 1496 aa33.8■■■■□ 3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PBRM1Q86U86 1689 aa33.77■■■■□ 3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.77■■■■□ 3
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.75■■■□□ 2.99
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.64■■■□□ 2.98
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARAP1Q96P48 1450 aa33.57■■■□□ 2.97
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GRIN2AQ12879 1464 aa33.52■■■□□ 2.96
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.52■■■□□ 2.96
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ADAMTS12P58397 1594 aa33.51■■■□□ 2.95
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.49■■■□□ 2.95
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NUP160Q12769 1436 aa33.38■■■□□ 2.93
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CEP170Q5SW79 1584 aa33.34■■■□□ 2.93
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KIF27Q86VH2 1401 aa33.3■■■□□ 2.92
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IGF1RP08069 1367 aa33.25■■■□□ 2.91
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.18■■■□□ 2.9
HOXB-AS3-215ENST00000494420 JPH4Q96JJ6 628 aa33.17■■■□□ 2.9
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SHROOM2Q13796 1616 aa33.13■■■□□ 2.89
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
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